FuNGI

S3D566

Protein Details

Accession

S3D566

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
409-434	KVKPPTSPELKKRRDSKKHEVKPVLQ	Basic
497-523	SLYNPQKSSKPESKKSKQDKKAADAAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-23	KAARGPRAARGARGRGRGRP
93-166	SRGRGGAVGQRGKPAVESKFKPRAIRRDAGERERIRKEEMDKQAALEKEAEAEAARIARGLGRGRGRGGRGRGD
418-426	LKKRRDSKK
506-532	KPESKKSKQDKKAADAAASPSKSGKPI

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	glz:GLAREA_06620 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAARGPRAARGARGRGRGRPAAEAESSAPVIKSEEPDTHSLHEHTPSEAADPPSTTPQNVSPNSSPATVPTETPAPTPVRVAPPRAESSSRGRGGAVGQRGKPAVESKFKPRAIRRDAGERERIRKEEMDKQAALEKEAEAEAARIARGLGRGRGRGGRGRGDRLDRAVSSRNTNSASGLFGVAPEELARRTEGFSASRIGGGAGGGGGGGGGGGGGSGPSGTRIKSEGGGLAGLSGGSGGQNPFMYGANFVPEYDDDDDETERIDIDSMNDKWKLDRDGFAITGSRTREAGDGKMSNMDLMLPIRLSRIHHETKKAYINIPDDADLDVKQEEADGMEIDEEKSTNIPDGNESLPVKSESAMEEEVEPEEVPPPASIPSSPESKRKVARQIKPDIPSSPEAQFSDKVKPPTSPELKKRRDSKKHEVKPVLQTEEDTAEYERHLDEMEHLAKELGGVRARTRLDTDGDELMENEEEAFELDGKLFLFQFPPVLPSLYNPQKSSKPESKKSKQDKKAADAAASPSKSGKPIKVKNEPETEERIEHEVEVEEETKLVEQEGWIGKMVVRKSGKVELAWGGTSMIVHAGTAGDFLSTAVMVDGRERPTSLFRENEASEGSAVGMGKVFGKYVVVPDWEKLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.67
3	0.7
4	0.68
5	0.65
6	0.71
7	0.7
8	0.63
9	0.6
10	0.57
11	0.52
12	0.48
13	0.43
14	0.37
15	0.33
16	0.31
17	0.26
18	0.21
19	0.16
20	0.18
21	0.17
22	0.19
23	0.19
24	0.23
25	0.26
26	0.29
27	0.32
28	0.32
29	0.34
30	0.32
31	0.32
32	0.32
33	0.3
34	0.28
35	0.27
36	0.24
37	0.23
38	0.26
39	0.26
40	0.22
41	0.23
42	0.24
43	0.3
44	0.31
45	0.29
46	0.26
47	0.3
48	0.37
49	0.38
50	0.42
51	0.37
52	0.4
53	0.42
54	0.41
55	0.34
56	0.27
57	0.31
58	0.25
59	0.23
60	0.21
61	0.23
62	0.22
63	0.23
64	0.25
65	0.23
66	0.23
67	0.25
68	0.26
69	0.32
70	0.35
71	0.38
72	0.38
73	0.41
74	0.45
75	0.47
76	0.45
77	0.4
78	0.45
79	0.5
80	0.47
81	0.41
82	0.37
83	0.33
84	0.35
85	0.37
86	0.38
87	0.34
88	0.34
89	0.37
90	0.37
91	0.36
92	0.34
93	0.33
94	0.31
95	0.34
96	0.37
97	0.43
98	0.52
99	0.56
100	0.62
101	0.65
102	0.68
103	0.67
104	0.7
105	0.65
106	0.66
107	0.7
108	0.69
109	0.7
110	0.66
111	0.65
112	0.65
113	0.62
114	0.56
115	0.53
116	0.52
117	0.51
118	0.54
119	0.53
120	0.47
121	0.46
122	0.48
123	0.43
124	0.39
125	0.3
126	0.22
127	0.16
128	0.16
129	0.15
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.07
136	0.07
137	0.08
138	0.11
139	0.14
140	0.19
141	0.23
142	0.25
143	0.28
144	0.32
145	0.34
146	0.37
147	0.39
148	0.42
149	0.42
150	0.47
151	0.49
152	0.5
153	0.49
154	0.46
155	0.45
156	0.37
157	0.36
158	0.37
159	0.34
160	0.34
161	0.33
162	0.33
163	0.32
164	0.32
165	0.29
166	0.23
167	0.21
168	0.16
169	0.15
170	0.11
171	0.09
172	0.09
173	0.08
174	0.07
175	0.06
176	0.07
177	0.06
178	0.07
179	0.09
180	0.09
181	0.1
182	0.12
183	0.14
184	0.14
185	0.15
186	0.16
187	0.16
188	0.15
189	0.14
190	0.12
191	0.1
192	0.08
193	0.07
194	0.04
195	0.03
196	0.03
197	0.02
198	0.02
199	0.02
200	0.02
201	0.01
202	0.01
203	0.01
204	0.01
205	0.01
206	0.01
207	0.02
208	0.02
209	0.02
210	0.05
211	0.06
212	0.06
213	0.07
214	0.09
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.09
222	0.08
223	0.06
224	0.05
225	0.04
226	0.03
227	0.02
228	0.02
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.07
236	0.07
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.08
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.11
