Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DUF6

Protein Details
Accession S3DUF6    Localization Confidence High Confidence Score 23.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
362-389QELTDKERLRKKRERRRENEKKQKEIIRBasic
718-749ALNARPIKKVREAKDRKKFHAAQRLEKLRKKSBasic
765-791SSIMKLMSKAAKKKPKQQVKVVVARGGHydrophilic
809-828VDARLKKDVRGEKRAAKKRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-23KHGKGRLDKWYKLAKEKG
368-385ERLRKKRERRRENEKKQK
488-491AKKA
708-748GAAAIKEKLRALNARPIKKVREAKDRKKFHAAQRLEKLRKK
771-828MSKAAKKKPKQQVKVVVARGGNRGIAGRPRGVKGKYKIVDARLKKDVRGEKRAAKKRK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
KEGG glz:GLAREA_11296  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MGIQKKHGKGRLDKWYKLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYGFLEKSKVLLDLCAAPGSWCQVAAEAMPVSSLIVGVDLSPIKPIPRVITFQSDITTDKCRATIRSHFKTWKADTVLHDGAPNVGTAWVQDSFNQAELALQAMKLATEFLAEGGTFVTKVFRSKDYNSLLWVFNQLFTKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCQGFKAPKRIDPKFLDPRSVFAELSDPTPNNEAKVFNPEIKKRKRDGYEDGNMTQYKEVPASEFIQTTDPIAILGSLNKLSFDQPPNGDVALAALDKLPETTQEIRDCCKDLRVLGRKEFRNLLKWRLKVREKFGFATKKSVKEAEEEVAEVESMDEELKIAERLQELTDKERLRKKRERRRENEKKQKEIIRMQLHMTAPTEIGLEQSGPNGDNSMFGLKAVDKSGAADKIAKGKMAILKASDSRQDHDSGLGSDGEEESDEEQDRLDRELDSMYEQYQDKKSSIDAKFRAKKARKEHEDGDWEGFTADKEGSDDDEELEEDSDDSSDDETPSKGPLLTDLQGVDNKAGGLSRRAAQFFDQDIFKDIGGIPEEKVESEDELEEGEEEISADLDALEIARQDAPGIEPDSDSDVPEAEEAESSDEEGFEVVKSKANPWDDEPRKDGRLDIDIITAEAMTLAQAIASGSKTTADLIDENFTKHSLKDRDGLPDWFLDDEGKHDKPHRPITAAGAAAIKEKLRALNARPIKKVREAKDRKKFHAAQRLEKLRKKSALLQDEEGMTEKEKASSIMKLMSKAAKKKPKQQVKVVVARGGNRGIAGRPRGVKGKYKIVDARLKKDVRGEKRAAKKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.75
3 0.73
4 0.72
5 0.71
6 0.7
7 0.71
8 0.77
9 0.79
10 0.77
11 0.78
12 0.73
13 0.74
14 0.67
15 0.65
16 0.59
17 0.55
18 0.57
19 0.57
20 0.62
21 0.57
22 0.6
23 0.55
24 0.54
25 0.51
26 0.47
27 0.47
28 0.42
29 0.46
30 0.43
31 0.44
32 0.41
33 0.42
34 0.35
35 0.29
36 0.26
37 0.23
38 0.21
39 0.18
40 0.16
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.16
45 0.13
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.14
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.17
70 0.19
71 0.23
72 0.27
73 0.29
74 0.36
75 0.37
76 0.36
77 0.35
78 0.31
79 0.29
80 0.27
81 0.29
82 0.23
83 0.22
84 0.24
85 0.25
86 0.27
87 0.32
88 0.4
89 0.45
90 0.5
91 0.58
92 0.62
93 0.65
94 0.71
95 0.68
96 0.66
97 0.6
98 0.57
99 0.52
100 0.54
101 0.51
102 0.42
103 0.38
104 0.3
105 0.27
106 0.22
107 0.18
108 0.1
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.14
117 0.15
118 0.17
119 0.16
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.1
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.12
145 0.15
