Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DB21

Protein Details
Accession B0DB21    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-41ASSIQPPASKKRKWNNNPTSTVQHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_327429  -  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MAGRSVISYDDITLPPAASSIQPPASKKRKWNNNPTSTVQHWDDPTPSIHGGGPSNKQTKAKDKEVVFDDDEAEREDGESRELTHEEIWDDSALVDAWNAAMEEYEAYNGPDKGTMISQDEAFSRALSAMYWGGYWTAMYHCQRQLSGNVIASTVTAGGNDQANVDDEDMVYEEEEEEEEFVSTQSSAQVQPQKIECSPHAFVSMNEHLSDTVAQRIKLQSGKRALLFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.13
4 0.12
5 0.1
6 0.12
7 0.15
8 0.2
9 0.24
10 0.27
11 0.37
12 0.46
13 0.51
14 0.59
15 0.64
16 0.7
17 0.76
18 0.85
19 0.85
20 0.86
21 0.86
22 0.81
23 0.78
24 0.69
25 0.65
26 0.56
27 0.49
28 0.41
29 0.37
30 0.33
31 0.27
32 0.26
33 0.24
34 0.21
35 0.18
36 0.17
37 0.17
38 0.19
39 0.21
40 0.25
41 0.28
42 0.32
43 0.34
44 0.38
45 0.4
46 0.47
47 0.51
48 0.53
49 0.53
50 0.5
51 0.53
52 0.52
53 0.52
54 0.43
55 0.36
56 0.3
57 0.24
58 0.23
59 0.19
60 0.15
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.04
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.11
126 0.13
127 0.17
128 0.18
129 0.2
130 0.2
131 0.21
132 0.22
133 0.21
134 0.22
135 0.2
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.13
141 0.09
142 0.06
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.15
176 0.23
177 0.23
178 0.28
179 0.31
180 0.34
181 0.34
182 0.38
183 0.34
184 0.34
185 0.35
186 0.32
187 0.32
188 0.28
189 0.27
190 0.31
191 0.33
192 0.28
193 0.26
194 0.25
195 0.22
196 0.22
197 0.24
198 0.17
199 0.2
200 0.21
201 0.21
202 0.24
203 0.27
204 0.31
205 0.36
206 0.38
207 0.39
208 0.44
209 0.49