Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PQA3

Protein Details
Accession A0A1D8PQA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-199EAKFDNKKENPKKKQDSLSKAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG cal:CAALFM_C603910CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKDFPAKPPHPSTLESIDLSKLDPQLVLDKASQRWLFEEGDQEYEYDYIKEQWVNTSKRSLSEDDTNKEDIKRQRKQDMSKLKEELNSLKQKKKNSSIFISNLPVDSGFSEIEEAFSKYGKISVGKDEKPRIKMYTNEKGSFKGEALIIYSNPESALLAIEMMDNTQYNGNTIRVEEAKFDNKKENPKKKQDSLSKAVIIRNMVRKEELANDIHIKQDIIDDIKEECKNIGISDIEDIVFNEENATVLVKFSKEESLLLCIKKFHNRYYDGLTLDVQESKVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.42
4 0.37
5 0.32
6 0.28
7 0.27
8 0.25
9 0.2
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.2
17 0.24
18 0.25
19 0.33
20 0.32
21 0.28
22 0.29
23 0.3
24 0.28
25 0.25
26 0.3
27 0.23
28 0.26
29 0.25
30 0.23
31 0.2
32 0.19
33 0.18
34 0.13
35 0.12
36 0.1
37 0.12
38 0.14
39 0.13
40 0.21
41 0.28
42 0.31
43 0.33
44 0.38
45 0.36
46 0.38
47 0.42
48 0.37
49 0.34
50 0.4
51 0.44
52 0.41
53 0.43
54 0.42
55 0.4
56 0.38
57 0.4
58 0.39
59 0.43
60 0.47
61 0.51
62 0.58
63 0.64
64 0.71
65 0.74
66 0.76
67 0.72
68 0.71
69 0.67
70 0.6
71 0.55
72 0.51
73 0.46
74 0.44
75 0.48
76 0.46
77 0.51
78 0.53
79 0.57
80 0.62
81 0.66
82 0.65
83 0.61
84 0.62
85 0.6
86 0.59
87 0.55
88 0.5
89 0.41
90 0.33
91 0.27
92 0.21
93 0.14
94 0.12
95 0.1
96 0.07
97 0.06
98 0.07
99 0.06
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.18
112 0.24
113 0.28
114 0.34
115 0.4
116 0.43
117 0.45
118 0.46
119 0.41
120 0.37
121 0.4
122 0.42
123 0.45
124 0.46
125 0.45
126 0.43
127 0.42
128 0.4
129 0.35
130 0.27
131 0.18
132 0.13
133 0.1
134 0.11
135 0.1
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.04
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.14
165 0.16
166 0.23
167 0.25
168 0.26
169 0.32
170 0.34
171 0.45
172 0.54
173 0.61
174 0.62
175 0.72
176 0.78
177 0.78
178 0.84
179 0.83
180 0.8
181 0.75
182 0.71
183 0.65
184 0.59
185 0.53
186 0.45
187 0.38
188 0.35
189 0.37
190 0.33
191 0.3
192 0.28
193 0.27
194 0.27
195 0.29
196 0.28
197 0.21
198 0.22
199 0.24
200 0.23
201 0.24
202 0.22
203 0.18
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.19
212 0.19
213 0.18
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.16
218 0.17
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.15
241 0.14
242 0.16
243 0.17
244 0.21
245 0.26
246 0.27
247 0.27
248 0.27
249 0.31
250 0.39
251 0.43
252 0.44
253 0.47
254 0.49
255 0.53
256 0.57
257 0.58
258 0.49
259 0.46
260 0.4
261 0.34
262 0.31
263 0.28