Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PTM3

Protein Details
Accession A0A1D8PTM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-80ARLAHPRTKISEKKRLKDEIHBasic
813-832GTKPRQSRGLFKKKYKDDDDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2, pero 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0008094  F:ATP-dependent activity, acting on DNA  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0061635  P:regulation of protein complex stability  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006283  P:transcription-coupled nucleotide-excision repair  
KEGG cal:CAALFM_CR07910CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18000  DEXHc_ERCC6  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MSELDQLDVKLVDQDELETSITNKANKVLLSKDAELDEKRLSKAIKELESTQRQIANLSARLAHPRTKISEKKRLKDEIHWYEENELIPRQQDVDDIRNRLKENKIQLKKDAPQSTQSTSRLPEETERDYLIRTGKITAFGNENAFQSEQTHEQQSHVFLREPGLDNKVNDEDYAYQSDSEVDDNDNSIDKNAVRDLGETNQESESVLHNIDDGDESLYQQRLQTWVRKRASLRTQHQQEGIEEWFLPHPNIADAKLNEKFKLPGDIYPSLFDYQKTCVQWLWELYTQKTGGIIGDEMGLGKTIQIISFLAGLHYSGLLDKPVLVVVPATVLNQWVNEFHRWWPPLRCIILHSIGSGMNGSVSESKLEEYLESTDPDATQSSLHGIKSQINAQEIVDRVMEKGHVLVTTYVGLRIYSKHILPREWGYVVLDEGHKIRNPDSDISLTCKKIKTVNRIILSGTPIQNNLIELWSLFDFVFPGRLGTLPVFQQEFSIPINIGGYANSNNLQVKTAYKCAVVLRDLISPYMLRRLKSDVAQDLPKKNEMVLFVKLTKIQQELYESFLQSEDLESILKGKRNVLMGVDILRKICNHPDLVYRDTLMKRKNYGDPAKSGKMQVLKNLLRLWQSENHKTLLFCQTRQMLDILEKFVANLSLINGGDFNYLRMDGSTPISKRQMLVDAFNQDPDMHVFLLTTKVGGLGVNLTGADRVIIYDPDWNPSTDIQARERAWRLGQKRDITIYRLMTTGSIEEKIYHRQIFKTFLTNKILKDPKQRRFFKANDLHDLFTLGDQDEEGTETAQLFEGGEQSQQKYSGTKPRQSRGLFKKKYKDDDDFSQVARISGVSKLDKFEDGDHNDGDGDSTYSANEDNRIMSSIFAQSGVHSTLQHDDIISGSKEKESSLVEKEADKLATAAAEALKKSRMQTRKNTIGTPTWTGKFGSAGKFGLKRRKLLNSSSTILQNLRQKNELTESKKPDDVKVEPDRKQIMENLVEYLGDQMDNFSTSNDIIKNVKLSMSTENEMIMIRSMLREIANWDSSRKGWKLKDEFLQQHQQQPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.16
5 0.12
6 0.13
7 0.19
8 0.22
9 0.23
10 0.22
11 0.24
12 0.27
13 0.28
14 0.31
15 0.28
16 0.32
17 0.36
18 0.37
19 0.36
20 0.35
21 0.38
22 0.36
23 0.36
24 0.35
25 0.33
26 0.32
27 0.34
28 0.33
29 0.31
30 0.37
31 0.41
32 0.39
33 0.4
34 0.45
35 0.51
36 0.57
37 0.58
38 0.54
39 0.49
40 0.44
41 0.42
42 0.4
43 0.36
44 0.32
45 0.3
46 0.28
47 0.27
48 0.35
49 0.37
50 0.39
51 0.36
52 0.38
53 0.43
54 0.51
55 0.59
56 0.61
57 0.69
58 0.72
59 0.77
60 0.8
61 0.83
62 0.78
63 0.78
64 0.79
65 0.78
66 0.75
67 0.69
68 0.61
69 0.55
70 0.53
71 0.44
72 0.36
73 0.28
74 0.22
75 0.21
76 0.2
77 0.19
78 0.16
79 0.19
80 0.21
81 0.29
82 0.34
83 0.38
84 0.42
85 0.45
86 0.47
87 0.49
88 0.51
89 0.5
90 0.54
91 0.6
92 0.65
93 0.65
94 0.7
95 0.72
96 0.73
97 0.75
98 0.72
99 0.64
100 0.62
101 0.63
102 0.61
103 0.59
104 0.54
105 0.48
106 0.43
107 0.44
108 0.38
109 0.36
110 0.37
111 0.35
112 0.37
113 0.36
114 0.35
115 0.32
116 0.31
117 0.32
118 0.29
119 0.26
120 0.22
121 0.23
122 0.22
123 0.26
124 0.26
125 0.25
126 0.25
127 0.25
128 0.28
129 0.26
130 0.26
131 0.24
132 0.23
133 0.21
134 0.19
135 0.19
136 0.2
137 0.21
138 0.25
139 0.23
140 0.24
141 0.26
142 0.29
143 0.3
144 0.29
145 0.27
146 0.24
147 0.26
148 0.3
149 0.32
150 0.31
151 0.31
152 0.32
153 0.31
154 0.34
155 0.34
156 0.29
157 0.25
158 0.25
159 0.21
160 0.21
161 0.24
162 0.2
163 0.18
164 0.17
165 0.18
166 0.17
167 0.15
168 0.13
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.13
177 0.11
178 0.13
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.16
183 0.18
184 0.19
185 0.24
186 0.22
187 0.23
188 0.21
189 0.21
190 0.2
191 0.18
192 0.17
193 0.13
194 0.13
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.1
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.14
209 0.17
210 0.21
211 0.29
212 0.35
213 0.44
214 0.47
215 0.52
216 0.54
217 0.58
218 0.64
219 0.65
220 0.64
221 0.64
222 0.68
223 0.67
224 0.67
225 0.59
226 0.51
227 0.44
228 0.38
229 0.28
230 0.21
231 0.18
232 0.17
233 0.16
234 0.15
235 0.12
236 0.11
237 0.12
238 0.14
239 0.14
240 0.18
241 0.18
242 0.24
243 0.29
244 0.3
245 0.29
246 0.29
247 0.3
248 0.25
249 0.32
250 0.27
251 0.24
252 0.29
253 0.32
254 0.32
255 0.31
256 0.32
257 0.26
258 0.25
259 0.23
260 0.18
261 0.18
262 0.22
263 0.22
264 0.21
265 0.2
266 0.21
267 0.24
268 0.24
269 0.25
270 0.25
271 0.26
272 0.26
273 0.29
274 0.27
275 0.24
276 0.23
277 0.18
278 0.13
279 0.11
280 0.1
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.12
324 0.13
325 0.15
326 0.16
327 0.23
328 0.25
329 0.28
330 0.31
331 0.32
332 0.37
333 0.37
334 0.35
335 0.3
336 0.33
337 0.33
338 0.29
339 0.24
340 0.19
341 0.17
342 0.17
343 0.14
344 0.09
345 0.06
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.12
364 0.11
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.09
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.13
373 0.16
374 0.18
375 0.21
376 0.21
377 0.2
378 0.2
379 0.19
380 0.21
381 0.18
382 0.17
383 0.14
384 0.12
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.08
402 0.12
403 0.13
404 0.14
405 0.19
406 0.21
407 0.22
408 0.24
409 0.26
410 0.25
411 0.23
412 0.22
413 0.18
414 0.16
415 0.15
416 0.14
417 0.11
418 0.08
419 0.09
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.15
425 0.17
426 0.18
427 0.19
428 0.2
429 0.19
430 0.24
431 0.27
432 0.25
433 0.25
434 0.25
435 0.24
436 0.29
437 0.35
438 0.38
439 0.44
440 0.5
441 0.49
442 0.49
443 0.48
444 0.43
445 0.39
446 0.33
447 0.25
448 0.18
449 0.16
450 0.16
451 0.15
452 0.14
453 0.11
454 0.08
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.08
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.09
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.09
476 0.1
477 0.09
478 0.1
479 0.09
480 0.09
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.09
496 0.11
497 0.13
498 0.15
499 0.15
500 0.14
501 0.15
502 0.15
503 0.17
504 0.15
505 0.14
506 0.12
507 0.13
508 0.14
509 0.12
510 0.12
511 0.1
512 0.1
513 0.17
514 0.17
515 0.15
516 0.17
517 0.21
518 0.22
519 0.25
520 0.28
521 0.22
522 0.23
523 0.28
524 0.3
525 0.3
526 0.3
527 0.28
528 0.25
529 0.23
530 0.22
531 0.19
532 0.18
533 0.17
534 0.17
535 0.16
536 0.17
537 0.18
538 0.16
539 0.16
540 0.14
541 0.12
542 0.11
543 0.15
544 0.15
545 0.18
546 0.19
547 0.17
548 0.16
549 0.15
550 0.15
551 0.1
552 0.1
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.07
558 0.09
559 0.12
560 0.12
561 0.13
562 0.15
563 0.17
564 0.17
565 0.15
566 0.14
567 0.13
568 0.15
569 0.16
570 0.14
571 0.12
572 0.13
573 0.12
574 0.12
575 0.15
576 0.14
577 0.13
578 0.14
579 0.2
580 0.24
581 0.26
582 0.25
583 0.22
584 0.25
585 0.26
586 0.3
587 0.28
588 0.27
589 0.28
590 0.31
591 0.36
592 0.4
593 0.45
594 0.43
595 0.44
596 0.47
597 0.47
598 0.44
599 0.4
600 0.34
601 0.33
602 0.31
603 0.3
604 0.32
605 0.31
606 0.32
607 0.33
608 0.32
609 0.27
610 0.28
611 0.27
612 0.25
613 0.29
614 0.32
615 0.33
616 0.33
617 0.32
618 0.31
619 0.31
620 0.34
621 0.3
622 0.25
623 0.27
624 0.29
625 0.28
626 0.28
627 0.25
628 0.16
629 0.18
630 0.19
631 0.16
632 0.13
633 0.13
634 0.12
635 0.11
636 0.11
637 0.08
638 0.06
639 0.05
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.07
644 0.07
645 0.09
646 0.09
647 0.08
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.08
653 0.08
654 0.11
655 0.15
656 0.15
657 0.19
658 0.21
659 0.22
660 0.21
661 0.22
662 0.25
663 0.21
664 0.23
665 0.23
666 0.25
667 0.24
668 0.24
669 0.23
670 0.16
671 0.16
672 0.14
673 0.12
674 0.08
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.1
679 0.09
680 0.08
681 0.06
682 0.06
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.03
695 0.04
696 0.05
697 0.06
698 0.06
699 0.12
700 0.13
701 0.16
702 0.17
703 0.17
704 0.18
705 0.18
706 0.22
707 0.2
708 0.23
709 0.22
710 0.28
711 0.29
712 0.33
713 0.35
714 0.32
715 0.32
716 0.37
717 0.38
718 0.41
719 0.47
720 0.45
721 0.45
722 0.49
723 0.47
724 0.43
725 0.44
726 0.37
727 0.31
728 0.27
729 0.25
730 0.19
731 0.18
732 0.16
733 0.12
734 0.11
735 0.1
736 0.12
737 0.14
738 0.19
739 0.23
740 0.25
741 0.25
742 0.27
743 0.3
744 0.34
745 0.33
