Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DSG9

Protein Details
Accession B0DSG9    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-41SSPLMAATKPPHKRRRLTGSATPPPTTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 8.5, cyto_nucl 6, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032867  DYW_dom  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR046960  PPR_At4g14850-like_plant  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0009451  P:RNA modification  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_295434  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14432  DYW_deaminase  
PF01535  PPR  
Amino Acid Sequences MPTVHAFDQNMRTTSSPLMAATKPPHKRRRLTGSATPPPTTMQPPPGKVLAASNNTNVTAKPANGIPVCTSCHRALNALQGNLLHCARCSSTTCAICSRVCTACAPSLPPTPHLSWSPSPSPSPHASPRRSALSLHSVNTNLITTSSGSSWPHVTNNNTVAGKRRKVADNDDDSDGADRRYERATGHHSSSDLDLFGCGPGCGRTLCRNCCFENIQKQDGRAVKACDSSVAYLHSRVLIIIATTTLFSTNVDSRDSQPTPSPSDIVAWDGVCFRIRFFWLFVWQTIVSVLASYVNLAADHDFHDEDSLVFGYASAMASDLPTSFPIYIATRRQTRTFAQTLLPISDTSLDFFDSERRSWIRPENSARKNEDAYPVIYEYYLSSVKLILGLNMILEVDPCLPLLTQISVKKPFPGWSHPYWHSTERTTQAESRDGIMGGGFLTSLLRVAKNSREVRDIVNEAARRFEGTIPWQLLSAAAHVSAGPSVDDPKLAGTLLASISPKDIPYVREGVLRAVLGNASRHKNRTVALNAFRLLVARNTPLITTDYARVLHSGIDSMCHVRHNFDLADRVWQWAAPRRHVRHGDQELCYVVAQYLLLCGRAGNKEVAHQVWQEAKKMGLAHLPVVTGSMLSVLAMHGADGETLELLKDIPPASLNSHMVTAALTAFSHSGNVDAAHALLEQVEMHESQTPIASIQSYTALVDGYARSGDFTSALAIIDHPKRQKVGEDDVMWMTVLGPCRRFKNLPVAQTAFVAIQRLGSPEHRASAYVLMSDIYNACGDTMAALRMQQERLRKGLMKERGAVTLTMDNGETHVFYVREVPPALVPARRAIEQKLKEWTRWLGLCGISDESIRCQHSEKLALAYAVTQGMRQITLRKNLRICDACHEASKQITIFESISIHHWDRSRMHVMKDGKCSCHDRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.3
3 0.24
4 0.2
5 0.23
6 0.22
7 0.27
8 0.32
9 0.4
10 0.48
11 0.57
12 0.65
13 0.7
14 0.78
15 0.81
16 0.84
17 0.84
18 0.83
19 0.83
20 0.83
21 0.84
22 0.8
23 0.72
24 0.62
25 0.54
26 0.5
27 0.45
28 0.39
29 0.39
30 0.42
31 0.43
32 0.47
33 0.46
34 0.43
35 0.38
36 0.4
37 0.39
38 0.37
39 0.37
40 0.35
41 0.35
42 0.36
43 0.36
44 0.29
45 0.27
46 0.24
47 0.21
48 0.21
49 0.21
50 0.26
51 0.27
52 0.29
53 0.26
54 0.26
55 0.29
56 0.29
57 0.33
58 0.28
59 0.32
60 0.31
61 0.31
62 0.31
63 0.37
64 0.41
65 0.36
66 0.35
67 0.31
68 0.32
69 0.33
70 0.31
71 0.21
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.2
76 0.23
77 0.25
78 0.33
79 0.35
80 0.38
81 0.39
82 0.41
83 0.39
84 0.38
85 0.36
86 0.3
87 0.28
88 0.28
89 0.28
90 0.28
91 0.29
92 0.29
93 0.29
94 0.34
95 0.35
96 0.35
97 0.37
98 0.35
99 0.37
100 0.37
101 0.39
102 0.36
103 0.41
104 0.42
105 0.4
106 0.4
107 0.38
108 0.42
109 0.4
110 0.42
111 0.45
112 0.5
113 0.51
114 0.54
115 0.57
116 0.58
117 0.54
118 0.49
119 0.45
120 0.45
121 0.44
122 0.4
123 0.38
124 0.32
125 0.31
126 0.31
127 0.26
128 0.16
129 0.13
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.16
137 0.18
138 0.19
139 0.22
140 0.25
141 0.28
142 0.31
143 0.33
144 0.37
145 0.35
146 0.34
147 0.4
148 0.43
149 0.43
150 0.41
151 0.44
152 0.45
153 0.49
154 0.57
155 0.57
156 0.56
157 0.56
158 0.55
159 0.49
160 0.43
161 0.4
162 0.33
163 0.23
164 0.18
165 0.15
166 0.14
167 0.16
168 0.17
169 0.15
170 0.21
171 0.28
172 0.3
173 0.33
174 0.33
175 0.31
