Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DM54

Protein Details
Accession B0DM54    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47NSDVEKKKKLGKYTDQRTEFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_330694  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MPDPSSSSIEEPAPTDQMEDLFAEYGINSDVEKKKKLGKYTDQRTEFEWKAFKTFEDGSFDEFKKALIADYPDARNAGKGTLTGLRAGTTKITHGAASTGCLTDSFADQVKASLNIEQTRDRKQKGNEDETTARRTEDPYDIIDIIDMAETIAGRLTGDSRDHPSNARAVSTGRSVQAREREIKTEHDEFEELRSITATFLDQIKVDQKQNSELRNMVQNTQIEMKKLLETLVHQQPNISNPQSKVASYKMTSDGCWYCDEPGHFTSNCPHREAHVAQKKIKLLGNRMYFTHNNTAVPRGNGEKSVRQIVEEASRQNSTLQNNMFAEPGEVFSQEAVVPGIIRLPDNNNGNEISVFTNQMRDTRDDVILNMNNQVLKLTDMLANLVTNPNKTRDVDVSQFAVTRRSQTETQGQSGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.17
4 0.16
5 0.16
6 0.14
7 0.13
8 0.11
9 0.11
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.07
16 0.15
17 0.22
18 0.27
19 0.31
20 0.34
21 0.43
22 0.49
23 0.57
24 0.59
25 0.63
26 0.69
27 0.76
28 0.83
29 0.78
30 0.73
31 0.69
32 0.67
33 0.59
34 0.53
35 0.48
36 0.39
37 0.39
38 0.39
39 0.35
40 0.32
41 0.33
42 0.3
43 0.31
44 0.31
45 0.31
46 0.37
47 0.37
48 0.33
49 0.3
50 0.26
51 0.21
52 0.2
53 0.16
54 0.14
55 0.17
56 0.19
57 0.24
58 0.26
59 0.25
60 0.26
61 0.26
62 0.24
63 0.2
64 0.18
65 0.13
66 0.12
67 0.14
68 0.17
69 0.18
70 0.18
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.17
76 0.13
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.16
102 0.18
103 0.2
104 0.26
105 0.28
106 0.37
107 0.44
108 0.44
109 0.47
110 0.5
111 0.57
112 0.6
113 0.65
114 0.58
115 0.58
116 0.6
117 0.57
118 0.55
119 0.45
120 0.37
121 0.29
122 0.28
123 0.25
124 0.22
125 0.21
126 0.18
127 0.21
128 0.2
129 0.19
130 0.17
131 0.13
132 0.1
133 0.08
134 0.06
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.1
147 0.15
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.2
152 0.22
153 0.21
154 0.2
155 0.16
156 0.15
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.14
161 0.15
162 0.16
163 0.19
164 0.24
165 0.26
166 0.28
167 0.29
168 0.31
169 0.31
170 0.34
171 0.36
172 0.33
173 0.31
174 0.27
175 0.26
176 0.22
177 0.22
178 0.22
179 0.16
180 0.13
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.08
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.11
192 0.13
193 0.15
194 0.17
195 0.16
196 0.23
197 0.27
198 0.28
199 0.27
200 0.25
201 0.24
202 0.28
203 0.28
204 0.23
205 0.22
206 0.21
207 0.21
208 0.25
209 0.25
210 0.19
211 0.19
212 0.19
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.09
217 0.1
218 0.16
219 0.23
220 0.23
221 0.22
222 0.23
223 0.24
224 0.25
225 0.28
226 0.24
227 0.19
228 0.19
229 0.24
230 0.24
231 0.23
232 0.23
233 0.21
234 0.23
235 0.2
236 0.22
237 0.22
238 0.22
239 0.22
240 0.25
241 0.23
242 0.21
243 0.22
244 0.2
245 0.16
246 0.18
247 0.19
248 0.18
249 0.19
250 0.21
251 0.19
252 0.19
253 0.26
254 0.31
255 0.32
256 0.3
257 0.28
258 0.26
259 0.33
260 0.35
261 0.38
262 0.39
263 0.43
264 0.45
265 0.49
266 0.5
267 0.47
268 0.47
269 0.41
270 0.39
271 0.42
272 0.44
273 0.41
274 0.4
275 0.42
276 0.4
277 0.4
278 0.41
279 0.34
280 0.3
281 0.3
282 0.33
283 0.3
284 0.29
285 0.27
286 0.23
287 0.23
288 0.26
289 0.28
290 0.28
291 0.29
292 0.35
293 0.33
294 0.29
295 0.3
296 0.27
297 0.3
298 0.29
299 0.28
300 0.24
301 0.25
302 0.24
303 0.26
304 0.28
305 0.24
306 0.27
307 0.26
308 0.27
309 0.28
310 0.29
311 0.26
312 0.22
313 0.21
314 0.15
315 0.15
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.1
331 0.13
332 0.2
333 0.24
334 0.25
335 0.25
336 0.25
337 0.26
338 0.24
339 0.21
340 0.18
341 0.15
342 0.17
343 0.15
344 0.19
345 0.19
346 0.23
347 0.25
348 0.25
349 0.27
350 0.29
351 0.32
352 0.28
353 0.28
354 0.32
355 0.32
356 0.29
357 0.28
358 0.25
359 0.23
360 0.22
361 0.21
362 0.14
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.13
371 0.13
372 0.19
373 0.19
374 0.2
375 0.23
376 0.26
377 0.29
378 0.31
379 0.35
380 0.34
381 0.4
382 0.41
383 0.42
384 0.4
385 0.37
386 0.38
387 0.34
388 0.33
389 0.27
390 0.28
391 0.27
392 0.31
393 0.31
394 0.35
395 0.44
396 0.45