Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CX65

Protein Details
Accession S3CX65    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-50SKGEKKQMSSHGEKKRKRDHKEDGHKSKSKKHKSDRPEKVSTEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-44KKQMSSHGEKKRKRDHKEDGHKSKSKKHKSDRP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
IPR005576  Rpb7-like_N  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG glz:GLAREA_00684  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
PF03876  SHS2_Rpb7-N  
Amino Acid Sequences MASDKLDSKGEKKQMSSHGEKKRKRDHKEDGHKSKSKKHKSDRPEKVSTEVSNIVSEDPSNSPFHMQTASMYLPLAPISQKYPLEGLCAEHLSPLILQYYPPFNGVVLAYDNPRLSEKPFGTNTSTEMLFQNIDEYAVSWSWVTAEFLIFKMESGVEIEAYVNLQNEGHVGLVCWNLFNASIERKRLPADWKWVGVEELEAEEGAEDNYAPDGAGYYVDGSGNKVEGKYMFRIKDVQTDSDPQRGFVSIEGTMLGEEEELALLESEKSVVKKPVDLMSRRPWPSKAIGATVLGVPREPDEDDAGGRRKHRQRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.6
3 0.65
4 0.66
5 0.68
6 0.74
7 0.78
8 0.81
9 0.83
10 0.84
11 0.83
12 0.84
13 0.84
14 0.85
15 0.9
16 0.91
17 0.9
18 0.9
19 0.89
20 0.84
21 0.83
22 0.82
23 0.82
24 0.81
25 0.82
26 0.81
27 0.85
28 0.91
29 0.92
30 0.9
31 0.87
32 0.79
33 0.73
34 0.69
35 0.59
36 0.53
37 0.46
38 0.38
39 0.31
40 0.29
41 0.24
42 0.19
43 0.18
44 0.15
45 0.13
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.17
50 0.16
51 0.18
52 0.16
53 0.15
54 0.13
55 0.16
56 0.16
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.07
64 0.08
65 0.1
66 0.15
67 0.15
68 0.16
69 0.18
70 0.17
71 0.19
72 0.18
73 0.18
74 0.15
75 0.16
76 0.15
77 0.13
78 0.13
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.19
104 0.2
105 0.23
106 0.25
107 0.27
108 0.29
109 0.28
110 0.28
111 0.23
112 0.22
113 0.17
114 0.16
115 0.14
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.12
168 0.15
169 0.19
170 0.19
171 0.2
172 0.22
173 0.24
174 0.28
175 0.27
176 0.33
177 0.33
178 0.34
179 0.33
180 0.32
181 0.29
182 0.24
183 0.19
184 0.1
185 0.08
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.14
215 0.18
216 0.24
217 0.24
218 0.25
219 0.3
220 0.3
221 0.37
222 0.36
223 0.35
224 0.31
225 0.37
226 0.38
227 0.41
228 0.4
229 0.32
230 0.3
231 0.28
232 0.25
233 0.19
234 0.19
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.08
254 0.1
255 0.13
256 0.19
257 0.2
258 0.23
259 0.27
260 0.34
261 0.4
262 0.42
263 0.46
264 0.49
265 0.58
266 0.59
267 0.59
268 0.54
269 0.51
270 0.52
271 0.53
272 0.47
273 0.41
274 0.39
275 0.36
276 0.35
277 0.33
278 0.29
279 0.22
280 0.18
281 0.15
282 0.14
283 0.16
284 0.16
285 0.15
286 0.17
287 0.18
288 0.2
289 0.26
290 0.31
291 0.33
292 0.35
293 0.43