Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D1V3

Protein Details
Accession S3D1V3    Localization Confidence High Confidence Score 24.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-38SSHALAKNAKDKKHRTSKKSEKREVPSKVLSTHydrophilic
264-283ATVPAKKPVRQQPKGLKMRFHydrophilic
325-362TDTSSKKEASHGKKRRHEEKSGRKAEKKSKNKAGSVISBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-29KNAKDKKHRTSKKSEKR
330-357KKEASHGKKRRHEEKSGRKAEKKSKNKA
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG glz:GLAREA_01948  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MPKATPSSHALAKNAKDKKHRTSKKSEKREVPSKVLSTEFVEDSGDDSASDSDAESLPKIPSKSALTNNGKPPAPDGSDSSSENDSSSQESTEGEESGAEEQDDEDEEEVSQTAKGTNSVPAPSAPPVVTTRAPVKYTPPTGFEKTTVKDVGAVSDAFKKSNLGGKQIWYFTAPASVPISSIENISLLDVKNGDTVYSKDGADYGFAKSSENDPEQNSGTILMIPSSTSEGYKTVSRPIDQVLHLRRIVSLPGVNDSGSASSKATVPAKKPVRQQPKGLKMRFLPIGFGEGDGGKLGSESSEESDVEMVDASNSVPAEPTKTHKTDTSSKKEASHGKKRRHEEKSGRKAEKKSKNKAGSVISNSQNKQAISVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.58
3 0.62
4 0.67
5 0.73
6 0.76
7 0.8
8 0.8
9 0.84
10 0.88
11 0.89
12 0.92
13 0.92
14 0.9
15 0.9
16 0.91
17 0.87
18 0.84
19 0.8
20 0.72
21 0.65
22 0.57
23 0.49
24 0.42
25 0.38
26 0.3
27 0.23
28 0.2
29 0.17
30 0.17
31 0.16
32 0.12
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.07
39 0.08
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.13
45 0.17
46 0.18
47 0.17
48 0.2
49 0.25
50 0.31
51 0.35
52 0.44
53 0.48
54 0.55
55 0.61
56 0.62
57 0.58
58 0.51
59 0.47
60 0.42
61 0.37
62 0.32
63 0.28
64 0.28
65 0.3
66 0.31
67 0.31
68 0.27
69 0.24
70 0.23
71 0.2
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.08
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.09
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.15
108 0.14
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.13
113 0.14
114 0.15
115 0.18
116 0.18
117 0.18
118 0.22
119 0.23
120 0.25
121 0.23
122 0.27
123 0.29
124 0.33
125 0.32
126 0.31
127 0.33
128 0.35
129 0.36
130 0.34
131 0.32
132 0.29
133 0.31
134 0.28
135 0.22
136 0.21
137 0.2
138 0.18
139 0.15
140 0.14
141 0.11
142 0.16
143 0.17
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.2
149 0.2
150 0.19
151 0.19
152 0.22
153 0.25
154 0.25
155 0.24
156 0.19
157 0.18
158 0.13
159 0.15
160 0.12
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.12
197 0.15
198 0.16
199 0.17
200 0.16
201 0.19
202 0.19
203 0.19
204 0.17
205 0.13
206 0.11
207 0.1
208 0.08
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.17
222 0.19
223 0.2
224 0.2
225 0.22
226 0.25
227 0.23
228 0.3
229 0.29
230 0.31
231 0.31
232 0.3
233 0.28
234 0.25
235 0.24
236 0.19
237 0.16
238 0.12
239 0.14
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.14
251 0.18
252 0.21
253 0.23
254 0.32
255 0.39
256 0.44
257 0.52
258 0.59
259 0.65
260 0.66
261 0.73
262 0.74
263 0.77
264 0.81
265 0.75
266 0.7
267 0.61
268 0.62
269 0.58
270 0.48
271 0.39
272 0.29
273 0.3
274 0.24
275 0.22
276 0.17
277 0.11
278 0.11
279 0.09
280 0.09
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.05
286 0.06
287 0.08
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.07
296 0.05
297 0.06
298 0.05
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.12
305 0.14
306 0.2
307 0.27
308 0.29
309 0.32
310 0.35
311 0.41
312 0.47
313 0.56
314 0.59
315 0.58
316 0.59
317 0.6
318 0.63
319 0.67
320 0.67
321 0.68
322 0.68
323 0.71
324 0.77
325 0.84
326 0.86
327 0.84
328 0.85
329 0.85
330 0.87
331 0.88
332 0.89
333 0.89
334 0.86
335 0.88
336 0.88
337 0.87
338 0.87
339 0.86
340 0.86
341 0.86
342 0.83
343 0.8
344 0.78
345 0.76
346 0.73
347 0.7
348 0.67
349 0.66
350 0.63
351 0.61
352 0.58
353 0.48