Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D5U1

Protein Details
Accession S3D5U1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-163TEKSRKQDSKKARGKYARSKRQNEHNLIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-155KSRKQDSKKARGKYARSKR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 4, golg 3, cyto_mito 3, mito 2, plas 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
IPR035992  Ricin_B-like_lectins  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
KEGG glz:GLAREA_06142  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11395  bHLHzip_SREBP_like  
Amino Acid Sequences MAFQNQDSAIDSNDTSLSWPDAPWFDQYNSLSYDFDDYELLAGLPVDQILPEFTLPSPVSDYSSMNMDGLLESRDDVWDILNESRHLHDDPFTPAATPSKKNCSTDATHSPSLDSCLGTNSSPTVKAEKTSKSLTEKSRKQDSKKARGKYARSKRQNEHNLIEKRYRNNLNSKINTLRNNIPCLSSIKEKECGNDGMESDDSDGTRLQKCNKGIVFDKAVEYIAELRSQVLALSKENERFRLAHINYAYGQEQSITAMLTMFCFFEEKPCLLDTEASSTSQILTCTPIFMADILHPPAEIPPNKSATQQSWRTRDSPDLTRSLTNYQNGLHSVSQNAPTTGHYVENMSNGGLQVDARGNDQFKIEQPFAAPLPTQKSTTLCGLRERTIWMILVACVLLVIGGVTGGVVAGLRRRSSNKSAISATTVTTTVSAGSATQTNPAIPTSSSSPFDSNVWYRLTNEDPGTSIALDVVNDNDIASSGRLQMQTPKAVSGQYWQIRQLADGKSYALCTQFLGPNMRLDVSEITPHLAPSSTSLGQQWFITAWGAGTWRVANAVKGAGFYLDSRGSGVVLYMNDGSLPGQRWKFEALGPINNSSYTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.14
4 0.15
5 0.14
6 0.14
7 0.16
8 0.19
9 0.2
10 0.23
11 0.26
12 0.24
13 0.3
14 0.31
15 0.31
16 0.31
17 0.31
18 0.27
19 0.23
20 0.26
21 0.2
22 0.2
23 0.17
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.08
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.06
37 0.08
38 0.07
39 0.09
40 0.09
41 0.15
42 0.16
43 0.17
44 0.19
45 0.19
46 0.22
47 0.22
48 0.23
49 0.18
50 0.21
51 0.2
52 0.17
53 0.16
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.14
68 0.17
69 0.17
70 0.18
71 0.2
72 0.22
73 0.22
74 0.21
75 0.22
76 0.21
77 0.25
78 0.26
79 0.24
80 0.22
81 0.22
82 0.28
83 0.3
84 0.33
85 0.33
86 0.41
87 0.46
88 0.47
89 0.49
90 0.48
91 0.48
92 0.51
93 0.55
94 0.52
95 0.5
96 0.48
97 0.46
98 0.4
99 0.39
100 0.32
101 0.23
102 0.16
103 0.15
104 0.17
105 0.15
106 0.16
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.17
111 0.19
112 0.18
113 0.22
114 0.27
115 0.3
116 0.33
117 0.36
118 0.4
119 0.42
120 0.48
121 0.54
122 0.59
123 0.61
124 0.64
125 0.71
126 0.73
127 0.73
128 0.76
129 0.77
130 0.77
131 0.79
132 0.78
133 0.77
134 0.78
135 0.81
136 0.82
137 0.83
138 0.82
139 0.84
140 0.86
141 0.83
142 0.85
143 0.86
144 0.82
145 0.76
146 0.75
147 0.72
148 0.67
149 0.68
150 0.62
151 0.57
152 0.59
153 0.59
154 0.55
155 0.57
156 0.62
157 0.64
158 0.62
159 0.62
160 0.61
161 0.6
162 0.59
163 0.55
164 0.54
165 0.48
166 0.49
167 0.44
168 0.38
169 0.34
170 0.33
171 0.31
172 0.29
173 0.3
174 0.28
175 0.33
176 0.32
177 0.32
178 0.33
179 0.31
180 0.26
181 0.24
182 0.2
183 0.18
184 0.18
185 0.16
186 0.14
187 0.13
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.15
193 0.17
194 0.2
195 0.25
196 0.27
197 0.33
198 0.33
199 0.35
200 0.34
201 0.36
202 0.35
203 0.3
204 0.3
205 0.23
206 0.22
207 0.17
208 0.15
209 0.13
