Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PDB1

Protein Details
Accession A0A1D8PDB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-372VNDLSGMVRKRKKQDANDDKTKKLKSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0034080  P:CENP-A containing chromatin assembly  
GO:0006335  P:DNA replication-dependent chromatin assembly  
KEGG cal:CAALFM_C104490WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MSNYSTEVAKLISEGSRAYSSKDFDLASEKYGEACEEYSKSHQGNEDADLLFLYGKAVFQSGVSKSEVFGGKPAEPEVETENSESKQEESKPETDKTDDTFQFYADGDGEEEDGEENEEPNEDENNDEDANKSDFEVAWELLDLARALFEEKLESLDKGDLKPPYLTQDTDESSNDYIVVLKKLSETYDILGEVSLEAENFNQAADDLRKCLELRLELFSDTSSLISESHYKLALALEFQSDDSNSRKNAAEQMKLAIESVERRNKNENDDSKRKENQEIIDEMKEKYQDLLKDPSEEIKMQQLDIIKGILGEEASGSEQSAGAAIVNNLQTMVKKKQNKEETKTVVNDLSGMVRKRKKQDANDDKTKKLKSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.2
4 0.2
5 0.24
6 0.26
7 0.28
8 0.29
9 0.31
10 0.27
11 0.24
12 0.3
13 0.26
14 0.24
15 0.24
16 0.22
17 0.2
18 0.2
19 0.19
20 0.14
21 0.14
22 0.15
23 0.15
24 0.18
25 0.22
26 0.27
27 0.27
28 0.28
29 0.31
30 0.31
31 0.31
32 0.31
33 0.31
34 0.25
35 0.24
36 0.21
37 0.18
38 0.15
39 0.12
40 0.1
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.06
46 0.07
47 0.12
48 0.13
49 0.15
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.22
54 0.23
55 0.19
56 0.2
57 0.21
58 0.21
59 0.22
60 0.23
61 0.19
62 0.17
63 0.18
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.2
69 0.19
70 0.2
71 0.19
72 0.16
73 0.19
74 0.21
75 0.26
76 0.28
77 0.33
78 0.37
79 0.39
80 0.4
81 0.37
82 0.37
83 0.35
84 0.38
85 0.34
86 0.33
87 0.31
88 0.28
89 0.26
90 0.24
91 0.21
92 0.13
93 0.12
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.13
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.17
147 0.15
148 0.16
149 0.17
150 0.16
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.16
155 0.19
156 0.19
157 0.2
158 0.2
159 0.17
160 0.15
161 0.14
162 0.13
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.05
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.14
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.14
207 0.13
208 0.11
209 0.09
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.1
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.11
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.11
231 0.13
232 0.13
233 0.15
234 0.16
235 0.17
236 0.25
237 0.28
238 0.29
239 0.27
240 0.29
241 0.28
242 0.27
243 0.26
244 0.18
245 0.14
246 0.15
247 0.21
248 0.28
249 0.28
250 0.31
251 0.39
252 0.42
253 0.48
254 0.53
255 0.55
256 0.56
257 0.64
258 0.68
259 0.67
260 0.71
261 0.67
262 0.63
263 0.59
264 0.53
265 0.49
266 0.46
267 0.42
268 0.4
269 0.39
270 0.34
271 0.31
272 0.28
273 0.23
274 0.21
275 0.22
276 0.2
277 0.22
278 0.29
279 0.28
280 0.3
281 0.31
282 0.33
283 0.31
284 0.29
285 0.26
286 0.27
287 0.26
288 0.23
289 0.24
290 0.23
291 0.21
292 0.21
293 0.2
294 0.12
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.13
319 0.18
320 0.26
321 0.31
322 0.4
323 0.47
324 0.57
325 0.68
326 0.75
327 0.77
328 0.8
329 0.78
330 0.77
331 0.74
332 0.67
333 0.58
334 0.48
335 0.41
336 0.31
337 0.3
338 0.28
339 0.29
340 0.34
341 0.39
342 0.47
343 0.55
344 0.64
345 0.68
346 0.72
347 0.8
348 0.82
349 0.85
350 0.88
351 0.86
352 0.83
353 0.81