Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DGR5

Protein Details
Accession S3DGR5    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-33EGASKKSSKIHTKKSVLSDETHydrophilic
125-150IIEAVTQKPEKKRKRARQEEDLEGKYHydrophilic
480-501FQNKNSKRPSSKPQIYNPKTPAHydrophilic
571-597DLKMGGKGKGKKKPTGRAAKRTSAWKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
132-141KPEKKRKRAR
170-173RLKR
564-606AKNGRPKDLKMGGKGKGKKKPTGRAAKRTSAWKSGGSKKGGKD
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG glz:GLAREA_05652  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKRSKQTEDGVEGASKKSSKIHTKKSVLSDETAVDPSLALLFASSSGPVQAPPKSRYQEPPPTRKRVPSESEDEEEDESEDGGEADGHNGDLSSIDEDLEDANISGLSEDEEEAVEEEPKLDKIIEAVTQKPEKKRKRARQEEDLEGKYMAKLAREEEKEEEERQAERRLKRQKIVAKKDASEDEDEDMEDASDAQSADEAASDDDDTSEDDANASGRAPPPDVPVHESLAPSKESSELEKATRTVFLANVSTEAISSKSAKKTLMAHMGSFLDSLPDPPEGKPAHKVESLRFRSTAYAGGGGLPKKAAFVKKDLMGATTKSTNAYVVYSTAYAAREAVKRLNGTMVLDRHLRVDGVAHPAKTDHRRCVFVGNLGFVDDESLLDQGGETERKRSKIPSDIEEGLWRQFGKAGTVESVRVVRDEKTRVGKGFAYVQFEDANAVEAALLFNEKKYPPMLPRVLRVVRAKAVRKTALASQQFQNKNSKRPSSKPQIYNPKTPAEEASLHGRAGKLLGRAGAAQLKKGKLTGANDMVMGKRGDGAKSIEGIAKTPEAIVFEGYRASAKNGRPKDLKMGGKGKGKKKPTGRAAKRTSAWKSGGSKKGGKDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.27
4 0.23
5 0.27
6 0.33
7 0.41
8 0.5
9 0.59
10 0.65
11 0.72
12 0.79
13 0.81
14 0.81
15 0.73
16 0.66
17 0.58
18 0.49
19 0.45
20 0.39
21 0.3
22 0.21
23 0.17
24 0.14
25 0.12
26 0.1
27 0.06
28 0.05
29 0.05
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.06
34 0.08
35 0.08
36 0.1
37 0.14
38 0.19
39 0.25
40 0.28
41 0.37
42 0.4
43 0.46
44 0.52
45 0.58
46 0.63
47 0.66
48 0.74
49 0.75
50 0.79
51 0.8
52 0.8
53 0.78
54 0.76
55 0.73
56 0.69
57 0.68
58 0.65
59 0.62
60 0.56
61 0.5
62 0.42
63 0.35
64 0.29
65 0.21
66 0.15
67 0.12
68 0.09
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.11
113 0.14
114 0.16
115 0.19
116 0.25
117 0.31
118 0.36
119 0.45
120 0.53
121 0.58
122 0.67
123 0.75
124 0.79
125 0.84
126 0.9
127 0.9
128 0.9
129 0.88
130 0.87
131 0.83
132 0.74
133 0.64
134 0.53
135 0.45
136 0.34
137 0.3
138 0.21
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.23
143 0.25
144 0.28
145 0.28
146 0.33
147 0.34
148 0.34
149 0.34
150 0.28
151 0.28
152 0.28
153 0.33
154 0.35
155 0.36
156 0.44
157 0.51
158 0.56
159 0.59
160 0.65
161 0.65
162 0.69
163 0.74
164 0.74
165 0.69
166 0.65
167 0.64
168 0.59
169 0.53
170 0.45
171 0.37
172 0.29
173 0.24
174 0.22
175 0.17
176 0.14
177 0.11
178 0.08
179 0.06
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.15
210 0.18
211 0.19
212 0.21
213 0.21
214 0.22
215 0.23
216 0.22
217 0.2
218 0.19
219 0.18
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.15
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.18
229 0.19
230 0.17
231 0.17
232 0.15
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.09
246 0.13
247 0.15
248 0.17
249 0.17
250 0.19
251 0.23
252 0.27
253 0.33
