Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DDJ8

Protein Details
Accession S3DDJ8    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-283ARTAKGEVPRPKRNVKKRSYGDASFHydrophilic
302-328TGEGDDRSGRKRPKKNGPPHNYQGPLRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
263-276KGEVPRPKRNVKKR
310-317GRKRPKKN
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG glz:GLAREA_12789  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MPSDHPQTPESPSHAVSGVTDLYRKTSTSPQFTNSLPTPAHSINGSMSALGADSMVSGFSQDDASNKRKRDPEDSGDRDQKKVHLEEARLTIEQLHLDVGEKYLLCRTPHPRQSPHLSQDLFAMYSLNNVAQSVARTNPDGTKNPLRKTYKKYIKTLGLSGAFDVGKKELDAPDTLSALIMTPDDQWEAQNTTSRPMGKGFSDEVRSSLGSAFKMAKGRIPKDRFDSSVLGEIVARPVDMSKLASNGIKPHPPQNPAVARTAKGEVPRPKRNVKKRSYGDASFEGYGEGYIDDETQDTGYSTGEGDDRSGRKRPKKNGPPHNYQGPLRQNSYGPGMVGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.23
4 0.22
5 0.19
6 0.17
7 0.17
8 0.16
9 0.19
10 0.2
11 0.2
12 0.2
13 0.27
14 0.34
15 0.41
16 0.44
17 0.43
18 0.46
19 0.46
20 0.49
21 0.42
22 0.39
23 0.31
24 0.29
25 0.31
26 0.28
27 0.29
28 0.22
29 0.21
30 0.17
31 0.2
32 0.19
33 0.12
34 0.12
35 0.1
36 0.1
37 0.08
38 0.07
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.05
47 0.07
48 0.07
49 0.11
50 0.16
51 0.23
52 0.3
53 0.32
54 0.38
55 0.43
56 0.47
57 0.52
58 0.55
59 0.57
60 0.61
61 0.66
62 0.67
63 0.71
64 0.67
65 0.61
66 0.54
67 0.49
68 0.45
69 0.4
70 0.38
71 0.35
72 0.35
73 0.37
74 0.4
75 0.39
76 0.33
77 0.31
78 0.25
79 0.2
80 0.18
81 0.14
82 0.1
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.11
91 0.15
92 0.15
93 0.21
94 0.28
95 0.36
96 0.45
97 0.51
98 0.53
99 0.55
100 0.63
101 0.65
102 0.62
103 0.59
104 0.51
105 0.44
106 0.41
107 0.36
108 0.27
109 0.19
110 0.16
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.16
126 0.2
127 0.21
128 0.26
129 0.34
130 0.39
131 0.41
132 0.49
133 0.51
134 0.54
135 0.59
136 0.64
137 0.65
138 0.66
139 0.68
140 0.65
141 0.65
142 0.6
143 0.54
144 0.47
145 0.39
146 0.32
147 0.27
148 0.23
149 0.16
150 0.14
151 0.12
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.06
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.09
176 0.09
177 0.13
178 0.13
179 0.15
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.18
185 0.14
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.2
190 0.19
191 0.18
192 0.18
193 0.18
194 0.16
195 0.15
196 0.14
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.17
202 0.16
203 0.19
204 0.24
205 0.29
206 0.37
207 0.4
208 0.41
209 0.44
210 0.48
211 0.46
212 0.43
213 0.41
214 0.32
215 0.34
216 0.3
217 0.24
218 0.2
219 0.18
220 0.15
221 0.13
222 0.11
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.09
228 0.08
229 0.1
230 0.11
231 0.13
232 0.13
233 0.18
234 0.22
235 0.25
236 0.26
237 0.33
238 0.37
239 0.39
240 0.4
241 0.44
242 0.47
243 0.44
244 0.49
245 0.43
246 0.39
247 0.38
248 0.39
249 0.32
250 0.29
251 0.35
252 0.38
253 0.45
254 0.53
255 0.57
256 0.64
257 0.72
258 0.79
259 0.81
260 0.8
261 0.82
262 0.79
263 0.83
264 0.8
265 0.73
266 0.69
267 0.62
268 0.58
269 0.47
270 0.4
271 0.3
272 0.22
273 0.19
274 0.13
275 0.09
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.17
294 0.2
295 0.25
296 0.33
297 0.42
298 0.5
299 0.6
300 0.68
301 0.73
302 0.81
303 0.87
304 0.9
305 0.89
306 0.89
307 0.88
308 0.87
309 0.82
310 0.74
311 0.73
312 0.71
313 0.68
314 0.62
315 0.57
316 0.49
317 0.46
318 0.48
319 0.4