Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PGW7

Protein Details
Accession A0A1D8PGW7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1009-1029AESVLKEKEHQRQDRERIMKLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG cal:CAALFM_C203550CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MTIELDKRRNELHVLNVKAWEGDFTYETVSKLDSSLKKNSTFIKKVKSISNESSSSILKDIQTLSIEKYLSEVLTSLTEALSKVSKSDDILAAMEIVSALHQRFTSQFSPMLLVNIMTAMSNPGPTQVMDEKEETARISRQKNLSKLTMEFYLIGIFTNLKMCSKDTIPDEILVKYGKSASEPIILVVLKDLLNYKIKSGNTLVIVQSFLKRFHHIIYDSNNELLQFEVRNVLQQIFTIYTRAIFETSVELKKRVHQVTEKSKKASIRTGRILEENQIELENVTKLFEKFKSTSEFVSSILDIPLPNELQQHDQDKEEEEPTNTVVEVVKSKSMNEDDLNGVWEDVKEKNFYTVIPSVGELIEAHPNTDEESRSSQSRDGERIQAFLQKMENINSYELDQLVIEFNNLNLNNKATKNRIMKFFVEAASIDSLKYYTRFLKINEMNLSDLIEELINYLDKGFRSQLYQNKLNFKNILFFVEMIKFKMIPTHIIFHKIRKLTLNITSTNNIDILSVFYEHVGRFLLNDPDYKDLMREMIEMLRETSKRPNLKINDKLAINNLLLIVEPPTTKVKSLQTKPELSPKSQFIQRLIRVELNNTSLPLVVNLLKKIHMKQEKECCDTILDCFAHPELINYDNIPALAAVLEAYFSKYKKIVVYTVDTTIENIIRGLELNDYRMNRVRMAQVKFVAEMYNHRVINFKLINDLLYRILCFGHPNNQPLPDNWDVEIDLPDNYFRIQLCCLLLNNLKSIFIDTDIPSKKKAQNRAVELKKRNDINKDLLGVFITFLQYYLFCKEKPLPVELDFKLNDLFAKYKSIPTVKRYDTLQEIGKRLQESIQRKREAESYLDNSDEALVVDDDDDDEDVAEDYDNTDDIDLDEDEGDEEDEDDEDGESEEDNDDESECEDDTSDIENNGVSEEDRMRLEAEKKFMDDLDKEYQKILIDSYDKSSSQTSSNRKKLLMPTPRKIFVEKNQVTPSTDKSKVSFGLLTRKGKTTDIKQLQLPSDTKFAESVLKEKEHQRQDRERIMKLVSNME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.47
3 0.46
4 0.43
5 0.39
6 0.35
7 0.26
8 0.19
9 0.17
10 0.16
11 0.15
12 0.18
13 0.19
14 0.19
15 0.18
16 0.18
17 0.15
18 0.16
19 0.24
20 0.26
21 0.3
22 0.39
23 0.44
24 0.46
25 0.5
26 0.58
27 0.59
28 0.61
29 0.63
30 0.64
31 0.65
32 0.67
33 0.71
34 0.7
35 0.67
36 0.66
37 0.66
38 0.58
39 0.53
40 0.51
41 0.44
42 0.38
43 0.32
44 0.27
45 0.2
46 0.22
47 0.21
48 0.2
49 0.22
50 0.22
51 0.23
52 0.24
53 0.24
54 0.21
55 0.21
56 0.2
57 0.17
58 0.16
59 0.13
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.11
68 0.13
69 0.11
70 0.12
71 0.14
72 0.16
73 0.17
74 0.21
75 0.21
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.17
80 0.16
81 0.14
82 0.09
83 0.07
84 0.06
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.11
90 0.13
91 0.19
92 0.2
93 0.21
94 0.23
95 0.22
96 0.25
97 0.24
98 0.24
99 0.18
100 0.16
101 0.13
102 0.11
103 0.1
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.17
114 0.19
115 0.21
116 0.23
117 0.25
118 0.26
119 0.26
120 0.27
121 0.23
122 0.22
123 0.25
124 0.29
125 0.32
126 0.37
127 0.45
128 0.51
129 0.57
130 0.6
131 0.59
132 0.56
133 0.54
134 0.5
135 0.43
136 0.37
137 0.3
138 0.25
139 0.2
140 0.16
141 0.14
142 0.11
143 0.09
144 0.08
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.15
