Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DIG2

Protein Details
Accession S3DIG2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-62AGTPRRSEQPPMKKQKKTVDADHydrophilic
288-308LKSIEKHRKEQQESDDRKRKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-187QAVKRAKIPPPPPKTKIK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 12, cyto 10, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG glz:GLAREA_11873  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00035  dsrm  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
Amino Acid Sequences MDDQAEQAPSVKSELPSRVPTQSMDDFMKDTGPMDSGRDGAGTPRRSEQPPMKKQKKTVDADVLAAEEEAVKSMGDTNWIGKLNEYRSAHPPAEGLTYHETAVPGNPPRFTCAVTLRETPIRFNQTASVTFSNKKHAKHYASKRAVDWLIGNGFMPKDGSVKFPKVAPPQAVKRAKIPPPPPKTKIKHELPNPPPTSTNLPIQAKTPPEDEEGGKVKFTTMVPELAQRLGFDPPQYELSKVIPDGPLWNGYAHFGGDPRIDGPIGEVKSVYGMKNAKEAIATEVVKFLKSIEKHRKEQQESDDRKRKRESVGDSVHEDLETQAAKSLKGENGSASD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.33
3 0.37
4 0.4
5 0.41
6 0.4
7 0.39
8 0.4
9 0.38
10 0.36
11 0.33
12 0.31
13 0.29
14 0.27
15 0.27
16 0.2
17 0.18
18 0.14
19 0.13
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.17
28 0.24
29 0.25
30 0.26
31 0.31
32 0.36
33 0.38
34 0.46
35 0.5
36 0.53
37 0.61
38 0.7
39 0.74
40 0.76
41 0.81
42 0.83
43 0.83
44 0.78
45 0.76
46 0.74
47 0.66
48 0.61
49 0.53
50 0.43
51 0.33
52 0.26
53 0.18
54 0.09
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.07
61 0.07
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.16
66 0.18
67 0.18
68 0.17
69 0.23
70 0.22
71 0.3
72 0.31
73 0.29
74 0.33
75 0.38
76 0.37
77 0.32
78 0.3
79 0.23
80 0.24
81 0.21
82 0.19
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.19
87 0.17
88 0.14
89 0.16
90 0.17
91 0.18
92 0.19
93 0.2
94 0.2
95 0.23
96 0.24
97 0.24
98 0.23
99 0.23
100 0.26
101 0.27
102 0.29
103 0.28
104 0.32
105 0.31
106 0.31
107 0.31
108 0.33
109 0.29
110 0.28
111 0.29
112 0.26
113 0.28
114 0.3
115 0.27
116 0.24
117 0.28
118 0.28
119 0.34
120 0.35
121 0.35
122 0.36
123 0.4
124 0.45
125 0.51
126 0.6
127 0.61
128 0.64
129 0.64
130 0.6
131 0.57
132 0.5
133 0.41
134 0.31
135 0.22
136 0.16
137 0.14
138 0.14
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.05
144 0.07
145 0.07
146 0.11
147 0.14
148 0.16
149 0.17
150 0.18
151 0.24
152 0.26
153 0.29
154 0.28
155 0.3
156 0.33
157 0.42
158 0.45
159 0.4
160 0.41
161 0.45
162 0.47
163 0.5
164 0.53
165 0.54
166 0.58
167 0.65
168 0.64
169 0.67
170 0.67
171 0.68
172 0.69
173 0.66
174 0.66
175 0.65
176 0.71
177 0.67
178 0.71
179 0.65
180 0.57
181 0.5
182 0.45
183 0.44
184 0.36
185 0.34
186 0.31
187 0.31
188 0.3
189 0.3
190 0.31
191 0.26
192 0.26
193 0.24
194 0.18
195 0.19
196 0.2
197 0.19
198 0.2
199 0.23
200 0.21
201 0.2
202 0.18
203 0.16
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.14
209 0.15
210 0.18
211 0.19
212 0.17
213 0.17
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.17
222 0.18
223 0.17
224 0.16
225 0.17
226 0.19
227 0.18
228 0.18
229 0.14
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.11
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.1
248 0.09
249 0.12
250 0.16
251 0.16
252 0.16
253 0.15
254 0.14
255 0.17
256 0.19
257 0.17
258 0.17
259 0.19
260 0.2
261 0.25
262 0.25
263 0.23
264 0.21
265 0.22
266 0.2
267 0.23
268 0.23
269 0.18
270 0.23
271 0.23
272 0.22
273 0.21
274 0.18
275 0.2
276 0.22
277 0.32
278 0.39
279 0.47
280 0.54
281 0.63
282 0.72
283 0.71
284 0.76
285 0.76
286 0.76
287 0.76
288 0.81
289 0.82
290 0.76
291 0.77
292 0.76
293 0.71
294 0.69
295 0.69
296 0.66
297 0.66
298 0.71
299 0.68
300 0.64
301 0.61
302 0.53
303 0.43
304 0.36
305 0.25
306 0.21
307 0.17
308 0.13
309 0.15
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.22
314 0.22
315 0.24
316 0.25