FuNGI

A0A1D8PCA4

Protein Details

Accession

A0A1D8PCA4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1068-1091	GLPCVQPYRLHKKKQLKTAVQDLN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0034245 C:mitochondrial DNA-directed RNA polymerase complex GO:0042645 C:mitochondrial nucleoid GO:0003896 F:DNA primase activity GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0001018 F:mitochondrial promoter sequence-specific DNA binding GO:0000002 P:mitochondrial genome maintenance GO:0006390 P:mitochondrial transcription GO:0006391 P:transcription initiation at mitochondrial promoter
KEGG	cal:CAALFM_C100640CA -
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MLSAQRSLVRRITGVRLQVRMLHHTTKTSTATSQIDTTSAGDFKHSEVLSKVMSPLMSINHVKEAPSLKNYHNNKITYRSYLNLNPEKYDLDEEEKIVKYYSSKNDGVEVQPYAPEIQYLKNILESFSEQKYFDKIDQVLKSLSKLVNATEFTDICNKYLENILQDDSLSLQDLNSIIGQLQDKCKFKTNTRTEAIILGKMLNDSDNAQSSISEFFGNMEKQTIVEILRNMDVIGVDNLYKVFDCDSIDASVIPKELQEIYQEHKSKDHDDEIAEDILKLQENKQINPLDKKSLEELLPVDSFGLQVIRHSLLGLKPDSEAALKFADQVEKIIEDVDDEVLNQDIMSGKINYFEMYSKLKTEEQRQAFNEALNVFNLERQKQIEIRGIEGAKEKWKHDFEESQKRGDLNLSKGLNAQCYKWLQDVLPVLEKEYKLCEALINGNNSVIEKDDPNAKDRAMYAPFILKISPDKAIIITILELFKLHSTGGVVRGFRAYKAIQSVGKAIEAEYRIGLQAKKENKLFSQKHLSPQLQKLMRRTMQKGNESTPEWDDATRARIGGVLVSILMSVAKVNVRKETPQGLIEDFHPAFYHGMQFIAGNRVGVIKVHTDISNILSGTSLTESIQPQALPMLVEPKPWNSFYGGGSLYSKTPLVRVKDSPETEAYLKAANERGNLTGVFEGLNVLGNTAWTVNKKVFNVISHYWNSGEEFLSIPPVSEEPQLPQDIPGNSDPQKLLHHTTSKYQALDEYISNKSQRCDNNYRLEIARAFIGEKLFFPHNLDFRGRAYPISPHFNHLGGDLTRSLFLFWDGKELGEEGLNWLKIQLANVYGVDKESLAKRVEFVNENLEKVLESAADPFATDAWWQKAEKPWQALSVCFELAEAYKLDDPTKFVSHLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDVEGANQVNLNPSDKPQDVYTYVAKLVETRVKADAEKGDELAIFLQDKIKRKVVKQTVMTNVYGVTFIGAIEQIRKQIIHLFPKDADHHAAARYLAVQVFASIRELFENAHFIQAWLTESAKRITKSVTLDFGESQYSEQELLSTVIWTTPLGLPCVQPYRLHKKKQLKTAVQDLNIVMPSNTSAVDSRKQQNGFPPNFIHSLDATHMLMTATKCAEFDLNFASVHDSFWTHAADVPQMNRIIREQFVKLHTTNLIELLKEEFSERYKDNYQVLPIPNNHELARKVKAIKKEWAEALNRPVQIADELYMERKRLQMLESEDPEEVEVAKNMETTISITMNYKPYEFANRQVSNSFQILVPIQFPEVPSKGEFDVNLVKQSQYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.47
3	0.45
4	0.45
5	0.47
6	0.47
7	0.46
8	0.46
9	0.44
10	0.4
11	0.42
12	0.44
13	0.44
14	0.43
15	0.39
16	0.35
17	0.35
18	0.36
19	0.34
20	0.33
21	0.28
22	0.25
23	0.23
24	0.23
25	0.2
26	0.18
27	0.16
28	0.16
29	0.16
30	0.17
31	0.23
32	0.21
33	0.21
34	0.21
35	0.24
36	0.24
37	0.24
38	0.24
39	0.18
40	0.18
41	0.17
42	0.17
43	0.17
44	0.21
45	0.22
46	0.23
47	0.27
48	0.28
49	0.27
50	0.3
51	0.33
52	0.32
53	0.36
54	0.39
55	0.38
56	0.47
57	0.52
58	0.57
59	0.59
60	0.58
61	0.56
62	0.6
63	0.59
64	0.56
65	0.55
66	0.47
67	0.46
68	0.48
69	0.54
70	0.54
71	0.51
72	0.47
73	0.45
74	0.44
75	0.4
76	0.38
77	0.31
78	0.3
79	0.29
80	0.29
81	0.32
82	0.32
83	0.3
84	0.26
85	0.24
86	0.21
87	0.28
88	0.34
89	0.36
90	0.37
91	0.37
92	0.4
93	0.43
94	0.41
95	0.37
96	0.31
97	0.25
98	0.23
99	0.23
100	0.21
101	0.17
102	0.17
103	0.15
104	0.15
105	0.19
106	0.2
107	0.2
108	0.23
109	0.23
110	0.22
111	0.23
112	0.25
113	0.25
114	0.27
115	0.29
116	0.25
117	0.26
118	0.29
119	0.3
120	0.27
121	0.3
122	0.29
123	0.35
124	0.36
125	0.38
126	0.37
127	0.35
128	0.34
129	0.34
130	0.31
131	0.26
132	0.25
133	0.24
134	0.26
135	0.26
136	0.27
137	0.25
138	0.24
139	0.23
140	0.3
141	0.29
142	0.24
143	0.25
144	0.22
145	0.2
146	0.25
147	0.25
148	0.2
149	0.22
150	0.23
151	0.21
152	0.21
153	0.2
154	0.15
155	0.14
156	0.12
157	0.09
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.1
162	0.09
163	0.08
164	0.07
165	0.1
166	0.13
167	0.14
168	0.22
169	0.28
170	0.32
171	0.34
172	0.44
173	0.46
174	0.52
175	0.6
176	0.61
177	0.63
178	0.63
179	0.63
180	0.55
181	0.56
182	0.5
183	0.41
184	0.32
185	0.24
186	0.2
187	0.17
188	0.17
189	0.11
190	0.1
191	0.1
192	0.12
193	0.14
194	0.15
195	0.14
196	0.14
197	0.14
198	0.15
199	0.14
200	0.11
201	0.09
202	0.09
203	0.14
204	0.15
205	0.14
206	0.15
207	0.14
208	0.14
209	0.15
210	0.15
211	0.11
212	0.13
213	0.14
214	0.15
215	0.15
216	0.15
217	0.14
218	0.13
219	0.12
220	0.11
221	0.1
222	0.09
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.07
229	0.08
230	0.08
231	0.1
232	0.11
233	0.13
234	0.13
235	0.14
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.12
240	0.11
241	0.08
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.13
246	0.15
247	0.19
248	0.28
249	0.32
250	0.31
251	0.35
252	0.37
253	0.38
254	0.4
255	0.39
256	0.32
257	0.3
258	0.31
259	0.3
260	0.28
261	0.24
262	0.18
263	0.15
264	0.14
265	0.15
266	0.13
267	0.12
268	0.17
269	0.19
270	0.21
271	0.27
272	0.31
273	0.35
274	0.43
275	0.44
276	0.46
277	0.44
278	0.45
279	0.41
280	0.4
281	0.34
282	0.28
283	0.26
284	0.22
285	0.21
286	0.19
287	0.16
288	0.12
289	0.11
290	0.09
291	0.1
292	0.06
293	0.06
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.12
299	0.13
300	0.17
301	0.17
302	0.15
303	0.15
304	0.15
305	0.16
306	0.15
307	0.13
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.12
312	0.13
313	0.14
314	0.13
315	0.14
316	0.13
317	0.12
318	0.12
319	0.11
320	0.1
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.08
334	0.09
335	0.08
336	0.1
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.12
341	0.13
342	0.16
343	0.18
344	0.18
345	0.2
346	0.25
347	0.28
348	0.35
349	0.41
350	0.41
351	0.46
352	0.46
353	0.47
354	0.43
355	0.39
356	0.35
357	0.26
358	0.23
359	0.16
360	0.16
361	0.12
362	0.14
363	0.17
364	0.15
365	0.16
366	0.17
367	0.2
368	0.2
369	0.24
370	0.28
371	0.26
372	0.27
373	0.29
374	0.28
375	0.26
376	0.27
377	0.25
378	0.26
379	0.28
380	0.27
381	0.29
382	0.32
383	0.33
384	0.35
385	0.41
386	0.43
387	0.52
388	0.53
389	0.49
390	0.48
391	0.45
392	0.41
393	0.38
394	0.34
395	0.26
396	0.31
397	0.28