150 0.19
151 0.2
152 0.25
153 0.24
154 0.3
155 0.29
156 0.31
157 0.31
158 0.27
159 0.28
160 0.23
161 0.2
162 0.15
163 0.15
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.15
168 0.19
169 0.19
170 0.18
171 0.2
172 0.19
173 0.17
174 0.16
175 0.15
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.19
181 0.19
182 0.21
183 0.25
184 0.25
185 0.28
186 0.28
187 0.29
188 0.25
189 0.28
190 0.26
191 0.21
192 0.22
193 0.2
194 0.22
195 0.2
196 0.2
197 0.2
198 0.22
199 0.23
200 0.24
201 0.29
202 0.26
203 0.3
204 0.34
205 0.37
206 0.35
207 0.34
208 0.32
209 0.26
210 0.24
211 0.2
212 0.15
213 0.1
214 0.09
215 0.11
216 0.11
217 0.14
218 0.15
219 0.15
220 0.13
221 0.13
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.09
232 0.1
233 0.14
234 0.18
235 0.22
236 0.23
237 0.24
238 0.25
239 0.31
240 0.39
241 0.37
242 0.38
243 0.4
244 0.48
245 0.57
246 0.66
247 0.66
248 0.6
249 0.61
250 0.59
251 0.56
252 0.56
253 0.54
254 0.52
255 0.54
256 0.55
257 0.53
258 0.53
259 0.5
260 0.44
261 0.37
262 0.3
263 0.23
264 0.2
265 0.17
266 0.14
267 0.13
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.1
272 0.1
273 0.13
274 0.15
275 0.2
276 0.2
277 0.24
278 0.3
279 0.29
280 0.3
281 0.31
282 0.3
283 0.25
284 0.25
285 0.22
286 0.16
287 0.15
288 0.14
289 0.1
290 0.09
291 0.11
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.14
297 0.18
298 0.22
299 0.21
300 0.22
301 0.22
302 0.23
303 0.24
304 0.23
305 0.21
306 0.18
307 0.17
308 0.17
309 0.16
310 0.14
311 0.12
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.18
320 0.19
321 0.2
322 0.18
323 0.2
324 0.18
325 0.18
326 0.19
327 0.15
328 0.13
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.16
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.09
348 0.08
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.13
355 0.14
356 0.13
357 0.11
358 0.15
359 0.17
360 0.18
361 0.19
362 0.2
363 0.24
364 0.26
365 0.28
366 0.27
367 0.32
368 0.31
369 0.31
370 0.29
371 0.3
372 0.26
373 0.23
374 0.22
375 0.17
376 0.18
377 0.18
378 0.2
379 0.16
380 0.17
381 0.16
382 0.16
383 0.14
384 0.12
385 0.11
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.1
394 0.1
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.17
399 0.19
400 0.22
401 0.21
402 0.29
403 0.35
404 0.38
405 0.42
406 0.42
407 0.42
408 0.41
409 0.4
410 0.33
411 0.26
412 0.22
413 0.18
414 0.15
415 0.14
416 0.11
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.1
423 0.13
424 0.15
425 0.17
426 0.26
427 0.28
428 0.33
429 0.33
430 0.32
431 0.3
432 0.27
433 0.27
434 0.17
435 0.14
436 0.09
437 0.06
438 0.05
439 0.04
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.05
