Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DS25

Protein Details
Accession B0DS25    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
420-445ATGTLQKKKSTVRRGKGKAKIKAKSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-92KRAAKR
386-408ERERRAKGKASAKKDGAKDKAKA
426-443KKKSTVRRGKGKAKIKAK
Subcellular Location(s) nucl 13cyto 13cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_295390  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MTHGKGPAILNSFVAADVLTTTTPVTTTILTTTTDSNHVPTPADAILKNPLDTDTADPQDITSEIEPPTPALHRPTNEELRVARAEKRAAKRAEKHTNAEDLKKQGDVLFSAEQYQEAYIPYLEATQVWPSNPTYWILLCTTYVKLGWYEEAAHSATRALTLDPKSSEARYLRGVARLEQKLLNAAKTDFETVLAHAPTHLPSQTSLSRTVAAITSSRTLGSHVLAPSIVDDVTKDLDFGYPHYPTDEDHALDVLDNDDGYSDSSDCVHVGSTTMQGACAEQSAPSLMPQMKEASETNCMFLPSSTRLYELTLCERRGKNVCTYFLLSLCKFGAHQCVYSHSTAYLPKKGWWTTEEKKDKIKAVMAIAEERKRVQRELEWQMRELERERRAKGKASAKKDGAKDKAKAQAQAPKDNVDTATGTLQKKKSTVRRGKGKAKIKAKSTAVIVPDDKAAPEVKADNDAPSVPFTDYNLASPVVPRPDALEAQVVLLISSEKFYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.12
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.12
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.17
21 0.19
22 0.19
23 0.2
24 0.22
25 0.22
26 0.21
27 0.2
28 0.21
29 0.2
30 0.22
31 0.19
32 0.19
33 0.25
34 0.25
35 0.25
36 0.22
37 0.21
38 0.2
39 0.22
40 0.24
41 0.23
42 0.24
43 0.25
44 0.24
45 0.23
46 0.23
47 0.21
48 0.19
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.15
55 0.17
56 0.16
57 0.18
58 0.21
59 0.26
60 0.27
61 0.34
62 0.41
63 0.47
64 0.46
65 0.47
66 0.42
67 0.41
68 0.44
69 0.39
70 0.37
71 0.33
72 0.39
73 0.44
74 0.5
75 0.54
76 0.56
77 0.63
78 0.67
79 0.72
80 0.76
81 0.74
82 0.72
83 0.67
84 0.7
85 0.64
86 0.61
87 0.56
88 0.49
89 0.44
90 0.39
91 0.35
92 0.27
93 0.25
94 0.2
95 0.2
96 0.18
97 0.17
98 0.18
99 0.17
100 0.16
101 0.15
102 0.14
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.14
117 0.15
118 0.17
119 0.18
120 0.17
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.13
127 0.15
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.07
147 0.12
148 0.14
149 0.17
150 0.17
151 0.2
152 0.22
153 0.22
154 0.27
155 0.22
156 0.23
157 0.23
158 0.26
159 0.25
160 0.28
161 0.28
162 0.27
163 0.33
164 0.32
165 0.32
166 0.29
167 0.27
168 0.28
169 0.28
170 0.25
171 0.18
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.18
176 0.11
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.13
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.11
188 0.08
189 0.09
190 0.14
191 0.17
192 0.18
193 0.19
194 0.18
195 0.18
196 0.18
197 0.18
198 0.14
199 0.12
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.15
234 0.14
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.06
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.15
281 0.13
282 0.18
283 0.18
284 0.18
285 0.17
286 0.17
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.13
291 0.16
292 0.15
293 0.15
294 0.16
295 0.17
296 0.19
297 0.18
298 0.23
299 0.25
300 0.26
301 0.32
302 0.32
303 0.35
304 0.38
305 0.39
306 0.39
307 0.39
308 0.4
309 0.37
310 0.39
311 0.35
312 0.32
313 0.34
314 0.26
315 0.22
316 0.2
317 0.17
318 0.15
319 0.15
320 0.2
321 0.17
322 0.19
323 0.18
324 0.23
325 0.26
326 0.26
327 0.25
328 0.18
329 0.19
330 0.23
331 0.26
332 0.26
333 0.25
334 0.27
335 0.33
336 0.34
337 0.34
338 0.32
339 0.36
340 0.39
341 0.48
342 0.54
343 0.51
344 0.56
345 0.59
346 0.59
347 0.54
348 0.5
349 0.43
350 0.36
351 0.37
352 0.31
353 0.32
354 0.33
355 0.32
356 0.29
357 0.28
358 0.32
359 0.31
360 0.31
361 0.29
362 0.3
363 0.36
364 0.45
365 0.52
366 0.49
367 0.47
368 0.5
369 0.48
370 0.45
371 0.4
372 0.38
373 0.38
374 0.42
375 0.44
376 0.46
377 0.48
378 0.51
379 0.56
380 0.58
381 0.58
382 0.6
383 0.66
384 0.65
385 0.69
386 0.69
387 0.7
388 0.68
389 0.67
390 0.62
391 0.6
392 0.62
393 0.59
394 0.57
395 0.53
396 0.52
397 0.5
398 0.55
399 0.51
400 0.46
401 0.43
402 0.41
403 0.36
404 0.3
405 0.26
406 0.19
407 0.21
408 0.24
409 0.25
410 0.3
411 0.33
412 0.34
413 0.37
414 0.45
415 0.5
416 0.55
417 0.64
418 0.67
419 0.75
420 0.82
421 0.87
422 0.88
423 0.88
424 0.87
425 0.86
426 0.83
427 0.78
428 0.77
429 0.7
430 0.65
431 0.59
432 0.54
433 0.46
434 0.44
435 0.39
436 0.32
437 0.31
438 0.27
439 0.23
440 0.2
441 0.19
442 0.14
443 0.16
444 0.17
445 0.16
446 0.21
447 0.22
448 0.22
449 0.23
450 0.23
451 0.22
452 0.21
453 0.21
454 0.17
455 0.17
456 0.17
457 0.21
458 0.2
459 0.21
460 0.21
461 0.2
462 0.19
463 0.2
464 0.24
465 0.23
466 0.23
467 0.21
468 0.22
469 0.26
470 0.27
471 0.27
472 0.26
473 0.21
474 0.21
475 0.22
476 0.19
477 0.14
478 0.13
479 0.12
480 0.08