FuNGI

A0A1D8PFH7

Protein Details

Accession

A0A1D8PFH7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
59-85	KISNNAKKLAKQLKRQRYKQGSRYGID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 10.5, cyto 7, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR032847 PRPF17 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0034399 C:nuclear periphery GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0000974 C:Prp19 complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000386 F:second spliceosomal transesterification activity GO:0000350 P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step GO:0000389 P:mRNA 3'-splice site recognition GO:0000348 P:mRNA branch site recognition GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	cal:CAALFM_C112750CA -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MSILQGYSSSSSSSSGSSDDEKDNERPPFKKVKTFAGSFQQISSSILENDTFHINNDRKISNNAKKLAKQLKRQRYKQGSRYGIDPWTNNSSDNENNANNNKNNNNNNNENEQNIPSSNIEIEDNNHEEITSVVSTTNNYTFEPSSEFVGEQEFDYQGRSYMTIPKNLPNTSNNNKQTSLNNDDQQQQQQQQQQHIQECFVPKRVIHIFPGHKRGINRLRFFPNSGHLLLSCGNDNLIKLWSIYNTFQGKQYQLLRIFKGHNLPVKDIIFNQSGERFLSCGYDKYIRLWDTKTGEMIKSIKLKSIPNVLLFNPNNKNNTEFIVGLSNFTIEHYDFNSIQYTNPIQIYDHHQGSINDLKSLGLDKFISSSDDKTVRIWSWQINIPIKVITDPSQHSIPCIKIHPQANYIALQSMDNSIKVIHSYGKFKWYKKKFFTGHQIAGYGIEIDFSPDGKILMSGDCNGFAYFWDWKTCKLIKKLKIIDNTITTTTKKKPLTCIVAHPQETSKVAIAGNSGEIYYCD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.14
3	0.16
4	0.19
5	0.22
6	0.24
7	0.26
8	0.3
9	0.33
10	0.39
11	0.44
12	0.47
13	0.44
14	0.48
15	0.56
16	0.56
17	0.61
18	0.59
19	0.61
20	0.62
21	0.64
22	0.63
23	0.62
24	0.62
25	0.53
26	0.5
27	0.41
28	0.34
29	0.33
30	0.29
31	0.21
32	0.16
33	0.16
34	0.17
35	0.16
36	0.17
37	0.19
38	0.17
39	0.17
40	0.25
41	0.26
42	0.29
43	0.34
44	0.34
45	0.33
46	0.4
47	0.49
48	0.49
49	0.55
50	0.58
51	0.6
52	0.62
53	0.7
54	0.73
55	0.71
56	0.72
57	0.75
58	0.78
59	0.82
60	0.85
61	0.86
62	0.87
63	0.89
64	0.87
65	0.87
66	0.84
67	0.75
68	0.7
69	0.63
70	0.58
71	0.52
72	0.44
73	0.38
74	0.36
75	0.35
76	0.34
77	0.32
78	0.3
79	0.29
80	0.32
81	0.31
82	0.27
83	0.32
84	0.36
85	0.4
86	0.38
87	0.42
88	0.44
89	0.47
90	0.54
91	0.56
92	0.59
93	0.58
94	0.59
95	0.59
96	0.55
97	0.48
98	0.43
99	0.36
100	0.32
101	0.26
102	0.24
103	0.18
104	0.18
105	0.16
106	0.14
107	0.14
108	0.12
109	0.14
110	0.17
111	0.18
112	0.18
113	0.17
114	0.16
115	0.15
116	0.15
117	0.15
118	0.1
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.09
123	0.12
124	0.14
125	0.13
126	0.13
127	0.15
128	0.15
129	0.16
130	0.19
131	0.17
132	0.17
133	0.16
134	0.16
135	0.13
136	0.15
137	0.14
138	0.11
139	0.11
140	0.1
141	0.09
142	0.1
143	0.1
144	0.09
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.19
149	0.21
150	0.26
151	0.28
152	0.32
153	0.37
154	0.37
155	0.39
156	0.34
157	0.4
158	0.41
159	0.5
160	0.49
161	0.48
162	0.48
163	0.47
164	0.47
165	0.45
166	0.45
167	0.4
168	0.37
169	0.36
170	0.39
171	0.39
172	0.39
173	0.36
174	0.33
175	0.33
176	0.37
177	0.37
178	0.39
179	0.42
180	0.43
181	0.43
182	0.41
183	0.36
184	0.33
185	0.35
186	0.31
187	0.29
188	0.26
189	0.2
190	0.26
191	0.29
192	0.28
193	0.26
194	0.32
195	0.35
196	0.4
197	0.47
198	0.42
199	0.4
200	0.39
201	0.46
202	0.48
203	0.49
204	0.47
205	0.45
206	0.5
207	0.49
208	0.51
209	0.43
210	0.37
211	0.32
212	0.29
213	0.24
214	0.18
215	0.18
216	0.17
217	0.16
218	0.13
219	0.09
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.09
230	0.1
231	0.15
232	0.17
233	0.18
234	0.2
235	0.21
236	0.21
237	0.23
238	0.25
239	0.25
240	0.28
241	0.3
242	0.28
243	0.3
244	0.3
245	0.28
246	0.29
247	0.27
248	0.26
249	0.25
250	0.25
251	0.26
252	0.25
253	0.24
254	0.2
255	0.21
256	0.18
257	0.17
258	0.16
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.12
263	0.09
264	0.08
265	0.1
266	0.09
267	0.09
268	0.11
269	0.15
270	0.15
271	0.17
272	0.22
273	0.22
274	0.23
275	0.23
276	0.26
277	0.25
278	0.25
279	0.26
280	0.22
281	0.21
282	0.21
283	0.21
284	0.2
285	0.23
286	0.23
287	0.23
288	0.24
289	0.25
290	0.25
291	0.32
292	0.3
293	0.27
294	0.29
295	0.27
296	0.33
297	0.32
298	0.36
299	0.34
300	0.35
301	0.34
302	0.33
303	0.34
304	0.27
305	0.28
306	0.24
307	0.18
308	0.16
309	0.19
310	0.18
311	0.16
312	0.15
313	0.13
314	0.11
315	0.11
316	0.11
317	0.06
318	0.07
319	0.08
320	0.11
321	0.11
322	0.12
323	0.14
324	0.13
325	0.13
326	0.15
327	0.15
328	0.14
329	0.14
330	0.14
331	0.12
332	0.14
333	0.21
334	0.24
335	0.23
336	0.22
337	0.24
338	0.23
339	0.27
340	0.32
341	0.25
342	0.2
343	0.19
344	0.19
345	0.17
346	0.19
347	0.15
348	0.1
349	0.09
350	0.09
351	0.1
352	0.11
353	0.13
354	0.12
355	0.14
356	0.17
357	0.19
358	0.2
359	0.2
360	0.23
361	0.21
362	0.22
363	0.23
364	0.21
365	0.23
366	0.27
367	0.33
368	0.34
369	0.34
370	0.32
371	0.3
372	0.28
373	0.24
374	0.22
375	0.18
376	0.18
377	0.2
378	0.22
379	0.24
380	0.24
381	0.25
382	0.27
383	0.26
384	0.25
385	0.26
386	0.27
387	0.31
388	0.36
389	0.37
390	0.36
391	0.37
392	0.36
393	0.34
394	0.3
395	0.25
396	0.2
397	0.16
398	0.14
399	0.15
400	0.14
401	0.13
402	0.12
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.13
407	0.15
408	0.17
409	0.22
410	0.24
411	0.34
412	0.39
413	0.45
414	0.54
415	0.58
416	0.65
417	0.67
418	0.76
419	0.71
420	0.74
421	0.79
422	0.78
423	0.73
424	0.65
425	0.58
426	0.48
427	0.44
428	0.35
429	0.25
430	0.15
431	0.09
432	0.07
433	0.08
434	0.09
435	0.08
436	0.09
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.09
441	0.08
442	0.1
443	0.11
444	0.12
445	0.13
446	0.14
447	0.15
448	0.14
449	0.13
450	0.12
451	0.14
452	0.16
453	0.17
454	0.24
455	0.24
456	0.26
457	0.34
458	0.39
459	0.44
460	0.5
461	0.58
462	0.59
463	0.69
464	0.75
465	0.76
466	0.78
467	0.75
468	0.71
469	0.67
470	0.63
471	0.56
472	0.49
473	0.44
474	0.41
475	0.42
476	0.45
477	0.46
478	0.46
479	0.51
480	0.58
481	0.65
482	0.63
483	0.66
484	0.67
485	0.7
486	0.67
487	0.61
488	0.54
489	0.49
490	0.47
491	0.4
492	0.31
493	0.24
494	0.23
495	0.21
496	0.2
497	0.17
498	0.17
499	0.15
500	0.13

A0A1D8PFH7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer