Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CYA1

Protein Details
Accession B0CYA1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-69GDEGKKEKRRKEISGRVGKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-65GKKEKRRKEISGR
150-171KGRERVRERLIEGIEERRRRAR
322-326NKRRR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_311782  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MPPQPGIFSVPSSYSVPHKSSRAGNYPADVSDMSIYQHHPIAGPSSRTHGDEGKKEKRRKEISGRVGKEMIDRRDDGRHFTESISALHSTAIQLSTRPETHPLYKLRLFPISLERSAVLAQVELEERHALECVQVAYDEERERVEEEWRKGRERVRERLIEGIEERRRRAREEKDGEGTLGDASLDAHSRPPITRKLRNKLGTSPPPTPLPSFSTVNGPGGHVSCLPITSGPFLNPHSLSVDELPSPFPFPLTSTSIPNGGASTGALGAGIGSAGGRRRPKGGGVHQSQVVGGLGKSLVIFMPQSIKESEVDSDLGEIRRGNKRRRATAASLAKSNAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.31
4 0.34
5 0.35
6 0.37
7 0.43
8 0.49
9 0.51
10 0.51
11 0.5
12 0.48
13 0.47
14 0.42
15 0.38
16 0.29
17 0.23
18 0.18
19 0.16
20 0.14
21 0.14
22 0.15
23 0.14
24 0.16
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.19
29 0.22
30 0.24
31 0.23
32 0.27
33 0.29
34 0.3
35 0.32
36 0.33
37 0.34
38 0.4
39 0.48
40 0.53
41 0.61
42 0.67
43 0.71
44 0.74
45 0.76
46 0.77
47 0.79
48 0.79
49 0.8
50 0.83
51 0.79
52 0.73
53 0.67
54 0.58
55 0.55
56 0.51
57 0.44
58 0.38
59 0.36
60 0.34
61 0.41
62 0.41
63 0.39
64 0.35
65 0.34
66 0.31
67 0.3
68 0.31
69 0.24
70 0.24
71 0.21
72 0.18
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.08
80 0.08
81 0.11
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.2
86 0.22
87 0.26
88 0.32
89 0.33
90 0.36
91 0.39
92 0.41
93 0.4
94 0.39
95 0.35
96 0.3
97 0.35
98 0.33
99 0.29
100 0.27
101 0.24
102 0.22
103 0.22
104 0.2
105 0.12
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.12
130 0.12
131 0.17
132 0.21
133 0.24
134 0.31
135 0.33
136 0.36
137 0.38
138 0.42
139 0.46
140 0.47
141 0.52
142 0.5
143 0.51
144 0.5
145 0.51
146 0.47
147 0.38
148 0.32
149 0.31
150 0.3
151 0.29
152 0.29
153 0.3
154 0.31
155 0.33
156 0.4
157 0.39
158 0.44
159 0.48
160 0.51
161 0.49
162 0.48
163 0.44
164 0.36
165 0.29
166 0.18
167 0.12
168 0.08
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.04
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.12
179 0.2
180 0.27
181 0.36
182 0.45
183 0.53
184 0.61
185 0.66
186 0.66
187 0.65
188 0.67
189 0.67
190 0.63
191 0.57
192 0.5
193 0.47
194 0.45
195 0.39
196 0.32
197 0.27
198 0.26
199 0.25
200 0.23
201 0.25
202 0.25
203 0.25
204 0.23
205 0.19
206 0.16
207 0.15
208 0.15
209 0.11
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.17
222 0.16
223 0.17
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.13
233 0.14
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.14
239 0.19
240 0.2
241 0.22
242 0.23
243 0.24
244 0.24
245 0.23
246 0.19
247 0.13
248 0.11
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.03
257 0.03
258 0.02
259 0.02
260 0.04
261 0.06
262 0.12
263 0.16
264 0.18
265 0.22
266 0.24
267 0.29
268 0.37
269 0.45
270 0.5
271 0.51
272 0.54
273 0.52
274 0.51
275 0.45
276 0.37
277 0.28
278 0.18
279 0.13
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.14
290 0.14
291 0.17
292 0.17
293 0.19
294 0.18
295 0.2
296 0.21
297 0.17
298 0.17
299 0.14
300 0.15
301 0.17
302 0.17
303 0.17
304 0.17
305 0.21
306 0.3
307 0.39
308 0.46
309 0.52
310 0.61
311 0.68
312 0.75
313 0.78
314 0.75
315 0.77
316 0.78
317 0.74
318 0.68