Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M1WGV3

Protein Details
Accession M1WGV3    Localization Confidence High Confidence Score 24.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-40EVDTPNREKRSKKDKSSKSKSERKRAREEDAAABasic
65-91NGQDTIKKEKKARKSSKKESRLKAEDDBasic
108-132PSISEKSMTKKKKVKKEQDATQMDEHydrophilic
137-165IEHGASKSEKKEKKKNKKREPEPSPPAQPBasic
419-443RLAQVRREKKGGRKMERRRAPDFSMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-50REKRSKKDKSSKSKSERKRAREEDAAADGERKHKKTK
71-86KKEKKARKSSKKESRL
117-122KKKKVK
143-157KSEKKEKKKNKKREP
424-437RREKKGGRKMERRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSTVASPEVDTPNREKRSKKDKSSKSKSERKRAREEDAAADGERKHKKTKSILADATAPKEEPDNGQDTIKKEKKARKSSKKESRLKAEDDAVQDDVLHSQATAAAAPSISEKSMTKKKKVKKEQDATQMDEAADPIEHGASKSEKKEKKKNKKREPEPSPPAQPEADDGDAMEIDEPAEATPSGIYQPPDMPANPQFPFFKQTVSLYEPIYPNGWAQPVTNAQDHHLQQLQNKYVPSLRGVLLDYANVSLGPEPGRAGAATDDESPTTLLSKGEYAVGFGWITADVGLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEASRLPPSWKWVSNESPDASGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWIDGSGTRVKGKVRFRIRNFDAGTSGETSYLSLEGTMLDKTSEKKLIQEEARLAQVRREKKGGRKMERRRAPDFSMTRFAMQEDENQGDDLAAAPAAESKIVKFDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.59
4 0.68
5 0.75
6 0.79
7 0.8
8 0.83
9 0.89
10 0.93
11 0.94
12 0.93
13 0.93
14 0.93
15 0.93
16 0.93
17 0.9
18 0.9
19 0.87
20 0.84
21 0.82
22 0.76
23 0.7
24 0.64
25 0.58
26 0.47
27 0.43
28 0.36
29 0.36
30 0.4
31 0.37
32 0.41
33 0.44
34 0.51
35 0.58
36 0.66
37 0.68
38 0.7
39 0.69
40 0.64
41 0.67
42 0.62
43 0.56
44 0.48
45 0.38
46 0.29
47 0.27
48 0.26
49 0.21
50 0.22
51 0.22
52 0.22
53 0.25
54 0.28
55 0.29
56 0.39
57 0.41
58 0.43
59 0.48
60 0.55
61 0.63
62 0.71
63 0.79
64 0.79
65 0.85
66 0.9
67 0.93
68 0.94
69 0.94
70 0.91
71 0.91
72 0.86
73 0.8
74 0.73
75 0.67
76 0.6
77 0.53
78 0.47
79 0.37
80 0.29
81 0.25
82 0.2
83 0.16
84 0.12
85 0.09
86 0.06
87 0.05
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.17
101 0.27
102 0.34
103 0.42
104 0.5
105 0.59
106 0.68
107 0.78
108 0.82
109 0.84
110 0.87
111 0.86
112 0.88
113 0.84
114 0.78
115 0.68
116 0.59
117 0.47
118 0.38
119 0.29
120 0.18
121 0.13
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.08
128 0.11
129 0.15
130 0.21
131 0.3
132 0.37
133 0.46
134 0.57
135 0.66
136 0.74
137 0.81
138 0.87
139 0.88
140 0.92
141 0.94
142 0.94
143 0.92
144 0.91
145 0.88
146 0.83
147 0.79
148 0.69
149 0.61
150 0.5
151 0.41
152 0.32
153 0.29
154 0.22
155 0.15
156 0.13
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.08
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.06
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.13
178 0.12
179 0.15
180 0.17
181 0.21
182 0.2
183 0.22
184 0.22
185 0.21
186 0.24
187 0.21
188 0.19
189 0.15
190 0.16
191 0.18
192 0.2
193 0.2
194 0.18
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.19
199 0.16
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.13
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.16
211 0.22
212 0.22
213 0.22
214 0.22
215 0.21
216 0.22
217 0.28
218 0.28
219 0.25
220 0.24
221 0.23
222 0.21
223 0.21
224 0.19
225 0.16
226 0.14
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.08
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.07
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.13
310 0.16
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.18
315 0.17
316 0.23
317 0.26
318 0.28
319 0.3
320 0.34
321 0.39
322 0.41
323 0.45
324 0.4
325 0.36
326 0.32
327 0.3
328 0.25
329 0.2
330 0.15
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.11
349 0.1
350 0.11
351 0.13
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.12
358 0.15
359 0.15
360 0.16
361 0.16
362 0.18
363 0.22
364 0.29
365 0.34
366 0.41
367 0.49
368 0.58
369 0.62
370 0.71
371 0.71
372 0.73
373 0.68
374 0.61
375 0.52
376 0.43
377 0.4
378 0.31
379 0.27
380 0.18
381 0.16
382 0.14
383 0.12
384 0.11
385 0.09
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.09
394 0.12
395 0.17
396 0.23
397 0.22
398 0.27
399 0.31
400 0.39
401 0.4
402 0.44
403 0.43
404 0.4
405 0.46
406 0.45
407 0.41
408 0.38
409 0.43
410 0.44
411 0.45
412 0.51
413 0.51
414 0.57
415 0.67
416 0.72
417 0.75
418 0.79
419 0.85
420 0.88
421 0.9
422 0.87
423 0.84
424 0.8
425 0.76
426 0.75
427 0.7
428 0.65
429 0.63
430 0.58
431 0.53
432 0.46
433 0.41
434 0.34
435 0.29
436 0.29
437 0.26
438 0.27
439 0.26
440 0.25
441 0.24
442 0.21
443 0.2
444 0.14
445 0.1
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.08
450 0.08
451 0.1
452 0.1
453 0.1