Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CKH6

Protein Details
Accession S3CKH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-268IDQHEKLKRYRREQKTVEQATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
325-329KKKKE
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR003395  RecF/RecN/SMC_N  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
KEGG glz:GLAREA_01621  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02463  SMC_N  
Amino Acid Sequences MLQTSGSRRTRSEIEDADDSDSMRRTRNSTPDINSAKRARTNGYHASQSTSNPPSHQPRSRTQDDGVEDEDSEDDGEHTDPEAFQPGAIVRVKVANFVTYEKAEFFPGPNLNMVIGPNGTGKSSLVCAICLGLGFSPKILGRGESFAEFVKHGASSAEIEIELYKKPEEPRNRVVRVRLTREGNSKDWWIDGKKSSPGAVNSLVKSNNIQIDNLCQFLPQDKVSHFSRMSAVELLLQTQRAAAPEEMIDQHEKLKRYRREQKTVEQATEADRERLTGLESRQENLRAEVQRLEERNQVIEKIDVLKKTIPFVDYSNARKEHLEFKKKKEASQKRFRQLELEVNPTLKAAEKKRAYQAKIATAVKARHKAVEQAEGDAQRVASKMEAIDDQLSTAISSIEAERSAFKARRQEIQALQRKIRELQAKFDNEKPVEFDPQEWNEKIQAKRREVRDKNTEIEELRSRVEALREQATENRNRQAEKEQQLAALDTREGQQMNKLEAVSTETHKAWKWVQEHQDEFEKEVYGPPLITCSVKDPRYTSVIESLLQPDDFLAITAQTDNDFNKLNRQLLGKPMSLAFVPLRKADGAVQRHPDIPSSELQRYGLDGYALDFIDGPETVLSMLTSAKSLHKAAVALNELNEEQYNTILATKKIVSFAAGRNNYTVRRRAEYGDAAVSTATKGVQAARYWVDRPVDVSARRELQTEIDTLQQEWETLRAPAGEIKESVKRLQAEAKTAEEEAAKLTKEKGAIQSARSVLLALPNKIKRDEEELEAKMSYITEFQASVKRNLNQQDGFVMKKCEAALQYRDQVVKIRQCHQELLEAEIRYIEAKSDADSLEAKTESIRQHVEDERQQVIQLEREAQRVKERAKNALAACNEIAASVENAEYYAEQVERGLTVEGLEREIVAEEAKLEFIHATNPNAIRDFERRQLEVDKMKDKIGEADEKLEKLNRKITQTRSIWEPALDSLIREISDAFSYNFEQIGCAGEVSVAKSEDFNDWAIEIKVKFRENETLQILDAHRQSGGERSVSTIFYLLALQSLARAPFRVVDEINQGMDPRNERMVHERMVEIACREHTSQYFLITPKLLTGLRYDKRMKVLCIASGEHMPDDYKQLDINKIIGIRRAIMAAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.47
3 0.46
4 0.44
5 0.39
6 0.34
7 0.29
8 0.29
9 0.25
10 0.26
11 0.27
12 0.29
13 0.36
14 0.45
15 0.49
16 0.53
17 0.57
18 0.62
19 0.67
20 0.66
21 0.67
22 0.63
23 0.62
24 0.6
25 0.58
26 0.54
27 0.52
28 0.56
29 0.57
30 0.56
31 0.56
32 0.51
33 0.53
34 0.49
35 0.46
36 0.46
37 0.41
38 0.38
39 0.34
40 0.42
41 0.46
42 0.53
43 0.59
44 0.57
45 0.62
46 0.69
47 0.72
48 0.69
49 0.62
50 0.6
51 0.56
52 0.53
53 0.46
54 0.38
55 0.33
56 0.28
57 0.26
58 0.18
59 0.15
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.14
70 0.13
71 0.12
72 0.14
73 0.13
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.15
78 0.21
79 0.21
80 0.23
81 0.23
82 0.2
83 0.21
84 0.23
85 0.26
86 0.22
87 0.24
88 0.22
89 0.22
90 0.22
91 0.22
92 0.21
93 0.23
94 0.25
95 0.24
96 0.24
97 0.24
98 0.22
99 0.22
100 0.2
101 0.15
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.16
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.08
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.12
124 0.12
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.15
129 0.18
130 0.2
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.19
135 0.17
136 0.15
137 0.14
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.15
153 0.21
154 0.3
155 0.39
156 0.46
157 0.54
158 0.63
159 0.69
160 0.69
