Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DJJ4

Protein Details
Accession B0DJJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-110VQSIFQQYKRKKQSRSHRIRHVHPDPTHydrophilic
338-366ELVKAAFKKRRAAKKVKATTARKEKKDVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
342-363AAFKKRRAAKKVKATTARKEKK
Subcellular Location(s) cyto 8, E.R. 7, cyto_nucl 6.833, mito_nucl 3.666, nucl 3.5, extr 3, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_329884  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00856  SET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
Amino Acid Sequences MGGGNKSEVTSVLCILIVFCQLTHNRPSHIDTDLEETVGMEVDSGPQPHIHWGQIKTQEYELAEHLSTAHLASKEVVDVDSWLVQSIFQQYKRKKQSRSHRIRHVHPDPTFKLDLDKAKAIQVIFEEKKSMLVRCSVADAVKFGQEMATAINVVSPDLVKTHERQKTIEWCSIAYGNLICNPGWGVQLKIKTFKDDDTHGFSIRATRDLVAEEMLYPLIGLLASDSTAEHSHLSELRPHLSQVQEQAETEKPRVLIGPLRFINHACNSFNAKFIPINSTLSFVVCTTKAIKSGQEVFVNYGEKYFEDLGQCPCRDCKGESSEDVRSEDATSPLATKSELVKAAFKKRRAAKKVKATTARKEKKDVDGRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.1
6 0.09
7 0.14
8 0.17
9 0.21
10 0.27
11 0.29
12 0.3
13 0.33
14 0.37
15 0.34
16 0.34
17 0.32
18 0.27
19 0.31
20 0.28
21 0.25
22 0.21
23 0.18
24 0.16
25 0.14
26 0.12
27 0.06
28 0.05
29 0.08
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.18
36 0.21
37 0.22
38 0.26
39 0.28
40 0.35
41 0.43
42 0.46
43 0.42
44 0.41
45 0.4
46 0.35
47 0.34
48 0.28
49 0.23
50 0.19
51 0.17
52 0.16
53 0.13
54 0.12
55 0.11
56 0.13
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.11
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.1
73 0.16
74 0.2
75 0.24
76 0.33
77 0.39
78 0.5
79 0.61
80 0.67
81 0.69
82 0.74
83 0.8
84 0.82
85 0.87
86 0.87
87 0.86
88 0.86
89 0.85
90 0.86
91 0.82
92 0.8
93 0.72
94 0.71
95 0.62
96 0.6
97 0.53
98 0.43
99 0.39
100 0.34
101 0.35
102 0.31
103 0.31
104 0.26
105 0.26
106 0.28
107 0.25
108 0.21
109 0.18
110 0.22
111 0.21
112 0.2
113 0.2
114 0.18
115 0.23
116 0.23
117 0.23
118 0.16
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.2
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.07
146 0.08
147 0.1
148 0.19
149 0.24
150 0.25
151 0.26
152 0.31
153 0.38
154 0.41
155 0.41
156 0.33
157 0.29
158 0.29
159 0.28
160 0.23
161 0.15
162 0.11
163 0.08
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.1
174 0.14
175 0.15
176 0.21
177 0.2
178 0.22
179 0.23
180 0.24
181 0.23
182 0.23
183 0.25
184 0.26
185 0.28
186 0.26
187 0.25
188 0.22
189 0.24
190 0.21
191 0.2
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.02
208 0.02
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.14
222 0.16
223 0.17
224 0.17
225 0.18
226 0.19
227 0.19
228 0.2
229 0.21
230 0.23
231 0.21
232 0.21
233 0.23
234 0.25
235 0.26
236 0.25
237 0.22
238 0.18
239 0.18
240 0.19
241 0.18
242 0.19
243 0.19
244 0.26
245 0.26
246 0.27
247 0.28
248 0.28
249 0.31
250 0.29
251 0.3
252 0.23
253 0.24
254 0.3
255 0.3
256 0.31
257 0.26
258 0.24
259 0.22
260 0.22
261 0.24
262 0.19
263 0.23
264 0.21
265 0.23
266 0.21
267 0.2
268 0.2
269 0.15
270 0.16
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.15
275 0.17
276 0.18
277 0.19
278 0.22
279 0.28
280 0.31
281 0.31
282 0.31
283 0.31
284 0.33
285 0.33
286 0.27
287 0.22
288 0.18
289 0.15
290 0.18
291 0.16
292 0.15
293 0.16
294 0.19
295 0.25
296 0.31
297 0.31
298 0.3
299 0.31
300 0.32
301 0.33
302 0.33
303 0.34
304 0.34
305 0.39
306 0.42
307 0.45
308 0.47
309 0.46
310 0.45
311 0.38
312 0.32
313 0.29
314 0.26
315 0.22
316 0.18
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.13
322 0.14
323 0.16
324 0.2
325 0.23
326 0.24
327 0.3
328 0.37
329 0.47
330 0.53
331 0.55
332 0.58
333 0.64
334 0.73
335 0.76
336 0.8
337 0.79
338 0.83
339 0.88
340 0.89
341 0.9
342 0.87
343 0.88
344 0.88
345 0.88
346 0.83
347 0.81
348 0.77
349 0.77