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.12
221 0.14
222 0.2
223 0.21
224 0.22
225 0.22
226 0.21
227 0.23
228 0.31
229 0.28
230 0.28
231 0.28
232 0.28
233 0.27
234 0.28
235 0.26
236 0.16
237 0.15
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.12
259 0.14
260 0.11
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.07
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.17
289 0.21
290 0.22
291 0.23
292 0.24
293 0.23
294 0.3
295 0.35
296 0.39
297 0.41
298 0.43
299 0.43
300 0.42
301 0.43
302 0.4
303 0.38
304 0.34
305 0.32
306 0.31
307 0.31
308 0.31
309 0.29
310 0.28
311 0.23
312 0.21
313 0.18
314 0.18
315 0.18
316 0.18
317 0.15
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.16
322 0.15
323 0.15
324 0.13
325 0.13
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.1
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.12
348 0.11
349 0.13
350 0.18
351 0.17
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.16
356 0.17
357 0.14
358 0.11
359 0.16
360 0.18
361 0.18
362 0.18
363 0.19
364 0.2
365 0.26
366 0.27
367 0.23
368 0.28
369 0.3
370 0.3
371 0.3
372 0.3
373 0.25
374 0.22
375 0.21
376 0.15
377 0.13
378 0.11
379 0.1
380 0.08
381 0.06
382 0.04
383 0.04
384 0.03
385 0.02
386 0.02
387 0.02
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.02
393 0.02
394 0.02
395 0.02
396 0.06
397 0.08
398 0.09
399 0.11
400 0.15
401 0.22
402 0.28
403 0.36
404 0.37
405 0.39
406 0.41
407 0.39
408 0.39
409 0.34
410 0.29
411 0.22
412 0.18
413 0.14
414 0.12
415 0.11
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.05
420 0.06
421 0.08
422 0.08
423 0.1
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.12
429 0.1
430 0.12
431 0.14
432 0.17
433 0.2
434 0.21
435 0.22
436 0.21
437 0.22
438 0.24
439 0.22
440 0.22
441 0.23
442 0.21
443 0.21
444 0.24
445 0.26
446 0.25
447 0.24
448 0.21
449 0.2
450 0.21
451 0.21
452 0.17
453 0.14
454 0.1
455 0.09
456 0.09
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.09
468 0.12
469 0.13
470 0.14
471 0.21
472 0.25
473 0.3
474 0.3
475 0.3
476 0.27
477 0.27
478 0.27
479 0.24
480 0.29
481 0.28
482 0.3
483 0.3
484 0.32
485 0.31
486 0.32
487 0.34
488 0.28
489 0.25
490 0.24
491 0.23
492 0.21
493 0.23
494 0.23
495 0.18
496 0.15
497 0.14
498 0.17
499 0.19
500 0.22
501 0.26
502 0.25
503 0.27
504 0.28
505 0.27
506 0.23
507 0.23
508 0.22
509 0.18
510 0.2
511 0.18
512 0.19
513 0.18
514 0.18
515 0.17
516 0.14
517 0.13
518 0.13
519 0.19
520 0.18
521 0.18
522 0.2
523 0.21
524 0.22
525 0.22
526 0.19
527 0.13
528 0.13
529 0.13
530 0.11
531 0.09
532 0.09
533 0.1
534 0.1
535 0.11
536 0.1
537 0.1
538 0.13
539 0.14
540 0.14
541 0.15
542 0.17
543 0.16
544 0.16
545 0.16
546 0.13
547 0.13
548 0.13
549 0.16
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.14
554 0.14
555 0.12
556 0.12
557 0.11
558 0.1
559 0.12
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.12
565 0.13
566 0.16
567 0.21
568 0.24
569 0.25
570 0.28
571 0.31
572 0.32
573 0.31
574 0.37
575 0.34
576 0.4
577 0.42
578 0.44
579 0.41