Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D3V2

Protein Details
Accession B0D3V2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
354-375AAKAKLKKERREEQEQNVKRKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-366KKSKKEAAAQTAVHAAKAKLKKERREE
441-441R
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_316066  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARKRKNRTHLKGGAAQEPTKNGVPKSFIIKHGQVGSSVSQLVRDMRKVLEPNTASRLKERTRNKLKDYLVLAPTLQVTHLLAFTLTPIAPSLRIVRLSDGPTLSFRIERYSLIKDILNTSRRARSVGMEYLSPPLLVLASFPPPSPTTPPHLPLLMKSFQSIFPPLSPNTLSLSSARRVVLISYNSERGTVDFRHYVIKVKPYGVSKRVRRILEGATNSNPNSGVLDLGNEKDVADFLLRKRGDPGPDGGYESAASSTESVAGDDRDAVDLAEDYVGRNNKKGQKRAVRLDEVGPRMELRLVKITEGVPGKEGGVIYHEFGTIFTILFSTRFLPRSTVKKSKKEAAAQTAVHAAKAKLKKERREEQEQNVKRKAASSKTNSKNALVDAPSGDEMDEDENSGDDCLGEWDDDEEISDGDASDVNDDESSEDERPTKKVKFRGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.67
3 0.61
4 0.53
5 0.47
6 0.44
7 0.41
8 0.4
9 0.34
10 0.34
11 0.35
12 0.35
13 0.42
14 0.43
15 0.43
16 0.46
17 0.47
18 0.48
19 0.49
20 0.46
21 0.38
22 0.35
23 0.32
24 0.27
25 0.26
26 0.21
27 0.16
28 0.17
29 0.22
30 0.23
31 0.24
32 0.24
33 0.24
34 0.31
35 0.34
36 0.34
37 0.38
38 0.36
39 0.38
40 0.43
41 0.46
42 0.4
43 0.41
44 0.47
45 0.43
46 0.5
47 0.54
48 0.58
49 0.65
50 0.73
51 0.74
52 0.75
53 0.72
54 0.71
55 0.66
56 0.63
57 0.53
58 0.46
59 0.39
60 0.31
61 0.29
62 0.22
63 0.17
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.14
80 0.15
81 0.18
82 0.18
83 0.21
84 0.24
85 0.26
86 0.28
87 0.25
88 0.23
89 0.22
90 0.24
91 0.22
92 0.19
93 0.17
94 0.18
95 0.18
96 0.19
97 0.22
98 0.24
99 0.24
100 0.25
101 0.26
102 0.22
103 0.26
104 0.31
105 0.31
106 0.3
107 0.32
108 0.36
109 0.35
110 0.36
111 0.32
112 0.28
113 0.3
114 0.32
115 0.29
116 0.25
117 0.25
118 0.25
119 0.24
120 0.2
121 0.14
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.13
131 0.14
132 0.16
133 0.2
134 0.21
135 0.25
136 0.28
137 0.31
138 0.3
139 0.32
140 0.3
141 0.28
142 0.31
143 0.26
144 0.23
145 0.21
146 0.21
147 0.19
148 0.21
149 0.21
150 0.16
151 0.15
152 0.18
153 0.17
154 0.19
155 0.18
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.17
160 0.16
161 0.19
162 0.17
163 0.19
164 0.18
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.17
169 0.16
170 0.18
171 0.18
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.19
176 0.15
177 0.17
178 0.15
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.18
183 0.19
184 0.22
185 0.21
186 0.25
187 0.24
188 0.24
189 0.26
190 0.28
191 0.33
192 0.35
193 0.41
194 0.41
195 0.49
196 0.54
197 0.51
198 0.48
199 0.46
200 0.43
201 0.41
202 0.39
203 0.32
204 0.28
205 0.29
206 0.27
207 0.25
208 0.2
209 0.14
210 0.11
211 0.08
212 0.07
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.07
225 0.07
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.2
230 0.22
231 0.24
232 0.24
233 0.26
234 0.21
235 0.22
236 0.23
237 0.2
238 0.17
239 0.14
240 0.13
241 0.1
242 0.07
243 0.07
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.09
264 0.13
265 0.13
266 0.15
267 0.22
268 0.3
269 0.38
270 0.44
271 0.5
272 0.57
273 0.64
274 0.72
275 0.73
276 0.69
277 0.63
278 0.62
279 0.58
280 0.5
281 0.42
282 0.33
283 0.26
284 0.22
285 0.23
286 0.18
287 0.14
288 0.19
289 0.18
290 0.18
291 0.2
292 0.2
293 0.23
294 0.24
295 0.22
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.15
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.12
319 0.14
320 0.15
321 0.19
322 0.24
323 0.32
324 0.4
325 0.49
326 0.54
327 0.62
328 0.67
329 0.72
330 0.74
331 0.74
332 0.73
333 0.71
334 0.69
335 0.6
336 0.55
337 0.53
338 0.45
339 0.38
340 0.32
341 0.24
342 0.25
343 0.31
344 0.35
345 0.38
346 0.47
347 0.55
348 0.63
349 0.72
350 0.72
351 0.77
352 0.79
353 0.8
354 0.82
355 0.81
356 0.8
357 0.76
358 0.7
359 0.59
360 0.57
361 0.54
362 0.52
363 0.53
364 0.53
365 0.59
366 0.65
367 0.73
368 0.69
369 0.64
370 0.59
371 0.51
372 0.48
373 0.39
374 0.33
375 0.26
376 0.26
377 0.24
378 0.21
379 0.19
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.08
390 0.06
391 0.06
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.1
398 0.09
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.09
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.11
415 0.14
416 0.14
417 0.16
418 0.19
419 0.22
420 0.27
421 0.33
422 0.4
423 0.44