Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S0DX12

Protein Details
Accession S0DX12    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
301-323GEDKRKRRDYRQARKEQFKRPEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-39KKG
45-63SKATDKPAKEASPPPRKRS
304-321KRKRRDYRQARKEQFKRP
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSAEDDSSDLSSLSSLSPVPSDIELDEPTQEPVAKPKKGIQKYFSKATDKPAKEASPPPRKRSPSPPHEYVLADNPDIAFIVMFRSRFNDAFPKSLAHFGPQELERDIVEPIPGDRAEHFLCALLGLLLNRKQDVKPGHYGRALEDAVSTHKNQWAPAWEDKSPLAGGATFASMNPTKRLTLLRYLILWTLSSSDTVKGLINQSYKQNRHEDDTNQPRSVQPWGSDGDKRRYFLIEGQDDTAFRVYRESNPAGTNRTWWSVAGTIEELKTLAEKLQVKDGGPKATKLAQKMFSAVPRFEAGEDKRKRRDYRQARKEQFKRPEPGFSLYEGRTRGKKMKYTYSDDEDIFTTDSTTRRSTRNTGTHTPVETGPVTTASGRQIKAPTRLNPTTGSSAPGSVQGDTSEVDREQSVGPTGRPRRSAAVNHGTTGWVENNKGPRHNASDDSDDESEADFGDDEEDVDEHVPDESEDEDDFDDEAMIDDDLEEKNRSLVVKLSVTPPKLRNVLGPNSQAGNKLPTPSSDKGGEEHRLGESPLVEMQDAPEATSSKEAQAAAQPSPTLNMNFAERDNASPAALHATSLAFRGSPEKTQAHPVPRPLDVGANHE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.13
7 0.12
8 0.14
9 0.13
10 0.16
11 0.17
12 0.17
13 0.18
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.15
19 0.24
20 0.32
21 0.33
22 0.35
23 0.41
24 0.5
25 0.58
26 0.66
27 0.63
28 0.65
29 0.69
30 0.76
31 0.75
32 0.71
33 0.64
34 0.66
35 0.69
36 0.6
37 0.58
38 0.57
39 0.53
40 0.52
41 0.58
42 0.59
43 0.6
44 0.65
45 0.68
46 0.7
47 0.74
48 0.75
49 0.77
50 0.77
51 0.77
52 0.78
53 0.76
54 0.69
55 0.66
56 0.61
57 0.53
58 0.5
59 0.43
60 0.34
61 0.29
62 0.26
63 0.22
64 0.21
65 0.17
66 0.09
67 0.05
68 0.09
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.15
73 0.19
74 0.2
75 0.24
76 0.29
77 0.29
78 0.33
79 0.33
80 0.33
81 0.31
82 0.36
83 0.33
84 0.27
85 0.26
86 0.23
87 0.27
88 0.25
89 0.26
90 0.22
91 0.23
92 0.19
93 0.18
94 0.18
95 0.13
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.16
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.11
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.18
119 0.18
120 0.25
121 0.3
122 0.32
123 0.38
124 0.42
125 0.47
126 0.47
127 0.48
128 0.42
129 0.43
130 0.37
131 0.27
132 0.22
133 0.18
134 0.19
135 0.21
136 0.2
137 0.16
138 0.2
139 0.21
140 0.21
141 0.23
142 0.26
143 0.29
144 0.34
145 0.37
146 0.33
147 0.35
148 0.34
149 0.33
150 0.27
151 0.21
152 0.14
153 0.1
154 0.1
155 0.08
156 0.09
157 0.07
158 0.07
159 0.11
160 0.12
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.18
166 0.22
167 0.22
168 0.27
169 0.28
170 0.28
171 0.27
172 0.28
173 0.26
174 0.23
175 0.2
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.13
187 0.16
188 0.17
189 0.19
190 0.27
191 0.35
192 0.38
193 0.4
194 0.45
195 0.42
196 0.45
197 0.48
198 0.44
199 0.45
200 0.52
201 0.53
202 0.47
203 0.45
204 0.41
205 0.38
206 0.38
207 0.29
208 0.2
209 0.18
210 0.19
211 0.21
212 0.26
213 0.29
214 0.34
215 0.35
216 0.35
217 0.33
218 0.33
219 0.31
220 0.31
221 0.33
222 0.27
223 0.26
224 0.27
225 0.26
226 0.25
227 0.24
228 0.22
229 0.14
230 0.1
231 0.12
232 0.11
233 0.14
234 0.2
235 0.21
236 0.21
237 0.23
238 0.25
239 0.26
240 0.25
241 0.25
242 0.21
243 0.21
244 0.19
245 0.17
246 0.17
247 0.15
248 0.15
249 0.13
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.06
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.1
260 0.13
261 0.14
262 0.19
263 0.2
264 0.2
265 0.26
266 0.28
267 0.29
268 0.26
269 0.26
270 0.23
271 0.28
272 0.3
273 0.27
274 0.29
275 0.27
276 0.26
277 0.28
278 0.28
279 0.26
280 0.26
281 0.23
282 0.2
283 0.17
284 0.17
285 0.15
286 0.19
287 0.17
288 0.25
289 0.3
290 0.34
291 0.41
292 0.48
293 0.51
294 0.54
295 0.62
296 0.63
297 0.69
298 0.74
299 0.79
300 0.79
301 0.86
302 0.86
303 0.85
304 0.83
305 0.78
306 0.74
307 0.65
308 0.62
309 0.55
310 0.51
311 0.43
312 0.36
313 0.33
314 0.27
315 0.29
316 0.25
317 0.25
318 0.23
319 0.25
320 0.3
321 0.3
322 0.35
323 0.37
324 0.44
325 0.48
326 0.53
327 0.54
328 0.52
329 0.51
330 0.45
331 0.41
332 0.32
333 0.27
334 0.2
335 0.15
336 0.11
337 0.09
338 0.1
339 0.12
340 0.15
341 0.16
342 0.19
343 0.22
344 0.27
345 0.34
346 0.4
347 0.44
348 0.46
349 0.49
350 0.5
351 0.47
352 0.44
353 0.36
354 0.31
355 0.24
356 0.19
357 0.14
358 0.12
359 0.11
360 0.09
361 0.11
362 0.12
363 0.16
364 0.16
365 0.18
366 0.22
367 0.26
368 0.33
369 0.38
370 0.39
371 0.43
372 0.44
373 0.44
374 0.41
375 0.4
376 0.38
377 0.32
378 0.29
379 0.21
380 0.2
381 0.18
382 0.19
383 0.17
384 0.13
385 0.12
386 0.1
387 0.11
388 0.1
389 0.11
390 0.09
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.12
398 0.11
399 0.13
400 0.21
401 0.28
402 0.31
403 0.33
404 0.34
405 0.36
406 0.4
407 0.44
408 0.44
409 0.47
410 0.44
411 0.42
412 0.4
413 0.36
414 0.31
415 0.28
416 0.21
417 0.13
418 0.14
419 0.17
420 0.24
421 0.27
422 0.29
423 0.3
424 0.31
425 0.36
426 0.38
427 0.39
428 0.35
429 0.37
430 0.36
431 0.38
432 0.34
433 0.28
434 0.25
435 0.21
436 0.17
437 0.12
438 0.11
439 0.06
440 0.05
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.08
459 0.09
460 0.09
461 0.08
462 0.08
463 0.06
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.07
471 0.09
472 0.1
473 0.09
474 0.1
475 0.12
476 0.13
477 0.12
478 0.15
479 0.18
480 0.2
481 0.22
482 0.28
483 0.32
484 0.35
485 0.4
486 0.39
487 0.41
488 0.41
489 0.4
490 0.4
491 0.41
492 0.46
493 0.46
494 0.46
495 0.42
496 0.41
497 0.41
498 0.37
499 0.32
500 0.3
501 0.25
502 0.26
503 0.24
504 0.25
505 0.32
506 0.32
507 0.35
508 0.32
509 0.31
510 0.31
511 0.36
512 0.37
513 0.3
514 0.3
515 0.27
516 0.25
517 0.25
518 0.24
519 0.18
520 0.15
521 0.16
522 0.15
523 0.13
524 0.12
525 0.13
526 0.16
527 0.16
528 0.15
529 0.15
530 0.15
531 0.16
532 0.2
533 0.2
534 0.15
535 0.19
536 0.18
537 0.18
538 0.23
539 0.25
540 0.23
541 0.24
542 0.23
543 0.2
544 0.22
545 0.23
546 0.18
547 0.17
548 0.17
549 0.19
550 0.2
551 0.21
552 0.23
553 0.22
554 0.23
555 0.25
556 0.24
557 0.21
558 0.19
559 0.19
560 0.2
561 0.19
562 0.16
563 0.14
564 0.14
565 0.15
566 0.15
567 0.15
568 0.09
569 0.1
570 0.16
571 0.18
572 0.2
573 0.27
574 0.3
575 0.32
576 0.41
577 0.48
578 0.52
579 0.55
580 0.59
581 0.57
582 0.54
583 0.55
584 0.46
585 0.46