Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DSH5

Protein Details
Accession B0DSH5    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-199QQAFKFCLKHQRKVEFRRLCHydrophilic
683-702KVKIEEEKKKRRNAVAKAREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
495-534VRKEKEASSRRAELSRREKEEEARRVREDLRKREQERTKK
670-737KKGEEFARKKEAAKVKIEEEKKKRRNAVAKAREEERRRVEREEKEKAEKEAEERRIAEERRAEEERLR
751-753KRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 12.166, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027512  EIF3A  
IPR000717  PCI_dom  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_191687  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MAPFSKPETVLKQAEGLVSVGQTHAALQSLTEMFSSKRFRSTPLTSLEPIMHRFIELCVEMRKGRPAKEGLMQYKNIAQNTNVQSIEAVITRFVQLADSKVREAQEKAAVKSAVDVDDLEASETPESILLGAVSGDQSKDRTDRALVTPWLKFLWESYRTSLETLKNNTRLEAIYQQIAQQAFKFCLKHQRKVEFRRLCETLRLHLSNVAKYSHQQHSINLSDPDTLQHHLDTRFAQLNTSVELELWQEAFRSVEDVHNLLNMAKKAPRPAMMANYYEKLTKIFLMSGNALYHAAAWSRYYAIILSIGADASYSPYLTLLQRALLSRLLSQLSQVYSTIKIDNLLALVAPLKEAGIEGAYEEEQIEAYIMGCARRGELNIRVDHKDGSITFVDDAFVSADELQQPTASTSTSTARGESSIQPSVAELVRTRLSKVATCLHNSLHKIEESPEALSPEEQAEKFKALVVAVESERKALQLKRAIVARRRELLSELSVRKEKEASSRRAELSRREKEEEARRVREDLRKREQERTKKEIESIRIDEAKKYAQSLVDKGILKPNDVDLESIDTEGLITIQVAQLEKEKKELSERLRIIAKRIDHTERAYRKEEQPLIAQDYERQQATDKDTVEAIQRARLEAAGKAHQDDLATKARLSRMMGDYQSRRQEIIAKKGEEFARKKEAAKVKIEEEKKKRRNAVAKAREEERRRVEREEKEKAEKEAEERRIAEERRAEEERLREEEEAKAAAEEEAKRRAAEEVEQRRKQRELERQEAADKAKLQLQREEEAEAHRRQRAAEKAAPTRAPLAAPTALRATKDEPSSPSPAVAPARFGRGGAAAPAGGGWRAREAKNAGGAASAVPPQVNAPPARVGSPAPPVNGEQAKEGDDGFQTVRGGGVWRARRGGRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.3
3 0.24
4 0.18
5 0.15
6 0.14
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.2
22 0.27
23 0.25
24 0.32
25 0.32
26 0.37
27 0.44
28 0.5
29 0.5
30 0.49
31 0.53
32 0.47
33 0.49
34 0.48
35 0.43
36 0.4
37 0.36
38 0.3
39 0.24
40 0.23
41 0.22
42 0.22
43 0.19
44 0.19
45 0.19
46 0.22
47 0.25
48 0.26
49 0.35
50 0.36
51 0.38
52 0.43
53 0.44
54 0.44
55 0.5
56 0.57
57 0.56
58 0.57
59 0.54
60 0.49
61 0.52
62 0.52
63 0.46
64 0.39
65 0.31
66 0.35
67 0.38
68 0.42
69 0.35
70 0.3
71 0.28
72 0.28
73 0.28
74 0.2
75 0.16
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.12
82 0.11
83 0.15
84 0.22
85 0.23
86 0.24
87 0.26
88 0.28
89 0.3
90 0.31
91 0.31
92 0.33
93 0.36
94 0.37
95 0.4
96 0.38
97 0.34
98 0.35
99 0.32
100 0.24
101 0.2
102 0.18
103 0.13
104 0.15
105 0.15
106 0.13
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.12
126 0.14
127 0.15
128 0.17
129 0.19
130 0.23
131 0.26
132 0.32
133 0.34
134 0.36
135 0.36
136 0.34
137 0.32
138 0.28
139 0.24
140 0.2
141 0.24
142 0.24
143 0.26
144 0.28
145 0.32
146 0.33
147 0.34
148 0.37
149 0.34
150 0.36
151 0.41
152 0.45
153 0.48
154 0.47
155 0.46
156 0.43
157 0.38
158 0.35
159 0.33
160 0.27
161 0.23
162 0.23
163 0.23
164 0.25
165 0.25
166 0.22
167 0.19
168 0.19
169 0.19
170 0.23
171 0.23
172 0.22
173 0.32
174 0.39
175 0.45
176 0.51
177 0.59
178 0.65
179 0.73
180 0.81
181 0.79
182 0.76
183 0.74
184 0.69
185 0.61
186 0.59
187 0.52
188 0.47
189 0.46
190 0.43
191 0.37
192 0.39
193 0.39
194 0.35
195 0.34
196 0.3
197 0.23
198 0.24
199 0.3
200 0.31
201 0.35
202 0.33
203 0.33
204 0.39
205 0.4
206 0.41
207 0.36
208 0.3
209 0.25
210 0.24
211 0.23
212 0.19
213 0.18
214 0.15
215 0.15
216 0.18
217 0.17
218 0.19
219 0.18
220 0.2
221 0.24
222 0.23
223 0.23
224 0.21
225 0.21
226 0.2
227 0.21
228 0.16
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.07
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.11
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.16
252 0.18
253 0.22
254 0.25
255 0.27
256 0.27
257 0.3
258 0.34
259 0.34
260 0.35
261 0.34
262 0.32
263 0.3
264 0.27
265 0.24
266 0.18
267 0.15
268 0.13
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.14
273 0.15
274 0.16
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.12
279 0.11
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.07
304 0.08
305 0.1
306 0.08
307 0.09
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.13
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.03
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.11
364 0.17
365 0.21
366 0.24
367 0.27
368 0.28
369 0.28
370 0.28
371 0.25
372 0.21
373 0.16
374 0.16
375 0.13
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.08
381 0.09
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.09
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.12
403 0.14
404 0.15
405 0.18
406 0.16
407 0.16
408 0.15
409 0.15
410 0.16
411 0.14
412 0.12
413 0.08
414 0.09
415 0.12
416 0.13
417 0.14
418 0.14
419 0.15
420 0.15
421 0.18
422 0.22
423 0.21
424 0.23
425 0.24
426 0.23
427 0.26
428 0.26
429 0.24
430 0.2
431 0.18
432 0.16
433 0.16
434 0.17
435 0.14
436 0.14
437 0.13
438 0.12
439 0.12
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.1
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.09
455 0.08
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.1
461 0.12
462 0.12
463 0.17
464 0.21
465 0.22
466 0.24
467 0.29
468 0.33
469 0.36
470 0.41
471 0.39
472 0.37
473 0.37
474 0.35
475 0.32
476 0.29
477 0.26
478 0.26
479 0.24
480 0.23
481 0.25
482 0.25
483 0.24
484 0.23
485 0.21
486 0.25
487 0.32
488 0.34
489 0.37
490 0.41
491 0.42
492 0.45
493 0.46
494 0.46
495 0.48
496 0.5
497 0.49
498 0.49
499 0.49
500 0.51
501 0.58
502 0.59
503 0.56
504 0.52
505 0.49
506 0.48
507 0.51
508 0.52
509 0.51
510 0.51
511 0.53
512 0.59
513 0.61
514 0.68
515 0.72
516 0.74
517 0.73
518 0.71
519 0.67
520 0.59
521 0.61
522 0.56
523 0.52
524 0.48
525 0.42
526 0.4
527 0.39
528 0.38
529 0.34
530 0.3
531 0.28
532 0.22
533 0.2
534 0.18
535 0.16
536 0.18
537 0.19
538 0.2
539 0.23
540 0.23
541 0.23
542 0.28
543 0.25
544 0.24
545 0.22
546 0.21
547 0.17
548 0.17
549 0.17
550 0.11
551 0.14
552 0.13
553 0.13
554 0.11
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.04
563 0.05
564 0.05
565 0.06
566 0.11
567 0.15
568 0.15
569 0.18
570 0.19
571 0.19
572 0.24
573 0.31
574 0.3
575 0.37
576 0.37
577 0.37
578 0.43
579 0.43
580 0.41
581 0.39
582 0.37
583 0.31
584 0.35
585 0.36
586 0.32
587 0.36
588 0.42
589 0.43
590 0.45
591 0.45
592 0.45
593 0.45
594 0.5
595 0.5
596 0.42
597 0.41
598 0.4
599 0.4
600 0.37
601 0.33
602 0.27
603 0.27
604 0.27
605 0.23
606 0.2
607 0.17
608 0.19
609 0.25
610 0.26
611 0.23
612 0.22
613 0.22
614 0.22
615 0.24
616 0.23
617 0.18
618 0.17
619 0.17
620 0.17
621 0.17
622 0.17
623 0.15
624 0.14
625 0.18
626 0.18
627 0.19
628 0.19
629 0.19
630 0.19
631 0.18
632 0.17
633 0.18
634 0.2
635 0.2
636 0.19
637 0.21
638 0.22
639 0.24
640 0.24
641 0.25
642 0.22
643 0.26
644 0.28
645 0.32
646 0.35
647 0.39
648 0.44
649 0.39
650 0.37
651 0.33
652 0.39
653 0.38
654 0.44
655 0.45
656 0.41
657 0.4
658 0.46
659 0.49
660 0.49
661 0.47
662 0.42
663 0.43
664 0.44
665 0.45
666 0.48
667 0.53
668 0.5
669 0.53
670 0.51
671 0.48
672 0.54
673 0.59
674 0.61
675 0.62
676 0.68
677 0.69
678 0.74
679 0.75
680 0.76
681 0.79
682 0.79
683 0.8
684 0.79
685 0.8
686 0.76
687 0.74
688 0.73
689 0.69
690 0.67
691 0.64
692 0.62
693 0.58
694 0.6
695 0.64
696 0.65
697 0.69
698 0.71
699 0.68
700 0.68
701 0.68
702 0.64
703 0.6
704 0.52
705 0.49
706 0.49
707 0.48
708 0.43
709 0.41
710 0.42
711 0.45
712 0.44
713 0.44
714 0.4
715 0.38
716 0.4
717 0.42
718 0.41
719 0.38
720 0.42
721 0.41
722 0.39
723 0.39
724 0.33
725 0.32
726 0.32
727 0.29
728 0.24
729 0.2
730 0.15
731 0.13
732 0.13
733 0.15
734 0.16
735 0.18
736 0.22
737 0.23
738 0.23
739 0.23
740 0.25
741 0.22
742 0.26
743 0.33
744 0.39
745 0.49
746 0.55
747 0.59
748 0.61
749 0.62
750 0.62
751 0.61
752 0.61
753 0.6
754 0.61
755 0.63
756 0.62
757 0.62
758 0.59
759 0.52
760 0.46
761 0.38
762 0.32
763 0.32
764 0.32
765 0.32
766 0.34
767 0.36
768 0.35
769 0.34
770 0.35
771 0.31
772 0.34
773 0.37
774 0.37
775 0.38
776 0.38
777 0.37
778 0.37
779 0.43
780 0.45
781 0.47
782 0.47
783 0.5
784 0.54
785 0.6
786 0.59
787 0.52
788 0.47
789 0.41
790 0.35
791 0.28
792 0.25
793 0.22
794 0.21
795 0.22
796 0.24
797 0.24
798 0.25
799 0.27
800 0.26
801 0.28
802 0.31
803 0.32
804 0.32
805 0.36
806 0.4
807 0.38
808 0.35
809 0.3
810 0.32
811 0.35
812 0.3
813 0.3
814 0.27
815 0.32
816 0.31
817 0.3
818 0.26
819 0.22
820 0.22
821 0.18
822 0.17
823 0.11
824 0.1
825 0.11
826 0.1
827 0.09
828 0.09
829 0.09
830 0.14
831 0.2
832 0.2
833 0.27
834 0.29
835 0.33
836 0.38
837 0.38
838 0.31
839 0.27
840 0.27
841 0.21
842 0.2
843 0.17
844 0.12
845 0.11
846 0.11
847 0.12
848 0.15
849 0.19
850 0.18
851 0.19
852 0.24
853 0.25
854 0.26
855 0.26
856 0.25
857 0.24
858 0.32
859 0.33
860 0.3
861 0.31
862 0.31
863 0.37
864 0.39
865 0.36
866 0.3
867 0.29
868 0.3
869 0.28
870 0.27
871 0.21
872 0.18
873 0.19
874 0.16
875 0.17
876 0.15
877 0.14
878 0.14
879 0.13
880 0.14
881 0.16
882 0.24
883 0.28
884 0.32
885 0.38