Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CYN2

Protein Details
Accession B0CYN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
267-296RDHDRERIRERSRKDRERTRDRERDRDGNRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-292RERIRERSRKDRERTRDRERDR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033757  WTAP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0080009  P:mRNA methylation  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_311934  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17098  Wtap  
Amino Acid Sequences MELPSLRELELESHLRERDTRLAELTDEVTRLRQYLSTQPGPSTADLVTLPPALISILLPHFKSSAASATSSHSTVTAALTQRSRLLQEENDEFYELLKRGETGRLKEEVRGLRKVVEKLEGALRESHQVINSLSTELDKSYDTLMNSSRQVNSVNNSKSHARSPRNAYNSLPQVGNGNGAGKLPPTGPRAYKKPRLSEPQASPPSRPNNTLPSHKSQIHSNASTRSGDRRDYLSRPNNEQLKSSRSKIDVDEDDRESPALPTERVRDHDRERIRERSRKDRERTRDRERDRDGNRTTASRRNGSHTSSSVRGGPVGGGGGSSRTINDRSTVASTNLIHGGDRTLAERMGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.3
4 0.32
5 0.34
6 0.35
7 0.34
8 0.32
9 0.33
10 0.32
11 0.32
12 0.3
13 0.23
14 0.2
15 0.18
16 0.18
17 0.17
18 0.17
19 0.16
20 0.15
21 0.17
22 0.25
23 0.33
24 0.37
25 0.38
26 0.38
27 0.39
28 0.4
29 0.37
30 0.3
31 0.22
32 0.17
33 0.16
34 0.16
35 0.15
36 0.13
37 0.12
38 0.09
39 0.09
40 0.07
41 0.07
42 0.06
43 0.08
44 0.11
45 0.14
46 0.14
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.16
51 0.14
52 0.15
53 0.14
54 0.15
55 0.16
56 0.19
57 0.21
58 0.2
59 0.19
60 0.15
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.17
67 0.18
68 0.19
69 0.21
70 0.21
71 0.22
72 0.19
73 0.21
74 0.21
75 0.25
76 0.28
77 0.28
78 0.27
79 0.27
80 0.24
81 0.21
82 0.22
83 0.18
84 0.14
85 0.12
86 0.11
87 0.12
88 0.2
89 0.23
90 0.23
91 0.26
92 0.31
93 0.31
94 0.33
95 0.38
96 0.38
97 0.38
98 0.38
99 0.35
100 0.35
101 0.39
102 0.39
103 0.34
104 0.3
105 0.26
106 0.25
107 0.29
108 0.25
109 0.21
110 0.2
111 0.19
112 0.18
113 0.19
114 0.18
115 0.14
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.08
125 0.09
126 0.07
127 0.07
128 0.09
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.14
133 0.15
134 0.17
135 0.18
136 0.16
137 0.15
138 0.17
139 0.17
140 0.18
141 0.24
142 0.24
143 0.23
144 0.26
145 0.27
146 0.27
147 0.32
148 0.37
149 0.33
150 0.38
151 0.45
152 0.5
153 0.52
154 0.52
155 0.47
156 0.45
157 0.44
158 0.39
159 0.31
160 0.23
161 0.2
162 0.18
163 0.18
164 0.11
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.1
173 0.12
174 0.15
175 0.19
176 0.23
177 0.32
178 0.39
179 0.47
180 0.49
181 0.53
182 0.57
183 0.62
184 0.64
185 0.64
186 0.61
187 0.62
188 0.65
189 0.59
190 0.54
191 0.52
192 0.53
193 0.47
194 0.45
195 0.38
196 0.38
197 0.41
198 0.47
199 0.45
200 0.44
201 0.47
202 0.47
203 0.45
204 0.42
205 0.46
206 0.44
207 0.42
208 0.38
209 0.36
210 0.35
211 0.35
212 0.32
213 0.3
214 0.27
215 0.26
216 0.26
217 0.27
218 0.3
219 0.33
220 0.41
221 0.44
222 0.45
223 0.49
224 0.54
225 0.56
226 0.52
227 0.52
228 0.46
229 0.45
230 0.45
231 0.43
232 0.4
233 0.36
234 0.37
235 0.35
236 0.38
237 0.37
238 0.36
239 0.38
240 0.36
241 0.35
242 0.33
243 0.31
244 0.25
245 0.19
246 0.19
247 0.16
248 0.14
249 0.16
250 0.2
251 0.24
252 0.28
253 0.33
254 0.35
255 0.39
256 0.47
257 0.52
258 0.56
259 0.58
260 0.64
261 0.68
262 0.69
263 0.71
264 0.72
265 0.76
266 0.77
267 0.81
268 0.81
269 0.83
270 0.87
271 0.89
272 0.89
273 0.88
274 0.86
275 0.86
276 0.83
277 0.82
278 0.76
279 0.77
280 0.7
281 0.66
282 0.62
283 0.57
284 0.55
285 0.53
286 0.54
287 0.51
288 0.49
289 0.49
290 0.52
291 0.5
292 0.51
293 0.47
294 0.46
295 0.42
296 0.42
297 0.38
298 0.33
299 0.29
300 0.24
301 0.2
302 0.15
303 0.13
304 0.1
305 0.08
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.11
312 0.14
313 0.14
314 0.16
315 0.17
316 0.19
317 0.23
318 0.25
319 0.24
320 0.27
321 0.26
322 0.28
323 0.29
324 0.26
325 0.22
326 0.2
327 0.2
328 0.17
329 0.17
330 0.16
331 0.15