161 0.71
162 0.72
163 0.71
164 0.71
165 0.68
166 0.64
167 0.63
168 0.67
169 0.66
170 0.59
171 0.53
172 0.48
173 0.41
174 0.38
175 0.37
176 0.32
177 0.32
178 0.34
179 0.34
180 0.36
181 0.37
182 0.37
183 0.36
184 0.34
185 0.33
186 0.35
187 0.35
188 0.32
189 0.35
190 0.33
191 0.29
192 0.29
193 0.29
194 0.28
195 0.25
196 0.24
197 0.2
198 0.27
199 0.27
200 0.27
201 0.23
202 0.17
203 0.16
204 0.18
205 0.21
206 0.16
207 0.18
208 0.17
209 0.22
210 0.24
211 0.3
212 0.28
213 0.26
214 0.28
215 0.26
216 0.27
217 0.24
218 0.22
219 0.18
220 0.18
221 0.18
222 0.16
223 0.15
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.1
228 0.13
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.14
233 0.14
234 0.15
235 0.16
236 0.14
237 0.2
238 0.23
239 0.25
240 0.29
241 0.39
242 0.45
243 0.54
244 0.64
245 0.68
246 0.74
247 0.78
248 0.81
249 0.82
250 0.79
251 0.7
252 0.61
253 0.52
254 0.45
255 0.44
256 0.36
257 0.27
258 0.21
259 0.2
260 0.19
261 0.19
262 0.17
263 0.16
264 0.16
265 0.21
266 0.22
267 0.23
268 0.26
269 0.29
270 0.27
271 0.26
272 0.31
273 0.26
274 0.27
275 0.29
276 0.29
277 0.32
278 0.34
279 0.34
280 0.32
281 0.31
282 0.32
283 0.3
284 0.27
285 0.22
286 0.2
287 0.18
288 0.2
289 0.22
290 0.19
291 0.21
292 0.24
293 0.24
294 0.25
295 0.26
296 0.21
297 0.19
298 0.21
299 0.24
300 0.26
301 0.29
302 0.34
303 0.33
304 0.34
305 0.33
306 0.34
307 0.38
308 0.43
309 0.5
310 0.49
311 0.55
312 0.65
313 0.65
314 0.69
315 0.7
316 0.71
317 0.7
318 0.75
319 0.77
320 0.76
321 0.79
322 0.74
323 0.67
324 0.59
325 0.58
326 0.51
327 0.47
328 0.38
329 0.34
330 0.33
331 0.29
332 0.25
333 0.19
334 0.21
335 0.2
336 0.28
337 0.31
338 0.35
339 0.44
340 0.52
341 0.51
342 0.52
343 0.52
344 0.49
345 0.53
346 0.49
347 0.43
348 0.4
349 0.42
350 0.42
351 0.44
352 0.38
353 0.34
354 0.34
355 0.38
356 0.35
357 0.39
358 0.33
359 0.29
360 0.32
361 0.29
362 0.29
363 0.23
364 0.2
365 0.12
366 0.12
367 0.1
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.05
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.09
390 0.15
391 0.17
392 0.19
393 0.27
394 0.29
395 0.36
396 0.38
397 0.43
398 0.44
399 0.52
400 0.58
401 0.55
402 0.55
403 0.51
404 0.49
405 0.45
406 0.44
407 0.42
408 0.34
409 0.36
410 0.41
411 0.44
412 0.45
413 0.47
414 0.48
415 0.4
416 0.39
417 0.36
418 0.3
419 0.29
420 0.26
421 0.24
422 0.23
423 0.26
424 0.3
425 0.27
426 0.26
427 0.26
428 0.32
429 0.34
430 0.37
431 0.42
432 0.44
433 0.5
434 0.57
435 0.64
436 0.63
437 0.67
438 0.68
439 0.64
440 0.61
441 0.57
442 0.51
443 0.41
444 0.39
445 0.34
446 0.26
447 0.23
448 0.2
449 0.18
450 0.16
451 0.17
452 0.16
453 0.15
454 0.17
455 0.17
456 0.18
457 0.23
458 0.26
459 0.3
460 0.31
461 0.33
462 0.31
463 0.31
464 0.32
465 0.35
466 0.39
467 0.37
468 0.38
469 0.34
470 0.32
471 0.32
472 0.31
473 0.24
474 0.16
475 0.11
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.12
482 0.14
483 0.15
484 0.16
485 0.15
486 0.13
487 0.13
488 0.16
489 0.13
490 0.13
491 0.14
492 0.13