445 0.06
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.12
450 0.17
451 0.23
452 0.28
453 0.35
454 0.37
455 0.45
456 0.46
457 0.45
458 0.42
459 0.37
460 0.34
461 0.28
462 0.27
463 0.18
464 0.17
465 0.15
466 0.18
467 0.18
468 0.14
469 0.14
470 0.12
471 0.11
472 0.14
473 0.13
474 0.13
475 0.14
476 0.18
477 0.18
478 0.25
479 0.26
480 0.27
481 0.32
482 0.29
483 0.29
484 0.27
485 0.29
486 0.25
487 0.31
488 0.3
489 0.27
490 0.28
491 0.28
492 0.26
493 0.24
494 0.2
495 0.14
496 0.11
497 0.09
498 0.07
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.06
509 0.08
510 0.11
511 0.1
512 0.12
513 0.13
514 0.15
515 0.16
516 0.15
517 0.13
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.09
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.09
527 0.12
528 0.12
529 0.13
530 0.18
531 0.23
532 0.26
533 0.28
534 0.35
535 0.39
536 0.47
537 0.53
538 0.51
539 0.49
540 0.46
541 0.45
542 0.39
543 0.35
544 0.26
545 0.19
546 0.14
547 0.1
548 0.09
549 0.08
550 0.07
551 0.05
552 0.05
553 0.07
554 0.1
555 0.1
556 0.11
557 0.14
558 0.2
559 0.28
560 0.33
561 0.4
562 0.43
563 0.47
564 0.48
565 0.54
566 0.5
567 0.43
568 0.43
569 0.37
570 0.35
571 0.34
572 0.34
573 0.29
574 0.35
575 0.36
576 0.35
577 0.35
578 0.35
579 0.32
580 0.32
581 0.29
582 0.24
583 0.21
584 0.18
585 0.16
586 0.13
587 0.12
588 0.1
589 0.1
590 0.1
591 0.11
592 0.12
593 0.13
594 0.15
595 0.17
596 0.18
597 0.26
598 0.29
599 0.32
600 0.38
601 0.48
602 0.52
603 0.54
604 0.53
605 0.45
606 0.39
607 0.36
608 0.29
609 0.25
610 0.18
611 0.14
612 0.15
613 0.14
614 0.13
615 0.13
616 0.13
617 0.09
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.1
622 0.09
623 0.09
624 0.08
625 0.06
626 0.05
627 0.04
628 0.04
629 0.03
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.06
634 0.08
635 0.08
636 0.1
637 0.1
638 0.12
639 0.14
640 0.17
641 0.18
642 0.19
643 0.24
644 0.25
645 0.26
646 0.26
647 0.23
648 0.21
649 0.2
650 0.17
651 0.12
652 0.1
653 0.08
654 0.06
655 0.07
656 0.07
657 0.09
658 0.08
659 0.11
660 0.15
661 0.15
662 0.18
663 0.23
664 0.24
665 0.21
666 0.23
667 0.28
668 0.32
669 0.34
670 0.36
671 0.33
672 0.33
673 0.32
674 0.3
675 0.25
676 0.18
677 0.18
678 0.19
679 0.23
680 0.22
681 0.22
682 0.24
683 0.23
684 0.31
685 0.29
686 0.23
687 0.2
688 0.2
689 0.21
690 0.19
691 0.21
692 0.14
693 0.13
694 0.13
695 0.1
696 0.1
697 0.1
698 0.12
699 0.12
700 0.19
701 0.23
702 0.26
703 0.28
704 0.32
705 0.33
706 0.31
707 0.36
708 0.3
709 0.28
710 0.25
711 0.24
712 0.2
713 0.19
714 0.2
715 0.13
716 0.1
717 0.09
718 0.09
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.08
723 0.1
724 0.1
725 0.12