248	0.12
249	0.12
250	0.11
251	0.11
252	0.08
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.11
259	0.12
260	0.15
261	0.16
262	0.16
263	0.17
264	0.2
265	0.21
266	0.17
267	0.18
268	0.17
269	0.19
270	0.19
271	0.19
272	0.17
273	0.14
274	0.16
275	0.15
276	0.13
277	0.11
278	0.12
279	0.13
280	0.13
281	0.14
282	0.15
283	0.15
284	0.15
285	0.16
286	0.15
287	0.12
288	0.11
289	0.1
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.04
294	0.05
295	0.05
296	0.07
297	0.08
298	0.11
299	0.17
300	0.23
301	0.26
302	0.31
303	0.32
304	0.36
305	0.41
306	0.39
307	0.34
308	0.32
309	0.31
310	0.28
311	0.27
312	0.23
313	0.17
314	0.17
315	0.15
316	0.11
317	0.09
318	0.08
319	0.07
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.04
324	0.04
325	0.03
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.09
340	0.1
341	0.13
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.13
346	0.12
347	0.11
348	0.11
349	0.08
350	0.11
351	0.11
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.1
356	0.09
357	0.08
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.09
368	0.11
369	0.17
370	0.19
371	0.25
372	0.29
373	0.34
374	0.39
375	0.42
376	0.51
377	0.54
378	0.6
379	0.62
380	0.66
381	0.67
382	0.66
383	0.62
384	0.53
385	0.47
386	0.42
387	0.36
388	0.29
389	0.25
390	0.23
391	0.23
392	0.24
393	0.23
394	0.28
395	0.29
396	0.31
397	0.3
398	0.31
399	0.33
400	0.4
401	0.46
402	0.47
403	0.53
404	0.6
405	0.66
406	0.72
407	0.77
408	0.79
409	0.81
410	0.82
411	0.83
412	0.84
413	0.85
414	0.87
415	0.84
416	0.79
417	0.78
418	0.75
419	0.67
420	0.56
421	0.47
422	0.39
423	0.34
424	0.29
425	0.21
426	0.15
427	0.12
428	0.12
429	0.12
430	0.1
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.08
435	0.14
436	0.16
437	0.15
438	0.15
439	0.15
440	0.14
441	0.15
442	0.15
443	0.13
444	0.13
445	0.14
446	0.15
447	0.2
448	0.21
449	0.22
450	0.22
451	0.21
452	0.21
453	0.23
454	0.24
455	0.21
456	0.21
457	0.2
458	0.17
459	0.16
460	0.13
461	0.11
462	0.08
463	0.06
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.09
478	0.09
479	0.11
480	0.11
481	0.12
482	0.11
483	0.13
484	0.22
485	0.28
486	0.32
487	0.32
488	0.36
489	0.41
490	0.46
491	0.53
492	0.54
493	0.55
494	0.61
495	0.71
496	0.76
497	0.8
498	0.86
499	0.88
500	0.88
501	0.88
502	0.86
503	0.82
504	0.81
505	0.72
506	0.63
507	0.55
508	0.51
509	0.49
510	0.41
511	0.34
512	0.28
513	0.27
514	0.31
515	0.32
516	0.34
517	0.37
518	0.46
519	0.55
520	0.63
521	0.69
522	0.72
523	0.76
524	0.73
525	0.67
526	0.65
527	0.59
528	0.51
529	0.45
530	0.4
531	0.32
532	0.28
533	0.24
534	0.18
535	0.15
536	0.16
537	0.14
538	0.11
539	0.11
540	0.11
541	0.1
542	0.1
543	0.09
544	0.07
545	0.06
546	0.13
547	0.16
548	0.17
549	0.16
550	0.17
551	0.18
552	0.23
553	0.24
554	0.26
555	0.26
556	0.27
557	0.31
558	0.37
559	0.38
560	0.34
561	0.37
562	0.32
563	0.32
564	0.3
565	0.26
566	0.19
567	0.17
568	0.16
569	0.12
570	0.1
571	0.07
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.06
586	0.06
587	0.09
588	0.14
589	0.16
590	0.18
591	0.19
592	0.21
593	0.27
594	0.32
595	0.35
596	0.34
597	0.34
598	0.39
599	0.39
600	0.39
601	0.35
602	0.31
603	0.25
604	0.21
605	0.19
606	0.14
607	0.13
608	0.11
609	0.1
610	0.09
611	0.1
612	0.1
613	0.1
614	0.09
615	0.1
616	0.11
617	0.14
618	0.17
619	0.2
620	0.21

S3D566

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer