Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CPR2

Protein Details
Accession B0CPR2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-97DEDGVRERRRRTRSPPPPVKRPSPVYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-92GVRERRRRTRSPPPPVKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR029123  RBM39_linker  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_181470  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15519  RBM39linker  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12284  RRM2_RBM23_RBM39  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MEERYKRKRSDGDPDDHPPPPPPPVGLPPPPPPPRDSPRSERRGGDRLPVDKDEFDDSPGYRRDNGRRPRDDEDGVRERRRRTRSPPPPVKRPSPVYEAPPEEPYNPDEPKEDDSEARSVFVSQLAARLTARDLGYFFEDKLGEGTVMDSRIVTDRLSRRSKGIGYVEFRTIDHVEKALALSGTVVMGLPIMVQLTESERNKLHPGDGSLNLPPGVTASHGAILYVGSLHFNLTESDIKQVFEPFGELEFVDLHRDPMTGRSKGYAFVQYKRSEDARMALEQMEGFELAGRTLRVNTVHEKGTARYTQQDSLDEAGGGNLNAASRQALMQKLARTEAPPTFTEPVARPNIPQAMQSRSVLLKNMFDPEEETERDWDKELADDVKVECENKYGKVEAIKVERETQGEIYLKFDSIESAKQAIQGLNGRWFGGRQVSAAFISDAIMQAHQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.7
3 0.62
4 0.56
5 0.48
6 0.42
7 0.4
8 0.35
9 0.31
10 0.31
11 0.37
12 0.43
13 0.46
14 0.49
15 0.51
16 0.59
17 0.63
18 0.6
19 0.58
20 0.58
21 0.6
22 0.62
23 0.63
24 0.63
25 0.68
26 0.73
27 0.73
28 0.71
29 0.7
30 0.7
31 0.64
32 0.63
33 0.6
34 0.57
35 0.57
36 0.55
37 0.5
38 0.42
39 0.42
40 0.38
41 0.32
42 0.29
43 0.27
44 0.23
45 0.26
46 0.29
47 0.3
48 0.29
49 0.36
50 0.43
51 0.5
52 0.59
53 0.64
54 0.68
55 0.72
56 0.73
57 0.72
58 0.68
59 0.64
60 0.62
61 0.61
62 0.6
63 0.62
64 0.62
65 0.62
66 0.66
67 0.69
68 0.68
69 0.68
70 0.72
71 0.75
72 0.81
73 0.85
74 0.85
75 0.87
76 0.86
77 0.85
78 0.82
79 0.78
80 0.72
81 0.68
82 0.63
83 0.58
84 0.58
85 0.55
86 0.49
87 0.47
88 0.43
89 0.37
90 0.35
91 0.33
92 0.31
93 0.28
94 0.26
95 0.24
96 0.25
97 0.27
98 0.29
99 0.27
100 0.23
101 0.24
102 0.27
103 0.25
104 0.23
105 0.2
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.09
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.14
127 0.13
128 0.14
129 0.13
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.1
140 0.09
141 0.15
142 0.19
143 0.28
144 0.33
145 0.33
146 0.34
147 0.37
148 0.38
149 0.37
150 0.37
151 0.35
152 0.34
153 0.35
154 0.35
155 0.32
156 0.31
157 0.28
158 0.24
159 0.19
160 0.16
161 0.14
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.09
166 0.08
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.02
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.03
181 0.03
182 0.06
183 0.12
184 0.13
185 0.15
186 0.16
187 0.18
188 0.2
189 0.2
190 0.19
191 0.15
192 0.17
193 0.19
194 0.2
195 0.2
196 0.18
197 0.18
198 0.16
199 0.14
200 0.11
201 0.08
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.07
221 0.09
222 0.09
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.11
229 0.09
230 0.1
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.15
245 0.2
246 0.19
247 0.19
248 0.21
249 0.21
250 0.22
251 0.24
252 0.25
253 0.23
254 0.26
255 0.32
256 0.32
257 0.33
258 0.35
259 0.34
260 0.27
261 0.25
262 0.24
263 0.2
264 0.18
265 0.18
266 0.16
267 0.15
268 0.13
269 0.13
270 0.1
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.12
283 0.17
284 0.19
285 0.2
286 0.22
287 0.23
288 0.23
289 0.27
290 0.26
291 0.23
292 0.26
293 0.28
294 0.3
295 0.3
296 0.3
297 0.27
298 0.26
299 0.25
300 0.19
301 0.16
302 0.12
303 0.11
304 0.09
305 0.07
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.07
313 0.1
314 0.11
315 0.14
316 0.17
317 0.2
318 0.21
319 0.22
320 0.22
321 0.21
322 0.24
323 0.24
324 0.24
325 0.22
326 0.25
327 0.26
328 0.25
329 0.28
330 0.24
331 0.28
332 0.3
333 0.3
334 0.26
335 0.29
336 0.34
337 0.31
338 0.34
339 0.3
340 0.3
341 0.33
342 0.32
343 0.31
344 0.28
345 0.28
346 0.28
347 0.26
348 0.24
349 0.22
350 0.26
351 0.24
352 0.21
353 0.23
354 0.23
355 0.27
356 0.25
357 0.25
358 0.24
359 0.26
360 0.27
361 0.27
362 0.23
363 0.18
364 0.19
365 0.2
366 0.18
367 0.17
368 0.17
369 0.16
370 0.19
371 0.2
372 0.19
373 0.17
374 0.19
375 0.21
376 0.22
377 0.25
378 0.22
379 0.23
380 0.27
381 0.31
382 0.33
383 0.37
384 0.38
385 0.37
386 0.4
387 0.4
388 0.37
389 0.36
390 0.31
391 0.3
392 0.29
393 0.27
394 0.26
395 0.25
396 0.23
397 0.21
398 0.19
399 0.17
400 0.16
401 0.18
402 0.18
403 0.2
404 0.2
405 0.22
406 0.25
407 0.23
408 0.25
409 0.28
410 0.28
411 0.32
412 0.33
413 0.31
414 0.29
415 0.29
416 0.27
417 0.28
418 0.25
419 0.2
420 0.2
421 0.22
422 0.22
423 0.23
424 0.2
425 0.13
426 0.13
427 0.13
428 0.13