Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DDX4

Protein Details
Accession S3DDX4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
357-382QQFQRENTVPKKKKEAPRMNRFQLLHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 2.5, plas 1, extr 1, pero 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG glz:GLAREA_12914  -  
CDD cd12261  RRM1_3_MRN1  
Amino Acid Sequences MLRALVCRVDLLTIYPTIRAQFHTSGVDYTTPLNVATVTIPKTDHDSLLISARQYANLRRNLFRGGIAEETLAVLIKDDTPLAENEANATSLQADSLTGVGLNSHSLPTNGGQDYTYGRNANYTPRNSDLRQQNTNGFQGQFQTNDDFSYMPDGPDGFYDEGSGNHDSQSKTQTQRQQYDKFAKRTVQLANLHEMTTHADIVDVVRGGMLLDIYLRSHDRTASISFLEEAHAQDFFRHVKRHDLYVRGKRVEIRWNDRQFILPGHVANKITIGATRNLVIQNRTPKHTEELIRDHLEHIHNLIVIKIGFRDQNVHISTNSVHNAMFARTCLMSRAIYKGSKIEWDEDECAAPLERPQQFQRENTVPKKKKEAPRMNRFQLLHTDDDEDPVDEEGEHDTHGISIPLPMPNFTGIAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.18
4 0.19
5 0.21
6 0.22
7 0.25
8 0.25
9 0.27
10 0.29
11 0.29
12 0.28
13 0.28
14 0.26
15 0.21
16 0.2
17 0.18
18 0.14
19 0.13
20 0.12
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.17
28 0.18
29 0.24
30 0.25
31 0.24
32 0.21
33 0.21
34 0.21
35 0.26
36 0.26
37 0.2
38 0.23
39 0.23
40 0.25
41 0.26
42 0.33
43 0.36
44 0.42
45 0.47
46 0.45
47 0.47
48 0.47
49 0.45
50 0.39
51 0.33
52 0.29
53 0.26
54 0.23
55 0.2
56 0.16
57 0.15
58 0.13
59 0.1
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.06
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.13
76 0.13
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.1
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.17
102 0.19
103 0.21
104 0.17
105 0.16
106 0.18
107 0.19
108 0.27
109 0.31
110 0.31
111 0.32
112 0.35
113 0.4
114 0.39
115 0.46
116 0.47
117 0.46
118 0.48
119 0.47
120 0.47
121 0.46
122 0.47
123 0.41
124 0.32
125 0.26
126 0.25
127 0.24
128 0.2
129 0.18
130 0.18
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.12
135 0.11
136 0.15
137 0.13
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.11
143 0.14
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.12
150 0.14
151 0.11
152 0.11
153 0.15
154 0.15
155 0.16
156 0.2
157 0.22
158 0.25
159 0.31
160 0.37
161 0.41
162 0.49
163 0.54
164 0.56
165 0.58
166 0.64
167 0.66
168 0.62
169 0.58
170 0.53
171 0.47
172 0.47
173 0.42
174 0.38
175 0.35
176 0.33
177 0.33
178 0.31
179 0.29
180 0.25
181 0.22
182 0.18
183 0.14
184 0.12
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.02
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.09
222 0.12
223 0.14
224 0.17
225 0.17
226 0.26
227 0.27
228 0.35
229 0.37
230 0.41
231 0.47
232 0.53
233 0.59
234 0.52
235 0.52
236 0.48
237 0.48
238 0.48
239 0.47
240 0.45
241 0.48
242 0.51
243 0.52
244 0.49
245 0.47
246 0.39
247 0.33
248 0.29
249 0.21
250 0.18
251 0.17
252 0.2
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.13
257 0.11
258 0.12
259 0.13
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.14
264 0.16
265 0.18
266 0.18
267 0.21
268 0.3
269 0.32
270 0.34
271 0.35
272 0.34
273 0.37
274 0.42
275 0.41
276 0.38
277 0.41
278 0.44
279 0.44
280 0.42
281 0.38
282 0.37
283 0.33
284 0.27
285 0.22
286 0.17
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.12
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.15
298 0.15
299 0.23
300 0.25
301 0.26
302 0.24
303 0.25
304 0.25
305 0.26
306 0.26
307 0.19
308 0.16
309 0.16
310 0.17
311 0.17
312 0.16
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.14
319 0.15
320 0.16
321 0.21
322 0.23
323 0.24
324 0.26
325 0.27
326 0.26
327 0.3
328 0.3
329 0.29
330 0.28
331 0.31
332 0.32
333 0.3
334 0.29
335 0.24
336 0.23
337 0.19
338 0.16
339 0.14
340 0.2
341 0.22
342 0.26
343 0.3
344 0.38
345 0.42
346 0.44
347 0.5
348 0.51
349 0.57
350 0.62
351 0.7
352 0.68
353 0.7
354 0.77
355 0.78
356 0.79
357 0.81
358 0.83
359 0.82
360 0.86
361 0.9
362 0.87
363 0.86
364 0.77
365 0.7
366 0.68
367 0.61
368 0.53
369 0.45
370 0.42
371 0.34
372 0.35
373 0.33
374 0.24
375 0.2
376 0.17
377 0.16
378 0.11
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.08
389 0.1
390 0.13
391 0.17
392 0.17
393 0.18
394 0.19
395 0.2