Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CIA5

Protein Details
Accession S3CIA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-90GNTSVDRRKRRDEKTGNGETDHydrophilic
311-330LDLPKPKKEKPAKAKPTNVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
315-325KPKKEKPAKAK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG glz:GLAREA_11580  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
Amino Acid Sequences MADDSVPAAPAKAGGESSSRGEGAHEAEEGVAGAGKAVEGEAMREEGVEEEVLGPMTSAAVIRKLIWVGGNTSVDRRKRRDEKTGNGETDDVAKYHSTQFSKEEIEAEGRKPKRKVAVLIGYAGSGYKGMQINGTEKTIEGDLFKAFVAAGAISKANADDPKKSTLVRCARTDKGVHAAGNVISLKLIVEEDDIVQKINAALPPQIRVWGYERTNGSFSCYQSCDSRWYEYLIPTYSFLPPHPRSFLGRKLVDSAEKKGVLDEYKSRQEDVANFWDSAEEKYIKPILDELDPEMRDAVMESIHASEIMLDLDLPKPKKEKPAKAKPTNVSMDPATQAENEASLLNVHGDRKAHLERAIAQDQMKRKAEEDSVSRDQPPPKIQRISPDHTSVDTPEQKNGLAETNALATESPSVEVVASEDSNLKAVDTTSLVENAKEEVEAESTAISANEEADSTVADTTAPLEGAKQELEAESTAITTKQDEPRRELTPLEVAIKRVKAAYITAKKAYRISEYRRQRVEEALNTYVGTCNFHNYTIQKSFSDPSAKRVIRSFKVGKDPVYINDTEWLSLKVHGQSFMMHQIRKMVAMASMVVRCGSTAEVIRDSYGRAPISIPKAPSLGLLLERPVFNSYNTQAVSKFNREKIDFDKYQKEMDEFKQREIYDRIFREEERDNQFHTFFHHIDNFKTDYFLWVTAEGVAGARQSVARSENVLPEDVYESDEEQPDAKGEEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.14
3 0.16
4 0.19
5 0.2
6 0.2
7 0.18
8 0.19
9 0.2
10 0.2
11 0.19
12 0.16
13 0.14
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.1
18 0.08
19 0.06
20 0.06
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.06
26 0.05
27 0.07
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.09
34 0.11
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.08
41 0.07
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.07
47 0.09
48 0.1
49 0.11
50 0.13
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.17
56 0.21
57 0.24
58 0.22
59 0.28
60 0.34
61 0.4
62 0.47
63 0.5
64 0.56
65 0.63
66 0.7
67 0.75
68 0.77
69 0.8
70 0.82
71 0.85
72 0.76
73 0.68
74 0.61
75 0.5
76 0.45
77 0.35
78 0.25
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.2
83 0.26
84 0.23
85 0.25
86 0.28
87 0.31
88 0.33
89 0.32
90 0.28
91 0.24
92 0.29
93 0.29
94 0.29
95 0.34
96 0.37
97 0.44
98 0.44
99 0.48
100 0.51
101 0.54
102 0.57
103 0.58
104 0.61
105 0.56
106 0.57
107 0.51
108 0.42
109 0.35
110 0.29
111 0.19
112 0.1
113 0.08
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.15
119 0.19
120 0.21
121 0.22
122 0.17
123 0.15
124 0.17
125 0.16
126 0.14
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.14
145 0.16
146 0.2
147 0.23
148 0.27
149 0.29
150 0.31
151 0.31
152 0.36
153 0.43
154 0.44
155 0.47
156 0.49
157 0.5
158 0.53
159 0.52
160 0.45
161 0.42
162 0.4
163 0.33
164 0.28
165 0.27
166 0.22
167 0.23
168 0.2
169 0.13
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.13
189 0.13
190 0.16
191 0.16
192 0.18
193 0.16
194 0.18
195 0.2
196 0.24
197 0.25
198 0.28
199 0.3
200 0.3
201 0.32
202 0.29
203 0.32
204 0.27
205 0.27
206 0.26
207 0.25
208 0.24
209 0.25
210 0.26
211 0.27
212 0.26
213 0.28
214 0.24
215 0.27
216 0.27
217 0.27
218 0.29
219 0.25
220 0.23
221 0.21
222 0.21
223 0.2
224 0.18
225 0.17
226 0.23
227 0.24
228 0.27
229 0.29
230 0.29
231 0.32
232 0.37
233 0.43
234 0.42
235 0.41
236 0.38
237 0.39
238 0.39
239 0.4
240 0.38
241 0.34
242 0.31
243 0.3
244 0.29
245 0.26
246 0.27
247 0.21
248 0.21
249 0.23
250 0.23
251 0.3
252 0.31
253 0.31
254 0.29
255 0.3
256 0.29
257 0.29
258 0.29
259 0.24
260 0.23
261 0.23
262 0.23
263 0.21
264 0.2
265 0.18
266 0.14
267 0.12
268 0.15
269 0.17
270 0.16
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.14
275 0.15
276 0.15
277 0.17
278 0.18
279 0.17
280 0.16
281 0.14
282 0.12
283 0.12
284 0.1
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.04
298 0.06
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.16
303 0.19
304 0.29
305 0.37
306 0.45
307 0.52
308 0.63
309 0.72
310 0.78
311 0.84
312 0.77
313 0.75
314 0.68
315 0.58
316 0.49
317 0.38
318 0.31
319 0.24
320 0.21
321 0.14
322 0.11
323 0.11
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.13
338 0.14
339 0.15
340 0.16
341 0.17
342 0.19
343 0.24
344 0.25
345 0.22
346 0.22
347 0.23
348 0.26
349 0.31
350 0.3
351 0.25
352 0.24
353 0.25
354 0.26
355 0.25
356 0.24
357 0.25
358 0.27
359 0.27
360 0.28
361 0.29
362 0.3
363 0.3
364 0.35
365 0.33
366 0.35
367 0.38
368 0.37
369 0.43
370 0.48
371 0.49
372 0.45
373 0.43
374 0.38
375 0.35
376 0.35
377 0.27
378 0.27
379 0.28
380 0.25
381 0.23
382 0.23
383 0.22
384 0.21
385 0.21
386 0.16
387 0.1
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.05
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.12
467 0.2
468 0.27
469 0.3
470 0.35
471 0.4
472 0.42
473 0.42
474 0.37
475 0.31
476 0.29
477 0.28
478 0.27
479 0.23
480 0.22
481 0.24
482 0.24
483 0.22
484 0.19
485 0.17
486 0.13
487 0.15
488 0.23
489 0.27
490 0.31
491 0.36
492 0.37
493 0.38
494 0.41
495 0.4
496 0.37
497 0.37
498 0.41
499 0.45
500 0.54
501 0.6
502 0.62
503 0.62
504 0.57
505 0.56
506 0.55
507 0.51
508 0.47
509 0.4
510 0.36
511 0.33
512 0.31
513 0.26
514 0.2
515 0.17
516 0.12
517 0.14
518 0.15
519 0.16
520 0.19
521 0.19
522 0.25
523 0.27
524 0.29
525 0.26
526 0.27
527 0.28
528 0.28
529 0.36
530 0.3
531 0.31
532 0.39
533 0.39
534 0.38
535 0.44
536 0.47
537 0.41
538 0.49
539 0.49
540 0.45
541 0.54
542 0.55
543 0.5
544 0.48
545 0.46
546 0.41
547 0.4
548 0.34
549 0.25
550 0.27
551 0.26
552 0.21
553 0.2
554 0.19
555 0.15
556 0.16
557 0.18
558 0.18
559 0.18
560 0.19
561 0.18
562 0.18
563 0.2
564 0.28
565 0.3
566 0.26
567 0.25
568 0.29
569 0.29
570 0.29
571 0.27
572 0.18
573 0.14
574 0.14
575 0.15
576 0.13
577 0.13
578 0.12
579 0.12
580 0.11
581 0.1
582 0.1
583 0.09
584 0.09
585 0.11
586 0.14
587 0.15
588 0.16
589 0.17
590 0.17
591 0.18
592 0.18
593 0.2
594 0.18
595 0.16
596 0.18
597 0.23
598 0.29
599 0.31
600 0.3
601 0.27
602 0.28
603 0.27
604 0.26
605 0.22
606 0.18
607 0.16
608 0.15
609 0.16
610 0.17
611 0.17
612 0.18
613 0.19
614 0.18
615 0.17
616 0.22
617 0.21
618 0.25
619 0.26
620 0.25
621 0.24
622 0.29
623 0.34
624 0.38
625 0.44
626 0.43
627 0.5
628 0.5
629 0.53
630 0.54
631 0.57
632 0.54
633 0.53
634 0.57
635 0.51
636 0.53
637 0.51
638 0.48
639 0.44
640 0.45
641 0.49
642 0.43
643 0.45
644 0.48
645 0.46
646 0.49
647 0.48
648 0.48
649 0.46
650 0.48
651 0.49
652 0.46
653 0.46
654 0.45
655 0.47
656 0.48
657 0.47
658 0.47
659 0.44
660 0.44
661 0.45
662 0.39
663 0.38
664 0.36
665 0.28
666 0.31
667 0.35
668 0.34
669 0.35
670 0.4
671 0.38
672 0.32
673 0.33
674 0.27
675 0.24
676 0.25
677 0.24
678 0.2
679 0.17
680 0.18
681 0.16
682 0.16
683 0.12
684 0.1
685 0.09
686 0.08
687 0.07
688 0.07
689 0.08
690 0.09
691 0.12
692 0.14
693 0.15
694 0.19
695 0.22
696 0.27
697 0.28
698 0.29
699 0.25
700 0.25
701 0.26
702 0.22
703 0.21
704 0.16
705 0.17
706 0.19
707 0.2
708 0.19
709 0.17
710 0.17
711 0.17