726 0.13
727 0.15
728 0.15
729 0.18
730 0.21
731 0.2
732 0.22
733 0.2
734 0.19
735 0.17
736 0.19
737 0.15
738 0.12
739 0.14
740 0.13
741 0.21
742 0.26
743 0.27
744 0.27
745 0.33
746 0.38
747 0.42
748 0.51
749 0.51
750 0.55
751 0.62
752 0.71
753 0.74
754 0.78
755 0.79
756 0.76
757 0.73
758 0.71
759 0.67
760 0.63
761 0.59
762 0.55
763 0.52
764 0.48
765 0.41
766 0.35
767 0.31
768 0.24
769 0.19
770 0.13
771 0.11
772 0.07
773 0.07
774 0.07
775 0.07
776 0.09
777 0.12
778 0.14
779 0.13
780 0.18
781 0.22
782 0.27
783 0.29
784 0.31
785 0.31
786 0.33
787 0.4
788 0.36
789 0.38
790 0.32
791 0.31
792 0.28
793 0.24
794 0.21
795 0.16
796 0.18
797 0.12
798 0.18
799 0.18
800 0.21
801 0.26
802 0.33
803 0.36
804 0.39
805 0.47
806 0.44
807 0.46
808 0.46
809 0.45
810 0.42
811 0.41
812 0.43
813 0.39
814 0.4
815 0.39
816 0.41
817 0.36
818 0.32
819 0.33
820 0.34
821 0.38
822 0.45
823 0.52
824 0.53
825 0.53
826 0.55
827 0.55
828 0.5
829 0.45
830 0.42
831 0.38
832 0.36
833 0.36
834 0.33
835 0.28
836 0.25
837 0.21
838 0.13
839 0.09
840 0.07
841 0.06
842 0.07
843 0.07
844 0.06
845 0.07
846 0.07
847 0.05
848 0.05
849 0.05
850 0.05
851 0.06
852 0.06
853 0.05
854 0.06
855 0.06
856 0.06
857 0.06
858 0.06
859 0.06
860 0.06
861 0.08
862 0.08
863 0.08
864 0.08
865 0.08
866 0.08
867 0.09
868 0.09
869 0.06
870 0.07
871 0.06
872 0.06
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.07
878 0.06
879 0.06
880 0.06
881 0.07
882 0.06
883 0.07
884 0.07
885 0.07
886 0.07
887 0.08
888 0.08
889 0.08
890 0.08
891 0.08
892 0.08
893 0.09
894 0.11
895 0.11
896 0.11
897 0.11
898 0.11
899 0.1
900 0.11
901 0.1
902 0.07
903 0.09
904 0.11
905 0.13
906 0.13
907 0.14
908 0.15
909 0.19
910 0.25
911 0.27
912 0.31
913 0.31
914 0.32
915 0.33
916 0.32
917 0.32
918 0.29
919 0.3
920 0.34
921 0.35
922 0.34
923 0.33
924 0.34
925 0.3
926 0.29
927 0.24
928 0.19
929 0.19
930 0.21
931 0.25
932 0.27
933 0.26
934 0.28
935 0.29
936 0.25
937 0.29
938 0.36
939 0.41
940 0.48
941 0.57
942 0.59
943 0.58
944 0.63
945 0.65
946 0.67
947 0.68
948 0.67
949 0.68
950 0.72
951 0.76
952 0.72
953 0.67
954 0.64
955 0.63
956 0.64
957 0.58
958 0.58
959 0.58
960 0.58
961 0.57
962 0.52
963 0.5
964 0.47
965 0.47
966 0.42
967 0.38
968 0.42
969 0.4
970 0.4
971 0.38
972 0.33
973 0.4
974 0.45
975 0.5
976 0.48
977 0.51
978 0.49
979 0.5
980 0.54
981 0.52
982 0.55
983 0.56
984 0.57
985 0.58
986 0.62
987 0.6
988 0.59
989 0.53
990 0.45
991 0.43
992 0.39
993 0.36
994 0.3
995 0.27
996 0.28
997 0.27
998 0.3
999 0.3
1000 0.33
1001 0.36
1002 0.43
1003 0.51
1004 0.55
1005 0.61
1006 0.65
1007 0.7
1008 0.75
1009 0.82
1010 0.8
1011 0.75
1012 0.7
1013 0.66
1014 0.61