398	0.27
399	0.31
400	0.31
401	0.31
402	0.28
403	0.24
404	0.22
405	0.23
406	0.25
407	0.22
408	0.23
409	0.17
410	0.21
411	0.23
412	0.2
413	0.23
414	0.21
415	0.21
416	0.23
417	0.23
418	0.2
419	0.2
420	0.18
421	0.14
422	0.14
423	0.13
424	0.11
425	0.18
426	0.21
427	0.21
428	0.2
429	0.19
430	0.19
431	0.19
432	0.17
433	0.12
434	0.09
435	0.08
436	0.09
437	0.16
438	0.17
439	0.19
440	0.21
441	0.19
442	0.19
443	0.2
444	0.24
445	0.18
446	0.18
447	0.16
448	0.18
449	0.19
450	0.18
451	0.16
452	0.12
453	0.13
454	0.14
455	0.15
456	0.12
457	0.12
458	0.12
459	0.12
460	0.11
461	0.09
462	0.08
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.06
467	0.06
468	0.07
469	0.07
470	0.06
471	0.05
472	0.06
473	0.07
474	0.11
475	0.13
476	0.13
477	0.13
478	0.16
479	0.16
480	0.15
481	0.18
482	0.14
483	0.13
484	0.16
485	0.18
486	0.17
487	0.17
488	0.2
489	0.17
490	0.17
491	0.15
492	0.12
493	0.13
494	0.13
495	0.12
496	0.1
497	0.1
498	0.1
499	0.12
500	0.12
501	0.11
502	0.17
503	0.21
504	0.25
505	0.27
506	0.29
507	0.3
508	0.4
509	0.4
510	0.4
511	0.45
512	0.43
513	0.47
514	0.52
515	0.53
516	0.48
517	0.5
518	0.52
519	0.47
520	0.47
521	0.45
522	0.46
523	0.47
524	0.47
525	0.47
526	0.47
527	0.5
528	0.53
529	0.51
530	0.46
531	0.46
532	0.42
533	0.39
534	0.32
535	0.27
536	0.22
537	0.19
538	0.17
539	0.13
540	0.15
541	0.13
542	0.11
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.08
548	0.05
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.06
558	0.08
559	0.09
560	0.13
561	0.14
562	0.16
563	0.18
564	0.22
565	0.22
566	0.21
567	0.22
568	0.19
569	0.19
570	0.18
571	0.21
572	0.16
573	0.15
574	0.13
575	0.12
576	0.12
577	0.11
578	0.12
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.09
585	0.09
586	0.07
587	0.07
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.08
592	0.06
593	0.07
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.09
598	0.1
599	0.1
600	0.09
601	0.09
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.06
607	0.05
608	0.07
609	0.07
610	0.08
611	0.09
612	0.08
613	0.08
614	0.08
615	0.08
616	0.06
617	0.05
618	0.1
619	0.09
620	0.11
621	0.12
622	0.14
623	0.16
624	0.16
625	0.17
626	0.14
627	0.15
628	0.14
629	0.16
630	0.14
631	0.12
632	0.13
633	0.13
634	0.12
635	0.11
636	0.11
637	0.08
638	0.1
639	0.14
640	0.16
641	0.19
642	0.2
643	0.24
644	0.3
645	0.31
646	0.3
647	0.27
648	0.26
649	0.24
650	0.22
651	0.19
652	0.14
653	0.13
654	0.12
655	0.14
656	0.12
657	0.13
658	0.13
659	0.13
660	0.12
661	0.12
662	0.12
663	0.09
664	0.08
665	0.07
666	0.06
667	0.06
668	0.04
669	0.06
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.04
674	0.05
675	0.05
676	0.06
677	0.06
678	0.07
679	0.1
680	0.13
681	0.14
682	0.16
683	0.17
684	0.17
685	0.22
686	0.23
687	0.25
688	0.23
689	0.24
690	0.21
691	0.2
692	0.2
693	0.15
694	0.13
695	0.09
696	0.09
697	0.08
698	0.1
699	0.09
