Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CQL0

Protein Details
Accession B0CQL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
279-307YVRQAEEKVKRTRKKRTKNTEQPPRHVEYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-296KVKRTRKKRTK
Subcellular Location(s) cysk 11, nucl 10, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR015010  Rap1_Myb_dom  
IPR039595  TE2IP/Rap1  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0010833  P:telomere maintenance via telomere lengthening  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_300808  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08914  Myb_DNA-bind_2  
CDD cd11655  rap1_myb-like  
Amino Acid Sequences MAIKFFIQKDLPQEVQADLCEIVTSLGGRVESKVPRQGYILVQPGTNEEERLRLCWTSADRPDRHFVPYTYVDACKIAGMLLKQIFVENGMPIRMHIHPSIANVNARSALSSRIMHSGGDPHASAQSARVILADPNTDVFHHLVKIYQSDPDKYIESYLWVKKCIEKGTVVYTPLVYKNPGGRRPGEERTQFTDEDEEHLCNWIAAKIPYKETGGRTGNRLYQQLCEQTNDPEFAWVTRHTWQSWRERYKKNSSRLDTTIAGIVERKRPAQGEKGQYGYVRQAEEKVKRTRKKRTKNTEQPPRHVEYTAVDSLVGLPGLAMPNGEVPGPSGMHIHQSFQEQSSNMETTGIGYSVILPIPASTPLDRSSVRKSPAEEEMDDMDDSEWAVRVGDAPLPTWGKRKASEEMESPFNKRARPNDEAPASLPPGTLDAIVNMHVIDQSIRDIARDFRFTVEEVQEYYDKCGEMGRTRLLFQRMREELVAKFCEDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.28
4 0.23
5 0.16
6 0.14
7 0.12
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.12
17 0.19
18 0.23
19 0.28
20 0.35
21 0.35
22 0.36
23 0.38
24 0.39
25 0.38
26 0.4
27 0.42
28 0.35
29 0.34
30 0.33
31 0.33
32 0.34
33 0.29
34 0.24
35 0.17
36 0.22
37 0.23
38 0.24
39 0.25
40 0.21
41 0.2
42 0.24
43 0.29
44 0.32
45 0.4
46 0.47
47 0.48
48 0.52
49 0.58
50 0.54
51 0.53
52 0.49
53 0.41
54 0.39
55 0.39
56 0.38
57 0.34
58 0.33
59 0.3
60 0.26
61 0.25
62 0.18
63 0.15
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.17
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.15
81 0.15
82 0.17
83 0.16
84 0.18
85 0.18
86 0.21
87 0.25
88 0.24
89 0.26
90 0.23
91 0.23
92 0.22
93 0.2
94 0.19
95 0.16
96 0.15
97 0.16
98 0.17
99 0.18
100 0.2
101 0.2
102 0.19
103 0.19
104 0.21
105 0.19
106 0.19
107 0.17
108 0.15
109 0.15
110 0.16
111 0.15
112 0.11
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.13
120 0.13
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.14
133 0.13
134 0.17
135 0.19
136 0.2
137 0.21
138 0.22
139 0.22
140 0.2
141 0.21
142 0.16
143 0.17
144 0.21
145 0.25
146 0.25
147 0.25
148 0.26
149 0.28
150 0.33
151 0.33
152 0.29
153 0.25
154 0.26
155 0.3
156 0.31
157 0.28
158 0.24
159 0.22
160 0.21
161 0.21
162 0.2
163 0.15
164 0.14
165 0.2
166 0.27
167 0.31
168 0.33
169 0.33
170 0.37
171 0.43
172 0.46
173 0.47
174 0.44
175 0.43
176 0.46
177 0.47
178 0.42
179 0.36
180 0.33
181 0.26
182 0.24
183 0.22
184 0.16
185 0.13
186 0.14
187 0.13
188 0.1
189 0.1
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.14
194 0.15
195 0.16
196 0.18
197 0.2
198 0.22
199 0.21
200 0.28
201 0.28
202 0.27
203 0.29
204 0.3
205 0.32
206 0.31
207 0.32
208 0.25
209 0.23
210 0.24
211 0.26
212 0.24
213 0.22
214 0.21
215 0.21
216 0.21
217 0.21
218 0.18
219 0.14
220 0.13
221 0.11
222 0.12
223 0.1
224 0.11
225 0.14
226 0.16
227 0.16
228 0.2
229 0.26
230 0.33
231 0.42
232 0.49
233 0.54
234 0.59
235 0.66
236 0.72
237 0.75
238 0.75
239 0.75
240 0.69
241 0.66
242 0.61
243 0.58
244 0.48
245 0.4
246 0.33
247 0.23
248 0.2
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.16
254 0.16
255 0.18
256 0.2
257 0.26
258 0.32
259 0.34
260 0.35
261 0.36
262 0.36
263 0.35
264 0.33
265 0.28
266 0.23
267 0.17
268 0.15
269 0.18
270 0.23
271 0.29
272 0.35
273 0.42
274 0.49
275 0.56
276 0.63
277 0.7
278 0.75
279 0.8
280 0.84
281 0.85
282 0.87
283 0.91
284 0.93
285 0.93
286 0.9
287 0.86
288 0.8
289 0.74
290 0.64
291 0.54
292 0.44
293 0.35
294 0.33
295 0.27
296 0.21
297 0.15
298 0.14
299 0.13
300 0.13
301 0.1
302 0.04
303 0.03
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.16
323 0.19
324 0.2
325 0.2
326 0.22
327 0.16
328 0.18
329 0.21
330 0.2
331 0.16
332 0.15
333 0.14
334 0.13
335 0.13
336 0.11
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.11
350 0.13
351 0.17
352 0.18
353 0.21
354 0.27
355 0.32
356 0.35
357 0.36
358 0.37
359 0.38
360 0.44
361 0.44
362 0.37
363 0.33
364 0.32
365 0.3
366 0.27
367 0.24
368 0.17
369 0.12
370 0.12
371 0.09
372 0.07
373 0.05
374 0.06
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.15
382 0.18
383 0.2
384 0.25
385 0.29
386 0.3
387 0.34
388 0.38
389 0.4
390 0.43
391 0.46
392 0.46
393 0.45
394 0.48
395 0.46
396 0.45
397 0.44
398 0.41
399 0.41
400 0.41
401 0.46
402 0.46
403 0.5
404 0.52
405 0.55
406 0.55
407 0.53
408 0.49
409 0.45
410 0.4
411 0.34
412 0.28
413 0.19
414 0.18
415 0.16
416 0.15
417 0.11
418 0.1
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.13
433 0.19
434 0.24
435 0.27
436 0.26
437 0.27
438 0.29
439 0.29
440 0.34
441 0.31
442 0.27
443 0.25
444 0.28
445 0.28
446 0.27
447 0.29
448 0.26
449 0.22
450 0.2
451 0.23
452 0.24
453 0.26
454 0.31
455 0.34
456 0.34
457 0.36
458 0.43
459 0.47
460 0.47
461 0.45
462 0.5
463 0.46
464 0.48
465 0.48
466 0.44
467 0.4
468 0.43
469 0.41