254 0.3
255 0.27
256 0.27
257 0.28
258 0.25
259 0.21
260 0.16
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.15
269 0.15
270 0.17
271 0.22
272 0.23
273 0.25
274 0.27
275 0.28
276 0.27
277 0.37
278 0.41
279 0.36
280 0.35
281 0.32
282 0.3
283 0.29
284 0.27
285 0.17
286 0.13
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.11
296 0.13
297 0.12
298 0.16
299 0.19
300 0.2
301 0.23
302 0.22
303 0.21
304 0.19
305 0.18
306 0.17
307 0.15
308 0.13
309 0.11
310 0.12
311 0.11
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.16
331 0.14
332 0.14
333 0.17
334 0.15
335 0.15
336 0.16
337 0.16
338 0.16
339 0.15
340 0.14
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.17
345 0.18
346 0.17
347 0.17
348 0.18
349 0.23
350 0.3
351 0.33
352 0.33
353 0.35
354 0.38
355 0.38
356 0.42
357 0.38
358 0.35
359 0.31
360 0.24
361 0.21
362 0.19
363 0.18
364 0.13
365 0.12
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.06
375 0.09
376 0.09
377 0.16
378 0.19
379 0.21
380 0.23
381 0.26
382 0.3
383 0.36
384 0.4
385 0.37
386 0.4
387 0.4
388 0.4
389 0.39
390 0.35
391 0.27
392 0.24
393 0.2
394 0.14
395 0.15
396 0.14
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.15
402 0.15
403 0.14
404 0.15
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.14
409 0.19
410 0.22
411 0.26
412 0.32
413 0.35
414 0.35
415 0.37
416 0.35
417 0.31
418 0.36
419 0.33
420 0.32
421 0.28
422 0.29
423 0.26
424 0.25
425 0.24
426 0.15
427 0.15
428 0.09
429 0.08
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.05
436 0.06
437 0.09
438 0.1
439 0.11
440 0.13
441 0.17
442 0.2
443 0.29
444 0.37
445 0.36
446 0.4
447 0.48
448 0.48
449 0.5
450 0.5
451 0.46
452 0.44
453 0.49
454 0.51
455 0.48
456 0.52
457 0.49
458 0.46
459 0.44
460 0.44
461 0.45
462 0.44
463 0.42
464 0.4
465 0.47
466 0.5
467 0.5
468 0.55
469 0.5
470 0.55
471 0.59
472 0.64
473 0.62
474 0.65
475 0.72
476 0.73
477 0.78
478 0.77
479 0.79
480 0.81
481 0.79
482 0.81
483 0.75
484 0.71
485 0.62
486 0.56
487 0.48
488 0.41
489 0.38
490 0.31
491 0.34
492 0.29
493 0.27
494 0.27
495 0.25
496 0.2
497 0.2
498 0.21
499 0.15
500 0.15
501 0.16
502 0.16
503 0.16
504 0.18
505 0.23
506 0.2
507 0.23
508 0.27
509 0.28
510 0.28
511 0.29
512 0.29
513 0.28
514 0.31
515 0.35
516 0.34
517 0.33
518 0.32
519 0.33
520 0.31
521 0.29
522 0.25
523 0.17
524 0.16
525 0.17
526 0.17
527 0.18
528 0.21
529 0.2
530 0.21
531 0.23
532 0.23
533 0.21
534 0.22
535 0.21
536 0.18
537 0.17
538 0.16
539 0.15
540 0.13
541 0.14
542 0.15
543 0.13
544 0.13
545 0.13
546 0.13
547 0.14
548 0.13
549 0.17
550 0.22
551 0.27
552 0.37
553 0.42
554 0.5
555 0.53
556 0.56
557 0.61
558 0.63
559 0.63
560 0.62
561 0.65
562 0.64
563 0.69
564 0.74
565 0.73
566 0.73
567 0.74
568 0.75
569 0.77
570 0.8
571 0.81
572 0.84
573 0.85
574 0.86
575 0.87
576 0.87
577 0.83
578 0.82
579 0.78
580 0.74
581 0.67
582 0.64
583 0.64
584 0.65
585 0.67
586 0.64
587 0.65