FuNGI

Q5A220

Protein Details

Accession

Q5A220

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
199-220	NNNKCICKSKVNKIPRPRNAFI	Hydrophilic
274-298	AKKYPGYRYTPRRNGRNKNCPVCKN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009071 HMG_box_dom IPR036910 HMG_box_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003700 F:DNA-binding transcription factor activity GO:0000981 F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific GO:0003690 F:double-stranded DNA binding GO:0000978 F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding GO:0009653 P:anatomical structure morphogenesis GO:0030154 P:cell differentiation GO:0009267 P:cellular response to starvation GO:0030447 P:filamentous growth GO:0044182 P:filamentous growth of a population of unicellular organisms GO:0036180 P:filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to biotic stimulus GO:0036170 P:filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to starvation GO:0045892 P:negative regulation of DNA-templated transcription GO:1900429 P:negative regulation of filamentous growth of a population of unicellular organisms GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	cal:CAALFM_CR02640WA -
Pfam	View protein in Pfam PF00505 HMG_box
PROSITE	View protein in PROSITE PS50118 HMG_BOX_2
CDD	cd01389 HMG-box_ROX1-like

Amino Acid Sequences

MSTAIYYSTHNNMHTNDDITNGSGSTTSGNPGANPSNPNHTNAGATINNNSNIGLNSANKNHTTLLPSLAHIMPSNSNNTTNSGSSIDISSTLINPYSSGAAAAAAAVGGGNGGYYHPPPPHSQQQQQQQFDTSYSNQTTPTSAYTNFNNDSTHSPTDISMQQNMNNLASSSGNMSIGGGIDGNFSHNNNNNNNNNNNNNNKCICKSKVNKIPRPRNAFILFRQKYHQMVLDEGTVIRTNPEVSRELGRRWRGLSPQEKEHWNNLAEEEKKNHAKKYPGYRYTPRRNGRNKNCPVCKNKPLPNNKSNSISGMSGSGGGGGSISGASSLSGGLTSRDNSITNANAIDYQQQQLQQQQQQQQQQAIQFQSLPPDQYQQLIKQQQQQLQLQAQLNGGGGGGGITSNPQTIPQYITNGNYPSYIISPNPYSTTSTTAPTTTTTTTTNASSIGLSVPPTATTTSTSSQPTSANSQLHFYEAEKLSPVSSTHHQSSISEIAAQQQQQQQQQQFMYNTNYSTIPPNNTTTMQQHSAGTGNDYSLNGNNSGNTGYDNRYGYGQPMIITGQSQQGLQVQQQGQHYNSGLHAAQHYQQQQQQHHQQQPPQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.33
3	0.28
4	0.27
5	0.26
6	0.23
7	0.22
8	0.16
9	0.14
10	0.12
11	0.12
12	0.11
13	0.11
14	0.12
15	0.14
16	0.14
17	0.14
18	0.19
19	0.23
20	0.24
21	0.27
22	0.28
23	0.36
24	0.37
25	0.4
26	0.38
27	0.34
28	0.32
29	0.3
30	0.32
31	0.25
32	0.25
33	0.26
34	0.28
35	0.28
36	0.27
37	0.26
38	0.22
39	0.19
40	0.2
41	0.18
42	0.17
43	0.21
44	0.25
45	0.29
46	0.28
47	0.3
48	0.3
49	0.29
50	0.3
51	0.26
52	0.27
53	0.25
54	0.25
55	0.27
56	0.26
57	0.24
58	0.21
59	0.22
60	0.2
61	0.21
62	0.26
63	0.23
64	0.25
65	0.25
66	0.28
67	0.29
68	0.25
69	0.25
70	0.22
71	0.2
72	0.19
73	0.19
74	0.15
75	0.13
76	0.13
77	0.12
78	0.11
79	0.12
80	0.11
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.1
86	0.09
87	0.08
88	0.07
89	0.07
90	0.06
91	0.05
92	0.04
93	0.03
94	0.03
95	0.02
96	0.02
97	0.02
98	0.02
99	0.02
100	0.03
101	0.05
102	0.06
103	0.1
104	0.12
105	0.15
106	0.2
107	0.27
108	0.36
109	0.42
110	0.49
111	0.54
112	0.63
113	0.7
114	0.7
115	0.64
116	0.57
117	0.5
118	0.44
119	0.4
120	0.31
121	0.28
122	0.26
123	0.25
124	0.23
125	0.23
126	0.23
127	0.2
128	0.21
129	0.18
130	0.18
131	0.2
132	0.21
133	0.27
134	0.27
135	0.26
136	0.24
137	0.23
138	0.25
139	0.28
140	0.28
141	0.23
142	0.22
143	0.21
144	0.24
145	0.27
146	0.25
147	0.24
148	0.24
149	0.25
150	0.29
151	0.29
152	0.26
153	0.21
154	0.19
155	0.15
156	0.14
157	0.12
158	0.1
159	0.09
160	0.09
161	0.08
162	0.08
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.05
167	0.04
168	0.05
169	0.05
170	0.07
171	0.08
172	0.08
173	0.12
174	0.17
175	0.22
176	0.26
177	0.34
178	0.36
179	0.41
180	0.44
181	0.45
182	0.46
183	0.48
184	0.52
185	0.47
186	0.47
187	0.44
188	0.43
189	0.41
190	0.41
