FuNGI

Q5A213

Protein Details

Accession

Q5A213

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-38	GDPFLSDPSKKRKRSNKLTSKTKRSKSSTPTPTPTP	Hydrophilic
191-212	INETHKKPKRIKHTKGGNKYFE	Basic
347-370	GDSLEKTNKKKKRHYHQEEEEAET	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-28	KKRKRSNKLTSKTKRSK
196-205	KKPKRIKHTK
356-357	KK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0030515 F:snoRNA binding GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	cal:CAALFM_CR02710WA -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MAGDPFLSDPSKKRKRSNKLTSKTKRSKSSTPTPTPTPTPNTNHQDDDISSGSDSENGHANGTNENDHGDNESELSSDEEFADETVNDKRRRLAKQYLENLKQNEHELYDEFDAKDLDDDILARRLQKDIAETKGYVYKFVGDKIKDQLDEEYPLELITTRIGCKNLTSMTINYPFLYTVSKDMEIIKWDINETHKKPKRIKHTKGGNKYFEINTINPQLNHHWQQINCIAASPDGKYIVTGGSDSRLIIWSSENLTCLKVLPTRSSVNSIVFRRNSDQLFAACADLRIRTYSINQFTQLEILYGHQDNISDISALAKETCVSVGSRDKTAMFWKIAEESRLTFRGGDSLEKTNKKKKRHYHQEEEEAETENDESTFYNEGSIDVVSMIDESHFVTGSDNGNVALWSLAKKKPLTTKRLSHGLQPQFTPIQASSESNEELALQQIPKPQPYWITAIHGVPYSDIFITGSFNGTIKIWKLEEPSLRSFKLLGEIKQNNLNGCIVKIDSVEIPNTKKLKIYVLLSKEHKFGRWLGKLPGARNALVNFTVNL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.78
3	0.86
4	0.9
5	0.9
6	0.9
7	0.94
8	0.94
9	0.95
10	0.94
11	0.92
12	0.91
13	0.87
14	0.87
15	0.84
16	0.84
17	0.84
18	0.83
19	0.8
20	0.76
21	0.74
22	0.7
23	0.67
24	0.63
25	0.6
26	0.58
27	0.61
28	0.62
29	0.61
30	0.58
31	0.53
32	0.5
33	0.42
34	0.41
35	0.33
36	0.26
37	0.22
38	0.19
39	0.18
40	0.17
41	0.17
42	0.13
43	0.17
44	0.16
45	0.18
46	0.19
47	0.2
48	0.2
49	0.22
50	0.22
51	0.17
52	0.18
53	0.18
54	0.16
55	0.18
56	0.16
57	0.14
58	0.13
59	0.13
60	0.12
61	0.12
62	0.13
63	0.11
64	0.1
65	0.1
66	0.09
67	0.09
68	0.09
69	0.1
70	0.07
71	0.09
72	0.15
73	0.23
74	0.25
75	0.26
76	0.33
77	0.4
78	0.47
79	0.53
80	0.56
81	0.58
82	0.66
83	0.75
84	0.78
85	0.77
86	0.76
87	0.71
88	0.64
89	0.56
90	0.49
91	0.4
92	0.31
93	0.26
94	0.21
95	0.22
96	0.22
97	0.22
98	0.19
99	0.18
100	0.17
101	0.15
102	0.15
103	0.12
104	0.1
105	0.07
106	0.08
107	0.09
108	0.13
109	0.13
110	0.14
111	0.14
112	0.16
113	0.17
114	0.17
115	0.22
116	0.23
117	0.27
118	0.29
119	0.28
120	0.29
121	0.33
122	0.31
123	0.26
124	0.22
125	0.22
126	0.2
127	0.24
128	0.29
129	0.25
130	0.28
131	0.32
132	0.35
133	0.31
134	0.31
135	0.3
136	0.26
137	0.28
138	0.25
139	0.2
140	0.16
141	0.16
142	0.15
143	0.11
144	0.09
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.12
149	0.13
150	0.13
151	0.14
152	0.17
153	0.16
154	0.17
155	0.18
156	0.18
157	0.22
158	0.26
159	0.26
160	0.23
161	0.22
162	0.19
163	0.17
164	0.17
165	0.13
166	0.12
167	0.14
168	0.14
169	0.14
170	0.15
171	0.16
172	0.17
173	0.18
174	0.16
175	0.13
176	0.14
177	0.15
178	0.19
179	0.27
180	0.28
181	0.38
182	0.42
183	0.5
184	0.57
185	0.63
186	0.69
187	0.71
188	0.75
189	0.74
190	0.8
191	0.82
192	0.85
193	0.86
194	0.79
195	0.7
196	0.66
197	0.56
198	0.49
199	0.42
200	0.32
201	0.27
202	0.27
203	0.27
204	0.23
205	0.25
206	0.25
207	0.27
208	0.3
209	0.3
210	0.3
211	0.29
212	0.33
213	0.34
214	0.31
215	0.24
216	0.21
217	0.17
218	0.14
219	0.15
220	0.11
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.08
238	0.08
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.1
243	0.11
244	0.1
245	0.1
246	0.11
247	0.11
248	0.12
249	0.13
250	0.16
251	0.18
252	0.19
253	0.23
254	0.22
255	0.23
256	0.27
257	0.27
258	0.29
259	0.27
260	0.28
261	0.27
262	0.29
263	0.26
264	0.22
265	0.21
266	0.16
267	0.17
268	0.15
269	0.13
270	0.1
271	0.1
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.11
279	0.17
280	0.2
281	0.21
282	0.21
283	0.21
284	0.21
285	0.21
286	0.18
287	0.12
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.08
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.08
311	0.14
312	0.16
313	0.17
314	0.17
315	0.18
316	0.18
317	0.22
318	0.22
319	0.17
320	0.16
321	0.16
322	0.19
323	0.19
324	0.19
325	0.17
326	0.15
327	0.18
328	0.19
329	0.18
330	0.15
331	0.14
332	0.16
333	0.16
334	0.17
335	0.16
336	0.21
337	0.28
338	0.34
339	0.39
340	0.45
341	0.51
342	0.58
343	0.64
344	0.68
345	0.73
346	0.79
347	0.84
348	0.85
349	0.87
350	0.88
351	0.81
352	0.75
353	0.65
354	0.56
355	0.46
356	0.35
357	0.27
358	0.17
359	0.13
360	0.09
361	0.08
362	0.07
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.07
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.09
384	0.1
385	0.11
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.09
391	0.07
392	0.06
393	0.08
394	0.13
395	0.15
396	0.2
397	0.21
398	0.26
399	0.36
400	0.44
401	0.5
402	0.54
403	0.6
404	0.62
405	0.7
406	0.66
407	0.63
408	0.64
409	0.63
410	0.57
411	0.5
412	0.48
413	0.39
414	0.38
415	0.34
416	0.24
417	0.2
418	0.18
419	0.19
420	0.16
421	0.19
422	0.19
423	0.16
424	0.16
425	0.13
426	0.12
427	0.12
428	0.13
429	0.1
430	0.12
431	0.19
432	0.22
433	0.23
434	0.24
435	0.25
436	0.26
437	0.29
438	0.31
439	0.26
440	0.3
441	0.3
442	0.3
443	0.3
444	0.27
445	0.24
446	0.2
447	0.19
448	0.14
449	0.11
450	0.11
451	0.09
452	0.08
453	0.1
454	0.1
455	0.11
456	0.1
457	0.1
458	0.11
459	0.11
460	0.14
461	0.13
462	0.17
463	0.17
464	0.19
465	0.23
466	0.29
467	0.35
468	0.39
469	0.45
470	0.46
471	0.46
472	0.44
473	0.4
474	0.34
475	0.37
476	0.36
477	0.31
478	0.36
479	0.39
480	0.41
481	0.47
482	0.48
483	0.4
484	0.37
485	0.37
486	0.27
487	0.24
488	0.23
489	0.17
490	0.16
491	0.15
492	0.15
493	0.15
494	0.16
495	0.2
496	0.22
497	0.25
498	0.32
499	0.34
500	0.33
501	0.34
502	0.34
503	0.37
504	0.38
505	0.4
506	0.42
507	0.45
508	0.52
509	0.54
510	0.56
511	0.54
512	0.51
513	0.47
514	0.41
515	0.44
516	0.46
517	0.48
518	0.49
519	0.49
520	0.55
521	0.58
522	0.57
523	0.58
524	0.52
525	0.45
526	0.44
527	0.4
528	0.36
529	0.33

Q5A213

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer