Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D602

Protein Details
Accession S3D602    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-360RGPPARQMSSRQRPQRRQSEEDHydrophilic
371-393MYSSSRNSRNPPRKQPKYIEEEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
418-443PRRAPSSVGGGSGRGASRRPDIRKIR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000270  PB1_dom  
IPR034892  PB1_NoxR  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR019734  TPR_repeat  
KEGG glz:GLAREA_06895  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00564  PB1  
PF00515  TPR_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51745  PB1  
PS50005  TPR  
CDD cd06408  PB1_NoxR  
Amino Acid Sequences MSLKQEIETWVKALGHYDGNEFDEALKEFDGISDTSKILFNCGVIHATLGEHEKAVECYQRAVRLDQYLAVAYFQQGVSNFLVGDFEEALANFNDTLLYLRGNNMIDYAQLGLMFKLYSCEVLFNRGLCYIYLQQKEAGMQDFSFAVKEKVVEDHNVIDEAIKEEAEGYTVFSIPVGVVYRPNQAKVKNLKTKDYLGKARLVAASDRANAFTGFAGSEIKNAGKADVKDDRPTENISYAASNLVKPGLQSKRQQSEPPVSRNVFPPTPPPESEKGSTTSSSSGMSRGASVRNGPKPMPAKLNIEKARPNERYEIRDDGRSPQGQQKERLGTTRTASEPRGPPARQMSSRQRPQRRQSEEDEDGYPEELYDMYSSSRNSRNPPRKQPKYIEEEDEDASDYDDGSFDENDFEMVSSRPPPRRAPSSVGGGSGRGASRRPDIRKIRVKVHSEDVRYIMIGAAVEFPDLVDRIRDKFGLRKRFKIKVRDDDQPDGDMITLGDQDDLDMIIMSVKSNAKKERQDMGKMELWVQEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.21
4 0.23
5 0.21
6 0.23
7 0.23
8 0.21
9 0.18
10 0.18
11 0.17
12 0.16
13 0.14
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.14
18 0.11
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.15
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.19
27 0.16
28 0.16
29 0.17
30 0.17
31 0.14
32 0.15
33 0.12
34 0.11
35 0.13
36 0.15
37 0.14
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.16
42 0.18
43 0.21
44 0.18
45 0.23
46 0.26
47 0.32
48 0.33
49 0.33
50 0.35
51 0.34
52 0.34
53 0.31
54 0.29
55 0.24
56 0.22
57 0.2
58 0.16
59 0.12
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.12
70 0.09
71 0.11
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.09
106 0.09
107 0.13
108 0.12
109 0.18
110 0.19
111 0.18
112 0.19
113 0.19
114 0.19
115 0.15
116 0.19
117 0.2
118 0.27
119 0.28
120 0.28
121 0.28
122 0.28
123 0.29
124 0.27
125 0.23
126 0.16
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.12
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.16
145 0.13
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.11
167 0.18
168 0.19
169 0.22
170 0.25
171 0.25
172 0.33
173 0.4
174 0.49
175 0.51
176 0.53
177 0.54
178 0.54
179 0.6
180 0.58
181 0.56
182 0.52
183 0.46
184 0.47
185 0.42
186 0.41
187 0.35
188 0.29
189 0.23
190 0.2
191 0.19
192 0.17
193 0.17
194 0.15
195 0.15
196 0.13
197 0.13
198 0.1
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.12
211 0.12
212 0.16
213 0.22
214 0.24
215 0.27
216 0.28
217 0.29
218 0.27
219 0.29
220 0.25
221 0.19
222 0.18
223 0.15
224 0.14
225 0.12
226 0.12
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.14
234 0.17
235 0.22
236 0.28
237 0.35
238 0.4
239 0.42
240 0.45
241 0.42
242 0.47
243 0.47
244 0.46
245 0.45
246 0.41
247 0.4
248 0.4
249 0.4
250 0.31
251 0.26
252 0.27
253 0.27
254 0.29
255 0.29
256 0.3
257 0.29
258 0.31
259 0.32
260 0.28
261 0.26
262 0.24
263 0.23
264 0.2
265 0.18
266 0.15
267 0.15
268 0.13
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.13
277 0.19
278 0.22
279 0.24
280 0.23
281 0.28
282 0.3
283 0.32
284 0.33
285 0.3
286 0.34
287 0.36
288 0.46
289 0.43
290 0.43
291 0.45
292 0.45
293 0.51
294 0.46
295 0.45
296 0.42
297 0.43
298 0.43
299 0.42
300 0.45
301 0.37
302 0.38
303 0.36
304 0.33
305 0.35
306 0.33
307 0.31
308 0.3
309 0.37
310 0.37
311 0.4
312 0.42
313 0.41
314 0.41
315 0.43
316 0.39
317 0.34
318 0.32
319 0.32
320 0.28
321 0.26
322 0.27
323 0.3
324 0.29
325 0.32
326 0.37
327 0.33
328 0.35
329 0.39
330 0.44
331 0.41
332 0.46
333 0.52
334 0.55
335 0.63
336 0.69
337 0.72
338 0.76
339 0.81
340 0.84
341 0.81
342 0.76
343 0.75
344 0.74
345 0.67
346 0.6
347 0.52
348 0.43
349 0.35
350 0.3
351 0.23
352 0.14
353 0.1
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.09
360 0.1
361 0.14
362 0.2
363 0.23
364 0.3
365 0.41
366 0.5
367 0.58
368 0.68
369 0.75
370 0.79
371 0.84
372 0.86
373 0.83
374 0.81
375 0.76
376 0.7
377 0.62
378 0.55
379 0.48
380 0.39
381 0.32
382 0.23
383 0.19
384 0.13
385 0.11
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.09
400 0.14
401 0.2
402 0.26
403 0.3
404 0.37
405 0.43
406 0.5
407 0.53
408 0.55
409 0.53
410 0.55
411 0.52
412 0.48
413 0.41
414 0.34
415 0.29
416 0.25
417 0.22
418 0.15
419 0.15
420 0.16
421 0.23
422 0.31
423 0.36
424 0.44
425 0.52
426 0.61
427 0.69
428 0.72
429 0.74
430 0.74
431 0.75
432 0.69
433 0.7
434 0.68
435 0.61
436 0.59
437 0.51
438 0.43
439 0.38
440 0.33
441 0.23
442 0.16
443 0.12
444 0.1
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.1
454 0.13
455 0.16
456 0.19
457 0.21
458 0.22
459 0.31
460 0.4
461 0.47
462 0.51
463 0.58
464 0.63
465 0.71
466 0.77
467 0.79
468 0.8
469 0.79
470 0.79
471 0.79
472 0.78
473 0.76
474 0.7
475 0.61
476 0.51
477 0.4
478 0.35
479 0.25
480 0.18
481 0.11
482 0.1
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.11
496 0.16
497 0.2
498 0.27
499 0.35
500 0.41
501 0.5
502 0.56
503 0.62
504 0.64
505 0.69
506 0.66
507 0.66
508 0.63
509 0.56
510 0.53