Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DXG3

Protein Details
Accession B0DXG3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-242LRVSTPEKKRQAEREKRREERKTTKTLABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-236KKRQAEREKRREERK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037212  Med7/Med21-like  
IPR021384  Mediator_Med21  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_333904  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11221  Med21  
Amino Acid Sequences MANSISYLTSRSNFLQVSAEIPITKQRNPDKYDPPDVFEANKKELVADLMVKAKQIEYLINSLPEPEPEEEQAKRFQQLEEDMTLANEQYILAVGRAKNLHSQVAEVLQAMLVDDEANLLQDGPSIPASVSTTPFAQHASPATSPSLLESLPDVHSCLHFEIGNSRLRTRIPMWVSLRRFVSRLGIRPNVITETASWCPSRVVSHLHSLIGTEGLRVSTPEKKRQAEREKRREERKTTKTLAHGYRTRTMRVFVCTFGLSTILVDRQGLTRFFLRPAAGISFRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.23
4 0.23
5 0.22
6 0.21
7 0.16
8 0.17
9 0.24
10 0.24
11 0.26
12 0.33
13 0.4
14 0.47
15 0.54
16 0.61
17 0.63
18 0.67
19 0.74
20 0.67
21 0.62
22 0.57
23 0.52
24 0.47
25 0.45
26 0.42
27 0.36
28 0.36
29 0.32
30 0.28
31 0.27
32 0.25
33 0.2
34 0.17
35 0.15
36 0.18
37 0.18
38 0.18
39 0.18
40 0.16
41 0.16
42 0.15
43 0.15
44 0.13
45 0.17
46 0.18
47 0.18
48 0.18
49 0.18
50 0.18
51 0.16
52 0.17
53 0.15
54 0.16
55 0.17
56 0.21
57 0.2
58 0.22
59 0.27
60 0.25
61 0.26
62 0.25
63 0.23
64 0.24
65 0.26
66 0.27
67 0.22
68 0.22
69 0.18
70 0.18
71 0.17
72 0.13
73 0.09
74 0.06
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.08
81 0.08
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.17
86 0.18
87 0.2
88 0.17
89 0.18
90 0.15
91 0.16
92 0.15
93 0.11
94 0.09
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.11
149 0.13
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.19
154 0.19
155 0.22
156 0.21
157 0.25
158 0.22
159 0.28
160 0.33
161 0.4
162 0.41
163 0.42
164 0.43
165 0.37
166 0.35
167 0.29
168 0.32
169 0.28
170 0.31
171 0.34
172 0.34
173 0.34
174 0.34
175 0.34
176 0.28
177 0.24
178 0.19
179 0.14
180 0.16
181 0.17
182 0.18
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.14
189 0.17
190 0.18
191 0.24
192 0.25
193 0.25
194 0.24
195 0.23
196 0.21
197 0.17
198 0.15
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.11
205 0.18
206 0.24
207 0.33
208 0.41
209 0.46
210 0.53
211 0.63
212 0.72
213 0.74
214 0.8
215 0.82
216 0.85
217 0.88
218 0.91
219 0.9
220 0.89
221 0.89
222 0.86
223 0.84
224 0.79
225 0.75
226 0.72
227 0.72
228 0.69
229 0.67
230 0.63
231 0.59
232 0.62
233 0.59
234 0.57
235 0.5
236 0.46
237 0.41
238 0.42
239 0.39
240 0.32
241 0.32
242 0.28
243 0.26
244 0.23
245 0.2
246 0.14
247 0.12
248 0.13
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.14
254 0.18
255 0.18
256 0.2
257 0.22
258 0.24
259 0.25
260 0.28
261 0.26
262 0.23
263 0.26
264 0.28