746 0.37
747 0.35
748 0.38
749 0.43
750 0.43
751 0.41
752 0.45
753 0.5
754 0.45
755 0.54
756 0.58
757 0.61
758 0.68
759 0.73
760 0.71
761 0.73
762 0.71
763 0.71
764 0.7
765 0.66
766 0.65
767 0.62
768 0.56
769 0.47
770 0.45
771 0.34
772 0.25
773 0.21
774 0.11
775 0.08
776 0.07
777 0.07
778 0.06
779 0.07
780 0.07
781 0.06
782 0.06
783 0.06
784 0.07
785 0.07
786 0.06
787 0.05
788 0.05
789 0.07
790 0.07
791 0.1
792 0.11
793 0.13
794 0.14
795 0.15
796 0.15
797 0.16
798 0.21
799 0.29
800 0.35
801 0.41
802 0.47
803 0.53
804 0.61
805 0.62
806 0.68
807 0.68
808 0.72
809 0.73
810 0.74
811 0.79
812 0.78
813 0.83
814 0.8
815 0.76
816 0.71
817 0.69
818 0.67
819 0.6
820 0.52
821 0.46
822 0.39
823 0.32
824 0.26
825 0.19
826 0.13
827 0.13
828 0.17
829 0.16
830 0.17
831 0.19
832 0.21
833 0.22
834 0.22
835 0.24
836 0.28
837 0.3
838 0.31
839 0.3
840 0.28
841 0.27
842 0.25
843 0.21
844 0.14
845 0.1
846 0.08
847 0.08
848 0.07
849 0.08
850 0.09
851 0.09
852 0.1
853 0.1
854 0.11
855 0.11
856 0.13
857 0.13
858 0.12
859 0.14
860 0.14
861 0.13
862 0.13
863 0.12
864 0.1
865 0.13
866 0.15
867 0.14
868 0.12
869 0.13
870 0.16
871 0.17
872 0.17
873 0.14
874 0.13
875 0.12
876 0.15
877 0.15
878 0.13
879 0.13
880 0.14
881 0.15
882 0.15
883 0.17
884 0.17
885 0.2
886 0.23
887 0.26
888 0.26
889 0.27
890 0.29
891 0.3
892 0.26
893 0.22
894 0.17
895 0.14
896 0.13
897 0.11
898 0.11
899 0.1
900 0.12
901 0.12
902 0.14
903 0.16
904 0.18
905 0.21
906 0.29
907 0.36
908 0.42
909 0.52
910 0.6
911 0.68
912 0.7
913 0.7
914 0.66
915 0.63
916 0.6
917 0.56
918 0.52
919 0.43
920 0.4
921 0.37
922 0.33
923 0.31
924 0.31
925 0.29
926 0.26
927 0.26
928 0.31
929 0.36
930 0.42
931 0.48
932 0.48
933 0.5
934 0.53
935 0.62
936 0.62
937 0.64
938 0.66
939 0.61
940 0.61
941 0.59
942 0.54
943 0.47
944 0.42
945 0.4
946 0.4
947 0.4
948 0.41
949 0.4
950 0.39
951 0.4
952 0.48
953 0.51
954 0.5
955 0.53
956 0.56
957 0.57
958 0.61
959 0.59
960 0.55
961 0.54
962 0.5
963 0.5
964 0.53
965 0.57
966 0.56
967 0.62
968 0.62
969 0.55
970 0.55
971 0.5
972 0.46
973 0.43
974 0.39
975 0.34
976 0.3
977 0.28
978 0.26
979 0.22
980 0.16
981 0.11
982 0.09
983 0.08
984 0.09
985 0.1
986 0.1
987 0.09
988 0.1
989 0.11
990 0.15
991 0.15
992 0.17
993 0.18
994 0.2
995 0.23
996 0.22
997 0.23
998 0.2
999 0.22
1000 0.26
1001 0.3
1002 0.29
1003 0.27
1004 0.26
1005 0.25
1006 0.24
1007 0.22
1008 0.17
1009 0.11
1010 0.1
1011 0.1
1012 0.1
1013 0.12
1014 0.12
1015 0.13
1016 0.15
1017 0.21
1018 0.26
1019 0.27
1020 0.28
1021 0.29
1022 0.31
1023 0.38
1024 0.39
1025 0.42
1026 0.42
1027 0.52
1028 0.58
1029 0.62
1030 0.68
1031 0.71
1032 0.73
1033 0.72
1034 0.76
1035 0.69