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.09
705	0.1
706	0.09
707	0.12
708	0.13
709	0.12
710	0.13
711	0.15
712	0.14
713	0.16
714	0.16
715	0.17
716	0.18
717	0.19
718	0.19
719	0.16
720	0.18
721	0.18
722	0.2
723	0.21
724	0.24
725	0.23
726	0.27
727	0.32
728	0.32
729	0.3
730	0.27
731	0.23
732	0.21
733	0.21
734	0.18
735	0.15
736	0.14
737	0.16
738	0.18
739	0.18
740	0.17
741	0.22
742	0.24
743	0.29
744	0.35
745	0.4
746	0.47
747	0.47
748	0.49
749	0.43
750	0.42
751	0.34
752	0.27
753	0.21
754	0.12
755	0.12
756	0.11
757	0.11
758	0.09
759	0.09
760	0.11
761	0.12
762	0.12
763	0.14
764	0.16
765	0.17
766	0.2
767	0.21
768	0.19
769	0.2
770	0.23
771	0.2
772	0.17
773	0.16
774	0.19
775	0.21
776	0.27
777	0.26
778	0.26
779	0.27
780	0.27
781	0.26
782	0.21
783	0.21
784	0.14
785	0.15
786	0.13
787	0.12
788	0.11
789	0.11
790	0.11
791	0.07
792	0.09
793	0.09
794	0.08
795	0.12
796	0.12
797	0.12
798	0.12
799	0.12
800	0.11
801	0.09
802	0.09
803	0.08
804	0.1
805	0.1
806	0.1
807	0.09
808	0.1
809	0.1
810	0.11
811	0.1
812	0.08
813	0.09
814	0.09
815	0.1
816	0.09
817	0.09
818	0.08
819	0.07
820	0.08
821	0.09
822	0.13
823	0.13
824	0.13
825	0.14
826	0.16
827	0.19
828	0.2
829	0.19
830	0.24
831	0.24
832	0.24
833	0.23
834	0.21
835	0.18
836	0.16
837	0.15
838	0.06
839	0.05
840	0.07
841	0.07
842	0.07
843	0.07
844	0.06
845	0.06
846	0.06
847	0.07
848	0.08
849	0.1
850	0.13
851	0.14
852	0.16
853	0.24
854	0.3
855	0.34
856	0.36
857	0.34
858	0.38
859	0.38
860	0.36
861	0.32
862	0.28
863	0.23
864	0.18
865	0.17
866	0.12
867	0.11
868	0.12
869	0.09
870	0.08
871	0.1
872	0.11
873	0.12
874	0.12
875	0.13
876	0.16
877	0.18
878	0.17
879	0.16
880	0.21
881	0.23
882	0.26
883	0.29
884	0.29
885	0.29
886	0.29
887	0.3
888	0.24
889	0.27
890	0.24
891	0.19
892	0.15
893	0.15
894	0.14
895	0.12
896	0.13
897	0.08
898	0.07
899	0.06
900	0.06
901	0.05
902	0.06
903	0.05
904	0.05
905	0.05
906	0.05
907	0.05
908	0.05
909	0.05
910	0.07
911	0.08
912	0.1
913	0.1
914	0.12
915	0.18
916	0.18
917	0.2
918	0.18
919	0.21
920	0.21
921	0.23
922	0.24
923	0.2
924	0.2
925	0.19
926	0.18
927	0.15
928	0.17
929	0.19
930	0.18
931	0.18
932	0.2
933	0.21
934	0.21
935	0.24
936	0.24
937	0.22
938	0.23
939	0.21
940	0.19
941	0.18
942	0.18
943	0.15
944	0.12
945	0.08
946	0.08
947	0.13
948	0.16
949	0.23
950	0.27
951	0.33
952	0.37
953	0.4
954	0.5
955	0.54
956	0.58
957	0.58
958	0.61
959	0.63
960	0.62
961	0.59
962	0.48
963	0.39
964	0.31
965	0.25
966	0.17
967	0.09
968	0.05
969	0.05
970	0.05
971	0.05
972	0.05
973	0.08
974	0.09
975	0.1
976	0.11
977	0.11
978	0.12
979	0.19
980	0.24
981	0.31
982	0.33
983	0.35
984	0.35
985	0.39
986	0.41
987	0.36
988	0.33
989	0.26
990	0.26
991	0.23
992	0.23
993	0.19
994	0.17
995	0.15
996	0.13
997	0.11
998	0.1
999	0.09
1000	0.08
1001	0.09
1002	0.09
1003	0.11
1004	0.09
1005	0.09
1006	0.1
1007	0.1
1008	0.1
