Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D4U3

Protein Details
Accession B0D4U3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
487-514TLKSNTNKSTSRRPKRTKPKERSVATLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
497-509SRRPKRTKPKERS
562-594PPKKKAAAAATKAKKAPAKAPAKKAPAKKAPAK
614-635KKTNRAAVQSTKKAPAKKKATA
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 14, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004843  Calcineurin-like_PHP_ApaH  
IPR029052  Metallo-depent_PP-like  
IPR003701  Mre11  
IPR038487  Mre11_capping_dom  
IPR007281  Mre11_DNA-bd  
IPR041796  Mre11_N  
Gene Ontology GO:0030870  C:Mre11 complex  
GO:0008296  F:3'-5'-DNA exonuclease activity  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0030145  F:manganese ion binding  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_248055  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00149  Metallophos  
PF04152  Mre11_DNA_bind  
CDD cd00840  MPP_Mre11_N  
Amino Acid Sequences EDTIKILLATDNHIGYLERDPIRGQDSINTFQEILQLGKKHDVDFVLLAGDLFHENKPSRDCLYKTIALLREYTLGDKPIQVELLSDPEEGKADGFSFPAINYEDPNFNVAIPVFSIHGNHDDPQGAGAEGALCALDVLSVSGLLNYMGKIDLPVSDADARTTGIAVRPVLLRKGRTQLGMYGIGNVKDQRMHFELRSNRVRMYMPKDKDKWFNILLLHQNRVKHGPQEFVPEGMFDDSVDLVIWGHEHDCRIVPEPVAGKKYYITQPGSSVATSLADGEAIEKHVALLEVQGKEFKMTPIPLRTVRPFVIEEVVLNEVAEEEGLNLNDQMEITKYLKGKVVNALIDEANEQWDERNARAAEAGEPEVPRMLPLVRLKVDTTGVTETSNPIRFGQEFQGRIANPRDLLVFHRSKKSASRTTKVAIDQPELSIDDPELSVTEKLAKVRVATLVKEYLTAQELQLLGENGMSDAIQMFVEKDDIHAIHTLKSNTNKSTSRRPKRTKPKERSVATLNLSRIKRHIRLLQGKAKAIESGSEDSMLMDVDAGANSNFDDIDSDEPEPPKKKAAAAATKAKKAPAKAPAKKAPAKKAPAKVIDLGDSDDEEEEAPKPATKKTNRAAVQSTKKAPAKKKATAAPAKQNQLTFAPAGRSSRAAATKARGKMVVSFVFMFQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.2
4 0.25
5 0.22
6 0.23
7 0.24
8 0.27
9 0.3
10 0.29
11 0.26
12 0.25
13 0.3
14 0.34
15 0.36
16 0.35
17 0.31
18 0.3
19 0.33
20 0.27
21 0.24
22 0.23
23 0.24
24 0.24
25 0.31
26 0.33
27 0.3
28 0.32
29 0.3
30 0.27
31 0.25
32 0.23
33 0.17
34 0.15
35 0.14
36 0.1
37 0.1
38 0.09
39 0.1
40 0.1
41 0.16
42 0.17
43 0.22
44 0.25
45 0.28
46 0.31
47 0.37
48 0.39
49 0.39
50 0.45
51 0.44
52 0.43
53 0.47
54 0.47
55 0.41
56 0.4
57 0.35
58 0.31
59 0.28
60 0.29
61 0.23
62 0.21
63 0.21
64 0.21
65 0.21
66 0.19
67 0.19
68 0.16
69 0.15
70 0.15
71 0.18
72 0.18
73 0.17
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.14
78 0.13
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.13
88 0.12
89 0.14
90 0.16
91 0.18
92 0.18
93 0.2
94 0.17
95 0.15
96 0.16
97 0.14
98 0.12
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.15
106 0.16
107 0.17
108 0.18
109 0.18
110 0.17
111 0.17
112 0.16
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.1
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.11
149 0.12
150 0.1
151 0.09
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.15
156 0.16
157 0.22
158 0.25
159 0.25
160 0.27
161 0.33
162 0.34
163 0.34
164 0.34
165 0.31
166 0.31
167 0.32
168 0.28
169 0.26
170 0.25
171 0.23
172 0.23
173 0.21
174 0.17
175 0.17
176 0.17
177 0.18
178 0.2
179 0.23
180 0.23
181 0.3
182 0.36
183 0.41
184 0.48
185 0.45
186 0.42
187 0.41
188 0.43
189 0.41
190 0.43
191 0.44
192 0.42
193 0.5
194 0.54
195 0.56
196 0.61
197 0.57
198 0.54
199 0.46
200 0.44
201 0.36
202 0.36
203 0.4
204 0.36
205 0.37
206 0.34
207 0.34
208 0.33
209 0.36
210 0.33
211 0.29
212 0.28
213 0.28
214 0.27
215 0.34
216 0.32
217 0.29
218 0.27
219 0.21
220 0.2
221 0.17
222 0.15
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.1
