Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S0DZQ4

Protein Details
Accession S0DZQ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-63LDCLGRQYHRQPRRRDDPLTRRPYAHydrophilic
295-316EQAFGRCKRKWKIIRNSAPEYSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, pero 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027806  HARBI1_dom  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13359  DDE_Tnp_4  
Amino Acid Sequences MYEGYLSQLGLHDDFIYRIIIDDFNDQQLRRSAVIMTFLDCLGRQYHRQPRRRDDPLTRRPYADILADSRAHTSWLLAAPDNNTQAGDSRHQSLELKLMIFLWIMAYGEPQRNTAYRFKVSQSTVSDIFSYLIDFMRYLHTKFVRMPDHRYVSPRIELNTKFCQFNGAIGAVDGTHIPAFIPLAHQQRFWSRKSTISQNIFAAVDFEGRFLYVLAGAKGSINDATLIGYAHNGSFKVPPGRFFLANAGFGSRRGILIPFTRVRYHLQDWGDAAKRPVNEIELYNLRHAQLRTIVEQAFGRCKRKWKIIRNSAPEYSFSNQIKIIYAVTGLYNFLAFEGKEPELGHEEEGLPSWEIRALRRARRRADMVVTGRSGIDMRSLIANWLWSTYQAYLELQNDSESEEIDEEGSVVEEVEDGDEIEVIAEEADQREAISSSQELD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.13
4 0.1
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.13
9 0.17
10 0.18
11 0.23
12 0.27
13 0.26
14 0.28
15 0.32
16 0.34
17 0.3
18 0.29
19 0.26
20 0.24
21 0.29
22 0.26
23 0.23
24 0.21
25 0.2
26 0.2
27 0.17
28 0.17
29 0.15
30 0.18
31 0.21
32 0.29
33 0.4
34 0.49
35 0.58
36 0.66
37 0.73
38 0.79
39 0.83
40 0.82
41 0.83
42 0.84
43 0.86
44 0.85
45 0.78
46 0.7
47 0.63
48 0.57
49 0.48
50 0.41
51 0.33
52 0.27
53 0.28
54 0.28
55 0.26
56 0.26
57 0.23
58 0.21
59 0.17
60 0.15
61 0.14
62 0.16
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.19
67 0.23
68 0.24
69 0.2
70 0.17
71 0.15
72 0.17
73 0.19
74 0.21
75 0.19
76 0.22
77 0.22
78 0.24
79 0.25
80 0.24
81 0.26
82 0.24
83 0.22
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.15
88 0.13
89 0.08
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.1
95 0.15
96 0.16
97 0.17
98 0.18
99 0.2
100 0.24
101 0.29
102 0.32
103 0.31
104 0.33
105 0.34
106 0.39
107 0.39
108 0.41
109 0.38
110 0.37
111 0.34
112 0.32
113 0.3
114 0.24
115 0.22
116 0.16
117 0.13
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.2
127 0.21
128 0.23
129 0.26
130 0.33
131 0.36
132 0.37
133 0.43
134 0.45
135 0.49
136 0.49
137 0.5
138 0.47
139 0.42
140 0.43
141 0.38
142 0.32
143 0.32
144 0.32
145 0.34
146 0.38
147 0.36
148 0.33
149 0.31
150 0.32
151 0.26
152 0.26
153 0.22
154 0.14
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.07
169 0.11
170 0.18
171 0.19
172 0.19
173 0.21
174 0.29
175 0.33
176 0.32
177 0.33
178 0.28
179 0.33
180 0.37
181 0.43
182 0.43
183 0.44
184 0.44
185 0.38
186 0.38
187 0.33
188 0.29
189 0.21
190 0.13
191 0.11
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.1
223 0.16
224 0.16
225 0.18
226 0.23
227 0.26
228 0.25
229 0.24
230 0.27
231 0.22
232 0.23
233 0.21
234 0.17
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.11
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.11
244 0.17
245 0.18
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.25
250 0.29
251 0.29
252 0.3
253 0.28
254 0.27
255 0.27
256 0.3
257 0.29
258 0.24
259 0.23
260 0.2
261 0.19
262 0.19
263 0.18
264 0.16
265 0.15
266 0.15
267 0.18
268 0.2
269 0.21
270 0.21
271 0.22
272 0.2
273 0.23
274 0.22
275 0.19
276 0.2
277 0.21
278 0.21
279 0.24
280 0.24
281 0.21
282 0.22
283 0.22
284 0.26
285 0.28
286 0.31
287 0.3
288 0.39
289 0.44
290 0.53
291 0.61
292 0.63
293 0.7
294 0.76
295 0.83
296 0.83
297 0.83
298 0.77
299 0.68
300 0.59
301 0.52
302 0.43
303 0.41
304 0.33
305 0.29
306 0.26
307 0.25
308 0.24
309 0.21
310 0.19
311 0.11
312 0.11
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.06
323 0.08
324 0.12
325 0.12
326 0.14
327 0.14
328 0.16
329 0.18
330 0.19
331 0.18
332 0.16
333 0.16
334 0.14
335 0.15
336 0.14
337 0.11
338 0.1
339 0.1
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.22
344 0.28
345 0.37
346 0.47
347 0.55
348 0.58
349 0.65
350 0.68
351 0.66
352 0.64
353 0.64
354 0.59
355 0.55
356 0.5
357 0.42
358 0.37
359 0.32
360 0.26
361 0.17
362 0.15
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.15
370 0.12
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.15
375 0.14
376 0.15
377 0.15
378 0.16
379 0.18
380 0.19
381 0.2
382 0.18
383 0.17
384 0.16
385 0.16
386 0.15
387 0.12
388 0.11
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.06
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.04
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.09
418 0.1
419 0.1
420 0.12