Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DCT1

Protein Details
Accession S3DCT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
613-640DIESVQKQMPRKTKRRRKLDDDSYEEYIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
623-630RKTKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 10.5, cyto_mito 8, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG glz:GLAREA_11244  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
Amino Acid Sequences MESARGPPRVKNKAASAIQISAEQLLREAVDRQEPGLQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKEFEAYVQRNRINMNNWMRYAQWELEQKEFKRARSIFERALDVDSTSVTLWIRYIEAEMKSRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYCYMEEMLGNVPGTRQVFERWMAWEPDEAAWSSYIKLEKRYGEFQRARDIFQRFTMVHPEPRNWIKWARFEEEYGTTDLVREVFGNAIEALGDDFMDERLFIAYARYEAKLKEYERARAIYKYALDRLARSKSIGLHKAYTTFEKQFGNREGVEDVILSKRRVQYEEQVKENPKNYDAWFDYARLEEVSGDFDRVRDVYERAIAQIPPTQEKRHWRRYIYLWVFYAIWEEMESKDISRAKQIYQECLKLIPHKKFTFAKIWLMKAQFEIRQQQLQAARKTLGQAIGMCPKDKLFKGYIELELKLFEFVRCRTLYEKHIEWNPSNCQAWIKFAELERGLDDLERARAIFELAIAQTVLDMPELLWKAYIDFEEEEGEYERTRALYERLLEKTGHVKVWISYAHFEINVPEDDEEEEEEEREVSEGAKVRARKIFERALDTMKDQDLKEERVSLLNAWLSFERTHGSADDIESVQKQMPRKTKRRRKLDDDSYEEYIDYVFPADDQQTQSLSNLLAKAAAWRQAGGTLTGPAGGGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.63
3 0.57
4 0.51
5 0.47
6 0.41
7 0.35
8 0.28
9 0.25
10 0.19
11 0.15
12 0.13
13 0.12
14 0.13
15 0.15
16 0.14
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.29
24 0.28
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.28
31 0.26
32 0.3
33 0.26
34 0.27
35 0.25
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.34
42 0.35
43 0.35
44 0.38
45 0.42
46 0.44
47 0.5
48 0.55
49 0.57
50 0.63
51 0.68
52 0.71
53 0.69
54 0.64
55 0.61
56 0.57
57 0.5
58 0.5
59 0.5
60 0.49
61 0.48
62 0.47
63 0.45
64 0.43
65 0.43
66 0.35
67 0.32
68 0.33
69 0.35
70 0.41
71 0.48
72 0.46
73 0.51
74 0.53
75 0.48
76 0.51
77 0.49
78 0.49
79 0.49
80 0.55
81 0.51
82 0.51
83 0.52
84 0.43
85 0.45
86 0.38
87 0.3
88 0.23
89 0.17
90 0.15
91 0.11
92 0.11
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.1
100 0.13
101 0.16
102 0.21
103 0.22
104 0.24
105 0.27
106 0.28
107 0.35
108 0.38
109 0.4
110 0.41
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.35
117 0.31
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.27
129 0.34
130 0.33
131 0.35
132 0.36
133 0.37
134 0.37
135 0.33
136 0.3
137 0.22
138 0.22
139 0.21
140 0.19
141 0.18
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.16
150 0.18
151 0.19
152 0.19
153 0.22
154 0.22
155 0.22
156 0.21
157 0.2
158 0.19
159 0.19
160 0.16
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.12
166 0.16
167 0.16
168 0.19
169 0.23
170 0.27
171 0.31
172 0.39
173 0.4
174 0.47
175 0.51
176 0.49
177 0.55
178 0.51
179 0.5
180 0.48
181 0.47
182 0.38
183 0.35
184 0.37
185 0.27
186 0.28
187 0.33
188 0.29
189 0.32
190 0.33
191 0.33
192 0.35
193 0.38
194 0.39
195 0.35
196 0.39
197 0.36
198 0.41
199 0.44
200 0.43
201 0.4
202 0.39
203 0.39
204 0.35
205 0.33
206 0.27
207 0.22
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.12
212 0.09
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.14
242 0.19
243 0.2
244 0.25
245 0.26
246 0.31
247 0.32
248 0.35
249 0.33
250 0.29
251 0.3
252 0.26
253 0.26
254 0.23
255 0.22
256 0.24
257 0.22
258 0.23
259 0.26
260 0.27
261 0.25
262 0.23
263 0.23
264 0.24
265 0.3
266 0.33
267 0.3
268 0.29
269 0.29
270 0.31
271 0.3
272 0.29
273 0.26
274 0.22
275 0.23
276 0.23
277 0.23
278 0.26
279 0.27
280 0.27
281 0.23
282 0.23
283 0.2
284 0.18
285 0.17
286 0.12
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.15
292 0.18
293 0.19
294 0.22
295 0.23
296 0.28
297 0.37
298 0.41
299 0.41
300 0.43
301 0.44
302 0.46
303 0.47
304 0.39
305 0.3
306 0.28
307 0.25
308 0.26
309 0.24
310 0.24
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.17
316 0.12
317 0.1
318 0.07
319 0.07
320 0.09
321 0.08
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.08
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.18
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.52
349 0.56
350 0.62
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.08
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.11
367 0.14
368 0.13
369 0.18
370 0.19
371 0.19
372 0.26
373 0.27
374 0.3
375 0.31
376 0.32
377 0.28
378 0.28
379 0.28
380 0.3
381 0.35
382 0.34
383 0.39
384 0.38
385 0.43
386 0.44
387 0.47
388 0.46
389 0.42
390 0.44
391 0.4
392 0.41
393 0.4
394 0.38
395 0.35
396 0.3
397 0.3
398 0.25
399 0.24
400 0.27
401 0.25
402 0.27
403 0.26
404 0.28
405 0.32
406 0.35
407 0.34
408 0.31
409 0.29
410 0.28
411 0.29
412 0.27
413 0.21
414 0.16
415 0.15
416 0.15
417 0.21
418 0.22
419 0.21
420 0.19
421 0.19
422 0.22
423 0.21
424 0.22
425 0.18
426 0.19
427 0.23
428 0.25
429 0.29
430 0.27
431 0.27
432 0.24
433 0.22
434 0.2
435 0.17
436 0.15
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.16
441 0.16
442 0.18
443 0.2
444 0.24
445 0.29
446 0.32
447 0.33
448 0.32
449 0.37
450 0.4
451 0.39
452 0.4
453 0.38
454 0.37
455 0.36
456 0.32
457 0.3
458 0.26
459 0.28
460 0.25
461 0.23
462 0.21
463 0.21
464 0.26
465 0.24
466 0.24
467 0.2
468 0.18
469 0.16
470 0.14
471 0.14
472 0.09
473 0.1
474 0.1
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.08
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.12
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.15
516 0.19
517 0.24
518 0.26
519 0.28
520 0.28
521 0.28
522 0.33
523 0.31
524 0.28
525 0.23
526 0.22
527 0.2
528 0.24
529 0.25
530 0.2
531 0.19
532 0.2
533 0.2
534 0.19
535 0.19
536 0.16
537 0.17
538 0.15
539 0.15
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.14
544 0.14
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.1
550 0.09
551 0.09
552 0.08
553 0.07
554 0.1
555 0.14
556 0.16
557 0.21
558 0.22
559 0.27
560 0.32
561 0.36
562 0.37
563 0.4
564 0.45
565 0.45
566 0.49
567 0.48
568 0.48
569 0.46
570 0.43
571 0.4
572 0.35
573 0.35
574 0.28
575 0.33
576 0.33
577 0.35
578 0.34
579 0.34
580 0.32
581 0.31
582 0.32
583 0.25
584 0.24
585 0.23
586 0.22
587 0.21
588 0.21
589 0.2
590 0.19
591 0.19
592 0.17
593 0.15
594 0.17
595 0.15
596 0.17
597 0.16
598 0.17
599 0.19
600 0.18
601 0.19
602 0.18
603 0.19
604 0.2
605 0.21
606 0.26
607 0.31
608 0.4
609 0.49
610 0.59
611 0.69
612 0.77
613 0.84
614 0.9
615 0.92
616 0.91
617 0.92
618 0.92
619 0.91
620 0.88
621 0.83
622 0.76
623 0.66
624 0.56
625 0.45
626 0.34
627 0.24
628 0.16
629 0.11
630 0.07
631 0.07
632 0.09
633 0.11
634 0.14
635 0.17
636 0.18
637 0.19
638 0.2
639 0.2
640 0.2
641 0.19
642 0.18
643 0.16
644 0.15
645 0.14
646 0.13
647 0.18
648 0.2
649 0.25
650 0.23
651 0.23
652 0.23
653 0.26
654 0.27
655 0.23
656 0.21
657 0.16
658 0.16
659 0.16