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.16
243 0.19
244 0.21
245 0.23
246 0.21
247 0.18
248 0.18
249 0.22
250 0.23
251 0.26
252 0.25
253 0.23
254 0.25
255 0.26
256 0.27
257 0.22
258 0.19
259 0.13
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.06
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.05
275 0.07
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.11
284 0.1
285 0.11
286 0.15
287 0.17
288 0.21
289 0.23
290 0.26
291 0.28
292 0.29
293 0.27
294 0.26
295 0.24
296 0.21
297 0.2
298 0.16
299 0.14
300 0.11
301 0.11
302 0.09
303 0.08
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.06
320 0.07
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.16
325 0.16
326 0.17
327 0.19
328 0.21
329 0.18
330 0.18
331 0.18
332 0.15
333 0.15
334 0.14
335 0.09
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.08
341 0.09
342 0.09
343 0.15
344 0.14
345 0.14
346 0.15
347 0.15
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.1
360 0.12
361 0.16
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.19
366 0.2
367 0.15
368 0.15
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.15
375 0.17
376 0.15
377 0.15
378 0.16
379 0.16
380 0.18
381 0.23
382 0.24
383 0.23
384 0.23
385 0.27
386 0.25
387 0.28
388 0.29
389 0.24
390 0.18
391 0.18
392 0.18
393 0.14
394 0.17
395 0.21
396 0.24
397 0.25
398 0.31
399 0.31
400 0.32
401 0.39
402 0.44
403 0.46
404 0.48
405 0.49
406 0.48
407 0.5
408 0.52
409 0.47
410 0.44
411 0.37
412 0.32
413 0.29
414 0.25
415 0.24
416 0.2
417 0.18
418 0.13
419 0.1
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.1
428 0.1
429 0.11
430 0.14
431 0.14
432 0.13
433 0.15
434 0.21
435 0.19
436 0.19
437 0.21
438 0.21
439 0.2
440 0.21
441 0.2
442 0.15
443 0.15
444 0.14
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.11
449 0.12
450 0.11
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.13
471 0.14
472 0.16
473 0.2
474 0.21
475 0.24
476 0.3
477 0.34
478 0.33
479 0.39
480 0.41
481 0.42
482 0.52
483 0.58
484 0.62
485 0.69
486 0.76
487 0.81
488 0.86
489 0.93
490 0.93
491 0.92
492 0.92
493 0.91
494 0.85
495 0.81
496 0.75
497 0.71
498 0.63
499 0.59
500 0.5
501 0.48
502 0.45
503 0.4
504 0.4
505 0.4
506 0.4
507 0.41
508 0.45
509 0.48
510 0.56
511 0.64
512 0.67
513 0.65
514 0.63
515 0.58
516 0.53
517 0.43
518 0.34
519 0.27
520 0.23
521 0.21
522 0.18
523 0.17
524 0.16
525 0.15
526 0.15
527 0.13
528 0.08
529 0.05
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.07
542 0.1
543 0.12
544 0.14
545 0.17
546 0.19
547 0.26
548 0.28
549 0.28
550 0.31
551 0.3
552 0.31
553 0.34
554 0.42
555 0.46
556 0.5
557 0.59
558 0.6
559 0.64
560 0.63
561 0.62
562 0.56
563 0.5
564 0.5
565 0.49
566 0.54
567 0.57
568 0.65
569 0.69
570 0.74
571 0.78
572 0.79
573 0.79
574 0.78
575 0.78
576 0.78
577 0.77
578 0.77
579 0.75
580 0.71
581 0.65
582 0.58
583 0.52
584 0.44
585 0.38
586 0.29
587 0.24
588 0.21
589 0.16
590 0.14
591 0.11
592 0.11
593 0.1
594 0.11
595 0.12
596 0.14
597 0.16
598 0.22
599 0.31
600 0.38
601 0.47
602 0.51
603 0.61
604 0.62
605 0.66
606 0.68
607 0.69
608 0.71
609 0.7
610 0.69
611 0.68
612 0.69
613 0.71
614 0.72
615 0.73
616 0.72
617 0.71
618 0.74
619 0.73
620 0.78
621 0.79
622 0.79
623 0.79
624 0.78
625 0.78
626 0.73
627 0.66
628 0.59
629 0.51
630 0.45
631 0.36
632 0.3
633 0.27
634 0.27
635 0.29
636 0.28
637 0.27
638 0.26
639 0.31
640 0.33
641 0.32
642 0.34
643 0.39
644 0.45
645 0.48
646 0.5
647 0.45
648 0.42
649 0.44
650 0.47
651 0.42
652 0.37