176 0.31
177 0.32
178 0.27
179 0.2
180 0.15
181 0.12
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.12
191 0.21
192 0.29
193 0.36
194 0.4
195 0.44
196 0.44
197 0.49
198 0.51
199 0.49
200 0.52
201 0.51
202 0.53
203 0.51
204 0.5
205 0.51
206 0.5
207 0.46
208 0.4
209 0.37
210 0.33
211 0.34
212 0.33
213 0.28
214 0.25
215 0.22
216 0.19
217 0.19
218 0.17
219 0.16
220 0.16
221 0.15
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.09
236 0.12
237 0.13
238 0.15
239 0.16
240 0.19
241 0.27
242 0.27
243 0.26
244 0.28
245 0.3
246 0.33
247 0.32
248 0.3
249 0.23
250 0.24
251 0.22
252 0.19
253 0.17
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.1
261 0.11
262 0.13
263 0.14
264 0.15
265 0.17
266 0.21
267 0.22
268 0.22
269 0.24
270 0.22
271 0.21
272 0.19
273 0.17
274 0.11
275 0.09
276 0.09
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.07
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.09
313 0.11
314 0.14
315 0.19
316 0.23
317 0.28
318 0.31
319 0.33
320 0.35
321 0.36
322 0.39
323 0.36
324 0.33
325 0.28
326 0.29
327 0.28
328 0.26
329 0.24
330 0.16
331 0.14
332 0.14
333 0.13
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.09
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.17
343 0.18
344 0.19
345 0.23
346 0.3
347 0.3
348 0.35
349 0.44
350 0.5
351 0.55
352 0.59
353 0.59
354 0.54
355 0.52
356 0.47
357 0.42
358 0.33
359 0.28
360 0.24
361 0.21
362 0.18
363 0.16
364 0.14
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.08
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.1
373 0.09
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.1
392 0.12
393 0.17
394 0.2
395 0.21
396 0.22
397 0.23
398 0.26
399 0.26
400 0.31
401 0.32
402 0.32
403 0.38
404 0.39
405 0.41
406 0.39
407 0.39
408 0.34
409 0.31
410 0.31
411 0.29
412 0.29
413 0.28
414 0.27
415 0.26
416 0.27
417 0.25
418 0.22
419 0.19
420 0.16
421 0.14
422 0.11
423 0.09
424 0.06
425 0.05
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.07
435 0.1
436 0.19
437 0.22
438 0.23
439 0.25
440 0.26
441 0.27
442 0.29
443 0.27
444 0.2
445 0.21
446 0.21
447 0.19
448 0.18
449 0.17
450 0.14
451 0.13
452 0.13
453 0.1
454 0.11
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.14
460 0.13
461 0.12
462 0.1
463 0.06
464 0.05
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.04
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.04
481 0.05
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.08
490 0.09
491 0.09
492 0.12
493 0.14
494 0.14
495 0.16
496 0.17
497 0.16
498 0.16
499 0.14
500 0.12
501 0.09
502 0.09
503 0.07
504 0.09
505 0.13
506 0.16
507 0.18
508 0.2
509 0.22
510 0.23
511 0.23
512 0.28
513 0.29
514 0.31
515 0.33
516 0.34
517 0.33
518 0.31
519 0.3
520 0.24
521 0.19
522 0.14
523 0.11
524 0.09
525 0.1
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.12
533 0.13
534 0.13
535 0.14
536 0.13
537 0.11
538 0.11
539 0.09
540 0.09
541 0.07
542 0.07
543 0.08
544 0.09
545 0.1
546 0.11
547 0.12
548 0.12
549 0.13
550 0.15
551 0.14
552 0.14
553 0.17
554 0.15
555 0.2
556 0.18
557 0.19
558 0.16
559 0.17
560 0.18
561 0.23
562 0.26
563 0.29
564 0.38
565 0.4
566 0.49
567 0.53
568 0.55
569 0.56
570 0.62
571 0.6
572 0.52
573 0.5
574 0.42
575 0.37
576 0.33
577 0.23
578 0.14
579 0.08
580 0.07
581 0.05
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.08
588 0.1
589 0.12
590 0.12
591 0.12
592 0.15
593 0.18
594 0.18
595 0.18
596 0.17
597 0.17
598 0.23
599 0.24
600 0.23
601 0.22
602 0.21
603 0.21
604 0.21
605 0.2
606 0.16
607 0.15
608 0.15
609 0.14
610 0.14
611 0.12
612 0.12
613 0.11
614 0.07
615 0.06
616 0.05
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.03
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.03
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.03
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.04
634 0.04
635 0.06
636 0.07
637 0.07
638 0.08
639 0.1
640 0.12
641 0.16
642 0.17
643 0.16
644 0.16
645 0.15
646 0.14
647 0.13
648 0.11
649 0.07
650 0.06
651 0.05
652 0.05
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.07
660 0.07
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.04
669 0.05
670 0.06
671 0.05
672 0.06
673 0.09
674 0.09
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.09
679 0.1
680 0.1
681 0.07
682 0.08
683 0.09
684 0.09
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.07
689 0.08
690 0.07
691 0.07
692 0.07
693 0.07
694 0.07
695 0.08
696 0.08
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.08
702 0.07
703 0.07
704 0.13
705 0.16
706 0.21
707 0.23
708 0.25
709 0.27
710 0.28
711 0.33
712 0.33
713 0.38
714 0.4
715 0.38
716 0.39
717 0.38
718 0.37
719 0.3
720 0.24
721 0.17
722 0.12
723 0.15
724 0.15
725 0.19
726 0.22
727 0.26
728 0.31
729 0.33
730 0.35
731 0.41
732 0.44
733 0.46
734 0.5
735 0.5
736 0.45
737 0.43
738 0.4
739 0.3
740 0.24
741 0.21
742 0.13
743 0.11
744 0.11
745 0.12
746 0.13
747 0.14
748 0.2
749 0.19
750 0.22
751 0.21
752 0.22
753 0.22
754 0.24
755 0.22
756 0.17
757 0.15
758 0.13
759 0.12
760 0.12
761 0.11
762 0.08
763 0.08
764 0.07
765 0.07
766 0.07
767 0.07
768 0.07
769 0.08
770 0.07
771 0.07
772 0.08
773 0.11
774 0.15
775 0.18
776 0.21
777 0.28
778 0.3
779 0.34
780 0.38
781 0.4
782 0.42
783 0.49
784 0.54
785 0.51
786 0.52
787 0.51
788 0.49
789 0.45
790 0.4
791 0.34
792 0.28
793 0.24
794 0.2
795 0.18
796 0.15
797 0.14
798 0.15
799 0.12
800 0.09
801 0.12
802 0.11
803 0.11
804 0.17
805 0.18
806 0.21
807 0.22
808 0.22
809 0.2
810 0.24
811 0.26
812 0.22
813 0.22
814 0.23
815 0.26
816 0.28
817 0.29
818 0.32
819 0.4
820 0.41
821 0.45
822 0.5
823 0.5
824 0.49
825 0.52
826 0.5
827 0.48
828 0.45
829 0.42
830 0.36
831 0.34
832 0.33
833 0.3
834 0.28
835 0.21
836 0.21
837 0.2
838 0.19
839 0.23
840 0.23
841 0.22
842 0.23
843 0.27
844 0.32
845 0.36
846 0.34
847 0.33
848 0.33
849 0.32
850 0.29
851 0.26
852 0.21
853 0.18
854 0.16
855 0.12
856 0.12
857 0.13
858 0.14
859 0.15
860 0.22
861 0.26
862 0.36
863 0.43
864 0.49
865 0.53
866 0.54
867 0.63
868 0.6
869 0.56
870 0.53
871 0.54
872 0.48
873 0.47
874 0.46
875 0.4
876 0.37
877 0.38
878 0.31
879 0.25
880 0.24
881 0.23
882 0.21
883 0.2
884 0.18
885 0.16
886 0.18
887 0.23
888 0.24
889 0.25
890 0.27
891 0.32
892 0.34
893 0.4
894 0.47
895 0.45
896 0.46
897 0.5
898 0.56
899 0.58
900 0.65
901 0.64
902 0.58
903 0.6