191	0.39
192	0.4
193	0.45
194	0.5
195	0.57
196	0.65
197	0.71
198	0.76
199	0.82
200	0.81
201	0.84
202	0.75
203	0.73
204	0.67
205	0.62
206	0.57
207	0.58
208	0.5
209	0.42
210	0.44
211	0.39
212	0.36
213	0.34
214	0.32
215	0.21
216	0.22
217	0.21
218	0.19
219	0.16
220	0.15
221	0.14
222	0.1
223	0.09
224	0.08
225	0.07
226	0.08
227	0.08
228	0.11
229	0.11
230	0.13
231	0.18
232	0.2
233	0.24
234	0.3
235	0.32
236	0.31
237	0.32
238	0.34
239	0.33
240	0.39
241	0.44
242	0.41
243	0.44
244	0.46
245	0.48
246	0.47
247	0.46
248	0.42
249	0.34
250	0.31
251	0.26
252	0.28
253	0.25
254	0.24
255	0.24
256	0.25
257	0.31
258	0.33
259	0.34
260	0.33
261	0.36
262	0.41
263	0.5
264	0.55
265	0.53
266	0.58
267	0.64
268	0.69
269	0.74
270	0.77
271	0.73
272	0.72
273	0.76
274	0.8
275	0.82
276	0.83
277	0.81
278	0.81
279	0.82
280	0.79
281	0.78
282	0.75
283	0.73
284	0.7
285	0.68
286	0.68
287	0.7
288	0.71
289	0.7
290	0.67
291	0.62
292	0.58
293	0.51
294	0.44
295	0.36
296	0.28
297	0.21
298	0.16
299	0.13
300	0.09
301	0.09
302	0.07
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.03
307	0.03
308	0.02
309	0.02
310	0.02
311	0.02
312	0.02
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.04
319	0.05
320	0.06
321	0.07
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.12
326	0.11
327	0.11
328	0.1
329	0.1
330	0.09
331	0.09
332	0.11
333	0.1
334	0.11
335	0.12
336	0.14
337	0.14
338	0.18
339	0.23
340	0.25
341	0.3
342	0.36
343	0.41
344	0.45
345	0.46
346	0.44
347	0.41
348	0.38
349	0.36
350	0.3
351	0.24
352	0.19
353	0.17
354	0.19
355	0.17
356	0.16
357	0.13
358	0.15
359	0.15
360	0.17
361	0.19
362	0.18
363	0.25
364	0.29
365	0.32
366	0.37
367	0.42
368	0.44
369	0.48
370	0.47
371	0.43
372	0.4
373	0.42
374	0.35
375	0.31
376	0.27
377	0.22
378	0.19
379	0.15
380	0.12
381	0.07
382	0.05
383	0.04
384	0.03
385	0.02
386	0.02
387	0.03
388	0.03
389	0.04
390	0.04
391	0.06
392	0.07
393	0.08
394	0.13
395	0.14
396	0.17
397	0.19
398	0.2
399	0.22
400	0.22
401	0.22
402	0.18
403	0.17
404	0.14
405	0.14
406	0.14
407	0.11
408	0.13
409	0.15
410	0.16
411	0.17
412	0.18
413	0.19
414	0.19
415	0.24
416	0.22
417	0.22
418	0.22
419	0.2
420	0.2
421	0.19
422	0.2
423	0.16
424	0.17
425	0.16
426	0.17
427	0.18
428	0.18
429	0.17
430	0.14
431	0.13
432	0.11
433	0.1
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.09
438	0.08
439	0.08
440	0.1
441	0.1
442	0.1
443	0.12
444	0.15
445	0.16
446	0.19
447	0.21
448	0.21
449	0.22
450	0.22
451	0.22
452	0.24
453	0.28
454	0.27
455	0.26
456	0.28
457	0.26
458	0.26
459	0.25
460	0.2
461	0.23
462	0.21
463	0.21
464	0.19
465	0.19
466	0.18
467	0.19
468	0.18
469	0.15
470	0.19
471	0.24
472	0.26
473	0.28
474	0.28
475	0.27
476	0.31
477	0.3
478	0.25
479	0.2
480	0.18
481	0.2
482	0.23
483	0.24
484	0.24
485	0.26
486	0.3
487	0.35
488	0.42
489	0.41
490	0.43
491	0.44
492	0.44
493	0.41
494	0.4
495	0.4
496	0.34
497	0.32
498	0.28
499	0.27
500	0.23
501	0.27
502	0.27
503	0.26
504	0.28
505	0.3
506	0.32
507	0.33
508	0.35
509	0.33
510	0.36
511	0.34
512	0.33
513	0.3
514	0.28
515	0.29
516	0.26
517	0.25
518	0.19
519	0.16
520	0.16
521	0.16
522	0.17
523	0.17
524	0.18
525	0.17
526	0.17
527	0.16
528	0.16
529	0.16
530	0.14
531	0.14
532	0.15
533	0.17
534	0.22
535	0.23
536	0.23
537	0.25
538	0.25
539	0.24
540	0.24
541	0.22
542	0.17
543	0.17
544	0.17
545	0.15
546	0.15
547	0.15
548	0.16
549	0.16
550	0.15
551	0.15
552	0.19
553	0.2
554	0.21
555	0.28
556	0.25
557	0.29
558	0.34
559	0.37
560	0.34
561	0.36
562	0.36
563	0.29
564	0.27
565	0.27
566	0.23
567	0.21
568	0.22
569	0.2
570	0.23
571	0.29
572	0.32
573	0.34
574	0.37
575	0.43
576	0.48
577	0.55
578	0.63
579	0.65
580	0.7

Q5A220

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer