Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DIK4

Protein Details
Accession B0DIK4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-33LVYAKMIKKRFREKINMMKGQNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 4.5, cyto_nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007205  Protein_HGH1_N  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_302899  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04063  DUF383  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MGPRTLCNACGLVYAKMIKKRFREKINMMKGQNGKHIPPQATGDDSLKGESKDDDGYSQDLWSELVEMASISSYQKVDDTVQEGQTCLGCNATSTPEWRRGPMGPRTLCNACGLVYAKLQPKLSLLHSLWHIPWPCYSTAFIDTKLLLDSVSPTGRNFFLSPQPTNVFKPEVNLEYALAKLVPFTEHKNIIRRGGVASTIKDCSFHAAGQKAILSPESALVSVTPSKLQSRGIDALPYLLLSDPKNSNSTFDQEKLLEPLQFLPPTKTRKSDSTIRLTPVETLHLLCHTRWGRDYLRQHGVTRSCVQHIWQRRSTRSLNILRGLCSLSMATNLRSPRQRSWMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.37
4 0.43
5 0.46
6 0.53
7 0.62
8 0.67
9 0.71
10 0.75
11 0.78
12 0.83
13 0.86
14 0.85
15 0.76
16 0.75
17 0.72
18 0.66
19 0.65
20 0.58
21 0.5
22 0.48
23 0.54
24 0.48
25 0.45
26 0.45
27 0.39
28 0.38
29 0.38
30 0.32
31 0.27
32 0.26
33 0.25
34 0.23
35 0.2
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.17
42 0.16
43 0.18
44 0.17
45 0.16
46 0.14
47 0.12
48 0.11
49 0.1
50 0.09
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.1
64 0.11
65 0.13
66 0.17
67 0.18
68 0.2
69 0.2
70 0.2
71 0.19
72 0.19
73 0.17
74 0.13
75 0.11
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.12
80 0.12
81 0.15
82 0.18
83 0.27
84 0.28
85 0.29
86 0.3
87 0.32
88 0.37
89 0.42
90 0.47
91 0.41
92 0.42
93 0.46
94 0.44
95 0.4
96 0.36
97 0.3
98 0.21
99 0.23
100 0.24
101 0.19
102 0.19
103 0.23
104 0.24
105 0.26
106 0.26
107 0.21
108 0.21
109 0.22
110 0.23
111 0.25
112 0.21
113 0.2
114 0.21
115 0.23
116 0.22
117 0.24
118 0.24
119 0.18
120 0.19
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.18
125 0.15
126 0.18
127 0.18
128 0.18
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.14
133 0.12
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.16
147 0.2
148 0.21
149 0.22
150 0.24
151 0.25
152 0.26
153 0.26
154 0.22
155 0.18
156 0.19
157 0.18
158 0.17
159 0.15
160 0.15
161 0.13
162 0.11
163 0.11
164 0.09
165 0.07
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.06
171 0.1
172 0.14
173 0.18
174 0.21
175 0.28
176 0.3
177 0.31
178 0.31
179 0.28
180 0.25
181 0.21
182 0.22
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.17
187 0.16
188 0.15
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.17
197 0.17
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.13
215 0.16
216 0.15
217 0.19
218 0.22
219 0.21
220 0.21
221 0.19
222 0.19
223 0.16
224 0.15
225 0.1
226 0.07
227 0.09
228 0.08
229 0.13
230 0.14
231 0.16
232 0.19
233 0.18
234 0.21
235 0.21
236 0.25
237 0.25
238 0.24
239 0.25
240 0.24
241 0.25
242 0.26
243 0.25
244 0.21
245 0.18
246 0.19
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.23
251 0.28
252 0.34
253 0.37
254 0.4
255 0.4
256 0.43
257 0.48
258 0.53
259 0.54
260 0.57
261 0.57
262 0.56
263 0.54
264 0.49
265 0.45
266 0.36
267 0.32
268 0.23
269 0.2
270 0.17
271 0.19
272 0.2
273 0.17
274 0.26
275 0.25
276 0.27
277 0.28
278 0.33
279 0.34
280 0.42
281 0.49
282 0.48
283 0.55
284 0.55
285 0.55
286 0.57
287 0.56
288 0.52
289 0.51
290 0.47
291 0.4
292 0.38
293 0.39
294 0.4
295 0.47
296 0.5
297 0.51
298 0.56
299 0.58
300 0.65
301 0.66
302 0.65
303 0.65
304 0.65
305 0.64
306 0.63
307 0.61
308 0.55
309 0.53
310 0.46
311 0.36
312 0.29
313 0.22
314 0.15
315 0.18
316 0.19
317 0.18
318 0.22
319 0.25
320 0.31
321 0.39
322 0.44
323 0.46