1009	0.11
1010	0.15
1011	0.13
1012	0.15
1013	0.14
1014	0.14
1015	0.14
1016	0.14
1017	0.14
1018	0.11
1019	0.12
1020	0.12
1021	0.14
1022	0.18
1023	0.22
1024	0.22
1025	0.22
1026	0.23
1027	0.27
1028	0.3
1029	0.32
1030	0.34
1031	0.3
1032	0.31
1033	0.31
1034	0.29
1035	0.25
1036	0.21
1037	0.17
1038	0.13
1039	0.12
1040	0.11
1041	0.09
1042	0.09
1043	0.09
1044	0.1
1045	0.09
1046	0.09
1047	0.08
1048	0.08
1049	0.08
1050	0.08
1051	0.09
1052	0.11
1053	0.12
1054	0.14
1055	0.15
1056	0.16
1057	0.2
1058	0.25
1059	0.24
1060	0.26
1061	0.33
1062	0.42
1063	0.5
1064	0.57
1065	0.62
1066	0.68
1067	0.74
1068	0.8
1069	0.83
1070	0.8
1071	0.78
1072	0.8
1073	0.78
1074	0.69
1075	0.63
1076	0.53
1077	0.46
1078	0.38
1079	0.31
1080	0.21
1081	0.13
1082	0.13
1083	0.11
1084	0.11
1085	0.09
1086	0.1
1087	0.14
1088	0.19
1089	0.25
1090	0.31
1091	0.38
1092	0.39
1093	0.4
1094	0.48
1095	0.54
1096	0.53
1097	0.51
1098	0.47
1099	0.44
1100	0.45
1101	0.43
1102	0.35
1103	0.26
1104	0.25
1105	0.22
1106	0.21
1107	0.18
1108	0.15
1109	0.15
1110	0.13
1111	0.15
1112	0.13
1113	0.15
1114	0.13
1115	0.13
1116	0.13
1117	0.14
1118	0.17
1119	0.14
1120	0.16
1121	0.16
1122	0.16
1123	0.16
1124	0.16
1125	0.19
1126	0.16
1127	0.17
1128	0.16
1129	0.13
1130	0.13
1131	0.15
1132	0.16
1133	0.12
1134	0.15
1135	0.15
1136	0.18
1137	0.21
1138	0.21
1139	0.24
1140	0.25
1141	0.25
1142	0.24
1143	0.26
1144	0.25
1145	0.25
1146	0.28
1147	0.26
1148	0.29
1149	0.32
1150	0.36
1151	0.33
1152	0.33
1153	0.33
1154	0.31
1155	0.29
1156	0.29
1157	0.26
1158	0.21
1159	0.21
1160	0.2
1161	0.18
1162	0.16
1163	0.17
1164	0.14
1165	0.16
1166	0.21
1167	0.21
1168	0.25
1169	0.29
1170	0.33
1171	0.36
1172	0.37
1173	0.39
1174	0.41
1175	0.44
1176	0.44
1177	0.43
1178	0.46
1179	0.44
1180	0.43
1181	0.4
1182	0.38
1183	0.37
1184	0.35
1185	0.37
1186	0.37
1187	0.41
1188	0.44
1189	0.52
1190	0.54
1191	0.59
1192	0.6
1193	0.62
1194	0.61
1195	0.6
1196	0.59
1197	0.56
1198	0.57
1199	0.54
1200	0.48
1201	0.42
1202	0.36
1203	0.3
1204	0.28
1205	0.24
1206	0.17
1207	0.14
1208	0.15
1209	0.19
1210	0.22
1211	0.22
1212	0.22
1213	0.23
1214	0.25
1215	0.24
1216	0.24
1217	0.27
1218	0.32
1219	0.39
1220	0.41
1221	0.42
1222	0.39
1223	0.37
1224	0.36
1225	0.29
1226	0.22
1227	0.15
1228	0.12
1229	0.11
1230	0.11
1231	0.11
1232	0.11
1233	0.11
1234	0.11
1235	0.11
1236	0.13
1237	0.12
1238	0.13
1239	0.14
1240	0.19
1241	0.24
1242	0.25
1243	0.24
1244	0.22
1245	0.24
1246	0.33
1247	0.34
1248	0.38
1249	0.43
1250	0.44
1251	0.46
1252	0.48
1253	0.48
1254	0.43
1255	0.41
1256	0.34
1257	0.24
1258	0.24
1259	0.24
1260	0.22
1261	0.21
1262	0.17
1263	0.17
1264	0.17
1265	0.18
1266	0.22
1267	0.22
1268	0.23
1269	0.23
1270	0.25
1271	0.25
1272	0.26
1273	0.25
1274	0.24
1275	0.31
1276	0.3
1277	0.33
1278	0.31
1279	0.3
1280	0.29

A0A1D8PCA4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer