Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PNL1

Protein Details
Accession A0A1D8PNL1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-36PTPTSLDTKKMPPKEKKNKDDRPYKCTFCHydrophilic
76-104LTRHLRIHTNPSSRKRKNKNQNMMINPNAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000433  P:carbon catabolite repression of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose  
GO:0015976  P:carbon utilization  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
GO:0061987  P:negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cal:CAALFM_C502940CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MSMSTPMPTPTSLDTKKMPPKEKKNKDDRPYKCTFCDKAFHRLEHQTRHIRTHTGEKPHACTFPGCVKRFSRSDELTRHLRIHTNPSSRKRKNKNQNMMINPNATTATTTGPAGMAIPTSNLPPGSYAIPNTAIPFSIDRNGNHVYHQPYPVYFVPHANGYMQPMVQTQGVTVVPNTDQQQQQYYQQQQQQYQFQERPQHQQQQQTNIGTNNHLQQNGSAVFSLPSSPTMASAQTPNSGTSSSSESIKLAPLSIPNNISRSQQQQQQQQQQQIPKSESSTSLYSDGNKLFSRPNSTLHSLGSSPENNNASGPLSGVPTPSFSNLNDYFQQKSNSNNSRLFNASSSSLSSLSGKIRSSSSTNLAGLQRLTPLTSTTNNTNNTTTSNTTNNNMTKPSIIPKQPSSTSLNLEFYNGNNQQQQNYHTHKKSRPNSPSQTPIHLSSSRKSANNSFIISPNETPLQTPLQSPQLKPYQDQPPTNVNINVSAPSDTFIGTAVTEKLNNISSIAGNGTQLPPIRSVLSFTSLVDYPDPKQKNVAPPVVDTTNVARGETNGSNGNNSNAKPMSLTNLLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.45
3 0.54
4 0.6
5 0.66
6 0.67
7 0.76
8 0.83
9 0.89
10 0.9
11 0.92
12 0.93
13 0.93
14 0.93
15 0.89
16 0.86
17 0.84
18 0.79
19 0.75
20 0.73
21 0.68
22 0.63
23 0.64
24 0.6
25 0.62
26 0.63
27 0.59
28 0.57
29 0.62
30 0.65
31 0.64
32 0.7
33 0.69
34 0.66
35 0.7
36 0.66
37 0.6
38 0.56
39 0.58
40 0.56
41 0.55
42 0.59
43 0.56
44 0.59
45 0.59
46 0.57
47 0.49
48 0.42
49 0.38
50 0.4
51 0.45
52 0.42
53 0.43
54 0.45
55 0.5
56 0.53
57 0.55
58 0.54
59 0.5
60 0.56
61 0.57
62 0.59
63 0.59
64 0.58
65 0.54
66 0.48
67 0.48
68 0.43
69 0.46
70 0.49
71 0.53
72 0.58
73 0.66
74 0.75
75 0.78
76 0.85
77 0.86
78 0.88
79 0.89
80 0.91
81 0.92
82 0.91
83 0.91
84 0.9
85 0.87
86 0.8
87 0.71
88 0.6
89 0.5
90 0.4
91 0.3
92 0.23
93 0.16
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.15
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.18
125 0.21
126 0.2
127 0.24
128 0.28
129 0.27
130 0.27
131 0.3
132 0.29
133 0.3
134 0.32
135 0.28
136 0.25
137 0.29
138 0.29
139 0.28
140 0.25
141 0.23
142 0.22
143 0.22
144 0.22
145 0.18
146 0.18
147 0.15
148 0.16
149 0.14
150 0.13
151 0.12
152 0.13
153 0.12
154 0.12
155 0.09
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.13
163 0.15
164 0.17
165 0.18
166 0.19
167 0.23
168 0.23
169 0.28
170 0.33
171 0.36
172 0.38
173 0.41
174 0.44
175 0.46
176 0.49
177 0.5
178 0.47
179 0.48
180 0.45
181 0.44
182 0.48
183 0.46
184 0.5
185 0.5
186 0.56
187 0.53
188 0.59
189 0.59
190 0.58
191 0.61
192 0.54
193 0.5
194 0.43
195 0.4
196 0.33
197 0.3
198 0.27
199 0.24
200 0.22
201 0.2
202 0.17
203 0.2
204 0.19
205 0.17
206 0.12
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.15
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.14