493 0.15
494 0.15
495 0.17
496 0.16
497 0.21
498 0.22
499 0.27
500 0.33
501 0.37
502 0.38
503 0.38
504 0.43
505 0.36
506 0.35
507 0.29
508 0.23
509 0.17
510 0.17
511 0.16
512 0.1
513 0.09
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.11
520 0.17
521 0.19
522 0.2
523 0.2
524 0.22
525 0.25
526 0.25
527 0.22
528 0.2
529 0.19
530 0.18
531 0.17
532 0.17
533 0.14
534 0.13
535 0.12
536 0.08
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.04
541 0.03
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.05
547 0.05
548 0.07
549 0.09
550 0.09
551 0.15
552 0.17
553 0.17
554 0.19
555 0.21
556 0.2
557 0.25
558 0.28
559 0.23
560 0.21
561 0.2
562 0.19
563 0.16
564 0.17
565 0.11
566 0.1
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.11
572 0.14
573 0.2
574 0.22
575 0.24
576 0.27
577 0.28
578 0.29
579 0.29
580 0.27
581 0.21
582 0.18
583 0.18
584 0.19
585 0.19
586 0.17
587 0.18
588 0.17
589 0.16
590 0.15
591 0.12
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.08
596 0.08
597 0.07
598 0.06
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.05
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.03
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.05
613 0.07
614 0.09
615 0.1
616 0.1
617 0.1
618 0.11
619 0.11
620 0.14
621 0.15
622 0.13
623 0.13
624 0.13
625 0.12
626 0.12
627 0.11
628 0.08
629 0.06
630 0.05
631 0.06
632 0.05
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.1
637 0.11
638 0.11
639 0.12
640 0.12
641 0.12
642 0.13
643 0.16
644 0.23
645 0.24
646 0.23
647 0.24
648 0.26
649 0.29
650 0.3
651 0.33
652 0.27
653 0.29
654 0.3
655 0.31
656 0.33
657 0.31
658 0.29
659 0.24
660 0.21
661 0.18
662 0.16
663 0.13
664 0.09
665 0.08
666 0.06
667 0.04
668 0.04
669 0.06
670 0.09
671 0.09
672 0.11
673 0.13
674 0.15
675 0.16
676 0.19
677 0.19
678 0.16
679 0.18
680 0.18
681 0.21
682 0.21
683 0.23
684 0.23
685 0.25
686 0.26
687 0.25
688 0.22
689 0.2
690 0.19
691 0.18
692 0.15
693 0.15
694 0.15
695 0.14
696 0.15
697 0.12
698 0.11
699 0.1
700 0.1
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.07
705 0.07
706 0.1
707 0.11
708 0.11
709 0.11
710 0.14
711 0.18
712 0.19
713 0.2
714 0.21
715 0.21
716 0.21
717 0.28
718 0.27
719 0.27
720 0.28
721 0.28
722 0.25
723 0.24
724 0.24
725 0.17
726 0.15
727 0.12
728 0.12
729 0.1
730 0.1
731 0.11
732 0.12
733 0.13
734 0.15
735 0.18
736 0.23
737 0.25
738 0.26
739 0.3
740 0.29
741 0.28
742 0.26
743 0.22
744 0.14
745 0.19
746 0.21
747 0.18
748 0.24
749 0.26
750 0.28
751 0.3
752 0.3
753 0.26
754 0.3
755 0.31
756 0.28
757 0.32
758 0.31
759 0.31
760 0.3
761 0.28
762 0.2
763 0.18
764 0.13
765 0.08
766 0.08
767 0.07
768 0.07
769 0.09
770 0.15
771 0.17
772 0.21
773 0.26
774 0.27
775 0.32
776 0.36
777 0.41
778 0.36
779 0.34
780 0.34
781 0.31
782 0.31
783 0.27
784 0.25
785 0.19
786 0.2
787 0.19
788 0.18
789 0.18
790 0.21
791 0.23
792 0.26
793 0.29
794 0.31
795 0.31
796 0.29
797 0.32
798 0.33
799 0.36
800 0.35
801 0.39
802 0.42