146 0.2
147 0.25
148 0.29
149 0.38
150 0.41
151 0.41
152 0.41
153 0.42
154 0.38
155 0.33
156 0.33
157 0.25
158 0.22
159 0.23
160 0.2
161 0.17
162 0.18
163 0.2
164 0.17
165 0.19
166 0.22
167 0.27
168 0.34
169 0.36
170 0.4
171 0.44
172 0.49
173 0.5
174 0.47
175 0.47
176 0.4
177 0.38
178 0.35
179 0.28
180 0.22
181 0.19
182 0.17
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.14
187 0.16
188 0.24
189 0.25
190 0.31
191 0.41
192 0.45
193 0.51
194 0.52
195 0.59
196 0.61
197 0.61
198 0.63
199 0.54
200 0.53
201 0.5
202 0.46
203 0.36
204 0.25
205 0.27
206 0.19
207 0.22
208 0.22
209 0.17
210 0.16
211 0.2
212 0.2
213 0.18
214 0.19
215 0.18
216 0.15
217 0.23
218 0.23
219 0.26
220 0.32
221 0.39
222 0.48
223 0.55
224 0.62
225 0.59
226 0.66
227 0.67
228 0.67
229 0.67
230 0.66
231 0.66
232 0.62
233 0.58
234 0.54
235 0.48
236 0.42
237 0.34
238 0.26
239 0.18
240 0.15
241 0.14
242 0.11
243 0.13
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.15
250 0.14
251 0.12
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.15
265 0.17
266 0.19
267 0.19
268 0.2
269 0.21
270 0.2
271 0.19
272 0.13
273 0.11
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.09
284 0.13
285 0.17
286 0.21
287 0.23
288 0.25
289 0.27
290 0.29
291 0.25
292 0.24
293 0.21
294 0.19
295 0.28
296 0.35
297 0.37
298 0.42
299 0.5
300 0.49
301 0.51
302 0.54
303 0.47
304 0.47
305 0.46
306 0.48
307 0.48
308 0.51
309 0.54
310 0.57
311 0.63
312 0.6
313 0.64
314 0.63
315 0.59
316 0.57
317 0.58
318 0.57
319 0.5
320 0.54
321 0.51
322 0.46
323 0.44
324 0.44
325 0.37
326 0.31
327 0.33
328 0.25
329 0.21
330 0.18
331 0.16
332 0.13
333 0.12
334 0.09
335 0.06
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.12
350 0.13
351 0.16
352 0.22
353 0.22
354 0.27
355 0.34
356 0.4
357 0.45
358 0.54
359 0.62
360 0.67
361 0.77
362 0.82
363 0.84
364 0.88
365 0.91
366 0.92
367 0.93
368 0.9
369 0.85
370 0.81
371 0.78
372 0.73
373 0.68
374 0.65
375 0.59
376 0.52
377 0.47
378 0.44
379 0.38
380 0.33
381 0.28
382 0.19
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.06
408 0.07
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.11
414 0.17
415 0.18
416 0.17
417 0.14
418 0.16
419 0.19
420 0.19
421 0.19
422 0.13
423 0.14
424 0.16
425 0.17
426 0.2
427 0.17
428 0.18
429 0.19
430 0.2
431 0.19
432 0.18
433 0.17
434 0.13
435 0.13
436 0.11
437 0.09
438 0.07
439 0.07
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.11
460 0.11
461 0.14
462 0.17
463 0.18
464 0.16
465 0.16
466 0.18
467 0.25
468 0.27
469 0.33
470 0.34
471 0.43
472 0.49
473 0.53
474 0.62
475 0.59
476 0.64
477 0.66
478 0.73
479 0.7
480 0.69
481 0.67
482 0.65
483 0.63
484 0.56
485 0.49
486 0.38
487 0.31
488 0.24
489 0.21
490 0.14
491 0.1
492 0.08
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.07
505 0.06
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.08
520 0.1
521 0.13
522 0.13
523 0.14
524 0.14
525 0.15
526 0.16
527 0.16
528 0.14
529 0.1
530 0.09
531 0.08
532 0.08
533 0.07
534 0.09
535 0.1
536 0.13
537 0.16
538 0.17
539 0.18
540 0.19
541 0.21
542 0.21
543 0.21
544 0.19
545 0.16
546 0.19
547 0.18
548 0.17
549 0.14
550 0.12
551 0.12
552 0.13
553 0.13
554 0.11
555 0.12
556 0.12
557 0.11
558 0.12
559 0.11
560 0.09
561 0.1
562 0.1
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.04
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.06
586 0.06
587 0.09
588 0.11
589 0.1
590 0.1
591 0.11
592 0.17
593 0.16
594 0.16
595 0.13
596 0.12
597 0.12
598 0.12
599 0.12
600 0.07
601 0.07
602 0.06
603 0.08
604 0.08
605 0.09
606 0.09
607 0.08
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.05
612 0.08
613 0.08
614 0.11
615 0.12
616 0.15
617 0.21
618 0.24
619 0.26
620 0.28
621 0.39
622 0.41
623 0.45
624 0.47
625 0.46
626 0.45
627 0.44
628 0.4
629 0.32
630 0.3
631 0.28
632 0.25
633 0.21
634 0.19
635 0.19
636 0.17
637 0.13
638 0.09
639 0.06
640 0.05
641 0.03
642 0.03
643 0.03
644 0.03
645 0.03
646 0.03
647 0.04
648 0.05
649 0.06
650 0.06
651 0.07
652 0.07
653 0.08
654 0.08
655 0.09
656 0.1
657 0.11
658 0.15
659 0.16
660 0.17
661 0.17
662 0.17
663 0.17
664 0.16
665 0.24
666 0.25
667 0.27
668 0.32
669 0.33
670 0.4
671 0.43
672 0.44
673 0.36
674 0.32
675 0.3
676 0.25
677 0.23
678 0.16
679 0.13
680 0.15
681 0.2
682 0.2
683 0.23
684 0.28
685 0.35
686 0.42
687 0.51
688 0.51
689 0.48
690 0.48
691 0.51
692 0.52
693 0.45
694 0.38
695 0.3
696 0.26
697 0.24
698 0.24
699 0.18
700 0.13
701 0.14
702 0.15
703 0.18
704 0.23
705 0.26
706 0.35
707 0.44
708 0.49
709 0.55
710 0.59
711 0.59
712 0.64
713 0.69
714 0.66
715 0.69
716 0.73
717 0.77
718 0.82
719 0.85
720 0.82
721 0.83
722 0.83
723 0.81
724 0.81
725 0.78
726 0.77
727 0.79
728 0.83
729 0.82
730 0.8
731 0.78
732 0.76
733 0.74
734 0.69
735 0.67
736 0.67
737 0.66
738 0.65
739 0.61
740 0.55
741 0.5
742 0.47
743 0.39
744 0.3
745 0.22
746 0.2
747 0.17
748 0.16
749 0.16
750 0.17
751 0.17
752 0.2
753 0.21
754 0.25
755 0.27
756 0.27
757 0.32
758 0.37
759 0.42
760 0.48
761 0.56
762 0.6
763 0.65
764 0.74
765 0.8
766 0.84
767 0.85
768 0.86
769 0.87
770 0.86
771 0.88
772 0.82
773 0.77
774 0.69
775 0.64
776 0.57
777 0.48
778 0.38
779 0.3
780 0.27
781 0.25
782 0.29
783 0.3
784 0.32
785 0.35
786 0.38
787 0.45
788 0.48
789 0.54
790 0.53
791 0.6
792 0.56
793 0.61
794 0.63
795 0.64
796 0.69
797 0.67
798 0.68
799 0.67
800 0.66
801 0.6
802 0.63
803 0.65
804 0.64
805 0.66
806 0.67
807 0.67
808 0.75