235 0.13
236 0.09
237 0.09
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.15
242 0.15
243 0.17
244 0.17
245 0.18
246 0.18
247 0.23
248 0.24
249 0.28
250 0.33
251 0.39
252 0.47
253 0.54
254 0.56
255 0.56
256 0.57
257 0.56
258 0.54
259 0.49
260 0.43
261 0.34
262 0.31
263 0.26
264 0.23
265 0.22
266 0.2
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.15
271 0.17
272 0.16
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.15
277 0.16
278 0.21
279 0.19
280 0.23
281 0.25
282 0.27
283 0.27
284 0.25
285 0.25
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.15
290 0.13
291 0.16
292 0.17
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.13
297 0.11
298 0.11
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.1
309 0.16
310 0.17
311 0.2
312 0.21
313 0.22
314 0.23
315 0.25
316 0.27
317 0.22
318 0.26
319 0.32
320 0.36
321 0.39
322 0.42
323 0.4
324 0.4
325 0.41
326 0.37
327 0.29
328 0.24
329 0.2
330 0.16
331 0.16
332 0.14
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.17
343 0.19
344 0.19
345 0.21
346 0.21
347 0.21
348 0.23
349 0.23
350 0.22
351 0.19
352 0.17
353 0.15
354 0.12
355 0.12
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.14
360 0.16
361 0.19
362 0.25
363 0.27
364 0.29
365 0.29
366 0.27
367 0.26
368 0.27
369 0.25
370 0.22
371 0.24
372 0.23
373 0.24
374 0.3
375 0.3
376 0.28
377 0.27
378 0.25
379 0.23
380 0.23
381 0.27
382 0.28
383 0.29
384 0.32
385 0.34
386 0.39
387 0.39
388 0.41
389 0.41
390 0.37
391 0.37
392 0.35
393 0.33
394 0.28
395 0.28
396 0.25
397 0.2
398 0.26
399 0.23
400 0.23
401 0.26
402 0.26
403 0.27
404 0.29
405 0.32
406 0.32
407 0.39
408 0.46
409 0.46
410 0.54
411 0.59
412 0.67
413 0.71
414 0.74
415 0.75
416 0.76
417 0.78
418 0.76
419 0.78
420 0.71
421 0.69
422 0.61
423 0.55
424 0.51
425 0.48
426 0.44
427 0.38
428 0.43
429 0.41
430 0.4
431 0.41
432 0.41
433 0.43
434 0.45
435 0.45
436 0.38
437 0.38
438 0.39
439 0.38
440 0.33
441 0.29
442 0.27
443 0.24
444 0.23
445 0.21
446 0.22
447 0.2
448 0.2
449 0.21
450 0.28
451 0.32
452 0.31
453 0.36
454 0.4
455 0.4
456 0.41
457 0.45
458 0.46
459 0.5
460 0.52
461 0.49
462 0.49
463 0.51
464 0.54
465 0.48
466 0.39
467 0.34
468 0.32
469 0.29
470 0.23
471 0.2
472 0.16
473 0.15
474 0.15
475 0.12
476 0.11
477 0.1
478 0.09
479 0.08
480 0.1
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.12
485 0.14
486 0.15
487 0.15
488 0.14
489 0.14
490 0.13
491 0.13
492 0.15
493 0.13
494 0.11
495 0.13
496 0.13
497 0.15
498 0.17
499 0.17
500 0.18
501 0.19
502 0.21
503 0.19
504 0.21
505 0.2
506 0.23
507 0.22
508 0.2
509 0.22
510 0.21
511 0.22
512 0.22
513 0.22
514 0.21
515 0.3
516 0.32
517 0.29
518 0.35
519 0.4
520 0.47
521 0.53
522 0.56
523 0.49
524 0.49
525 0.55
526 0.5
527 0.44
528 0.36
529 0.32
530 0.32
531 0.3
532 0.27
533 0.21
534 0.21
535 0.27
536 0.26
537 0.26
538 0.24
539 0.25
540 0.28
541 0.29
542 0.33
543 0.31
544 0.3
545 0.34
546 0.29
547 0.29
548 0.27
549 0.27
550 0.29