803 0.44
804 0.46
805 0.42
806 0.42
807 0.36
808 0.37
809 0.35
810 0.29
811 0.27
812 0.24
813 0.23
814 0.17
815 0.16
816 0.11
817 0.07
818 0.07
819 0.08
820 0.11
821 0.1
822 0.11
823 0.12
824 0.13
825 0.14
826 0.14
827 0.13
828 0.11
829 0.16
830 0.16
831 0.19
832 0.2
833 0.18
834 0.23
835 0.28
836 0.33
837 0.33
838 0.36
839 0.34
840 0.33
841 0.32
842 0.3
843 0.27
844 0.24
845 0.21
846 0.22
847 0.22
848 0.27
849 0.29
850 0.28
851 0.33
852 0.36
853 0.4
854 0.41
855 0.43
856 0.45
857 0.46
858 0.51
859 0.45
860 0.46
861 0.41
862 0.37
863 0.34
864 0.27
865 0.24
866 0.17
867 0.16
868 0.1
869 0.09
870 0.06
871 0.06
872 0.06
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.07
878 0.07
879 0.07
880 0.07
881 0.07
882 0.07
883 0.08
884 0.08
885 0.06
886 0.07
887 0.1
888 0.1
889 0.11
890 0.11
891 0.09
892 0.09
893 0.1
894 0.1
895 0.07
896 0.06
897 0.06
898 0.07
899 0.07
900 0.06
901 0.07
902 0.07
903 0.07
904 0.13
905 0.14
906 0.16
907 0.21
908 0.23
909 0.25
910 0.26
911 0.27
912 0.25
913 0.29
914 0.32
915 0.34
916 0.37
917 0.36
918 0.38
919 0.41
920 0.43
921 0.44
922 0.46
923 0.44
924 0.4
925 0.41
926 0.39
927 0.36
928 0.35
929 0.32
930 0.32
931 0.28
932 0.33
933 0.34
934 0.33
935 0.35
936 0.35
937 0.35
938 0.32
939 0.4
940 0.37
941 0.43
942 0.5
943 0.55
944 0.59
945 0.58
946 0.57
947 0.55
948 0.54
949 0.47
950 0.4
951 0.35
952 0.26
953 0.27
954 0.23
955 0.18
956 0.16
957 0.16
958 0.15
959 0.14
960 0.13
961 0.11
962 0.12
963 0.13
964 0.12
965 0.13
966 0.15
967 0.15
968 0.16
969 0.14
970 0.13
971 0.11
972 0.14
973 0.12
974 0.1
975 0.09
976 0.09
977 0.1
978 0.11
979 0.14
980 0.11
981 0.11
982 0.12
983 0.13
984 0.14
985 0.15
986 0.15
987 0.13
988 0.12
989 0.14
990 0.14
991 0.17
992 0.15
993 0.19
994 0.24
995 0.26
996 0.27
997 0.29
998 0.37
999 0.37
1000 0.44
1001 0.43
1002 0.38
1003 0.36
1004 0.39
1005 0.36
1006 0.33
1007 0.3
1008 0.23
1009 0.2
1010 0.19
1011 0.19
1012 0.21
1013 0.23
1014 0.19
1015 0.19
1016 0.22
1017 0.24
1018 0.24
1019 0.23
1020 0.18
1021 0.15
1022 0.13
1023 0.14
1024 0.1
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.07
1028 0.08
1029 0.11
1030 0.12
1031 0.12
1032 0.13
1033 0.13
1034 0.17
1035 0.2
1036 0.23
1037 0.21
1038 0.23
1039 0.28
1040 0.29
1041 0.29
1042 0.26
1043 0.24
1044 0.22
1045 0.26
1046 0.25
1047 0.23
1048 0.28
1049 0.28
1050 0.3
1051 0.36
1052 0.38
1053 0.38
1054 0.37
1055 0.34
1056 0.31
1057 0.33
1058 0.32
1059 0.26
1060 0.25
1061 0.23
1062 0.24
1063 0.25
1064 0.26
1065 0.26
1066 0.3
1067 0.29
1068 0.28
1069 0.31
1070 0.29
1071 0.3
1072 0.27
1073 0.26
1074 0.21
1075 0.24
1076 0.22
1077 0.18
1078 0.24
1079 0.31
1080 0.33
1081 0.41
1082 0.45
1083 0.46
1084 0.55
1085 0.59
1086 0.55
1087 0.53
1088 0.52
1089 0.48
1090 0.47
1091 0.44
1092 0.38
1093 0.37
1094 0.36
1095 0.28
1096 0.25
1097 0.22
1098 0.19
1099 0.22
1100 0.2
1101 0.17
1102 0.19
1103 0.22
1104 0.26
1105 0.27
1106 0.27
1107 0.26
1108 0.3
1109 0.31
1110 0.32
1111 0.31
1112 0.27
1113 0.27