Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DPC6

Protein Details
Accession B0DPC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
635-655LSPTIPPKKRHAFKPKLSLPLHydrophilic
735-779EKGGRKGEKGKSREKGRGRRQKMKERIGEKKRRPARRPQTSTVVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
736-771KGGRKGEKGKSREKGRGRRQKMKERIGEKKRRPARR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9, plas 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
IPR045913  TBC20/Gyp8-like  
Gene Ontology GO:0005096  F:GTPase activator activity  
GO:0043547  P:positive regulation of GTPase activity  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_307084  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MSVIPNGNDLPSAGVMKHQTLNWDALRERSLQPGGFGEDRVRLWPQLLNVTPSSKHKTEADEADTPHPDERQIELDTDRSFVLYPVGETHDKDALQSSLHALLVALFRKRPKLSYFQGYHDIVTVLYLTLPPDLQLPCVEKLSLHRVRDSMGAGLEPVLGLLRVTQNLLQLADPTYAQTLSQTSPLPFFALSNLLTLFAHDVPTLALIQHIFDYLLCRPPVWVVYLVVAIILARKEEVMRLEEEGEEGMIHSLLSSLPALIDGDDNDEDEELENQDERRNDDFVLPTRRPSREEGDARLSEKTKEEWSPDGKTNGISTPKNRYELRRFGGSDDGVQDGETEASNDEIKEEEITEDQSDTAGRPLASSSPSTSPALSPSKTETLLSTPTLSPSRTPALSFSTSPTLSSSSPPPSTPGLTLDLLDEDPSASDGKADDGQPSCTEEAAAFDAKTVQLTKPASESGEAPPLFSGNGETKRSASESGEASLSTSGITQATIYTTGTAQPTSFSSKPGEATVPTSGTEEAMISISGIGTVSESEETTISVLSGQAMAYVSGVGQTTHITSGIEETHNTENDAENTAYSRRKQLETEIPTRPIYHPSESENSSFSPFSSNLKPSASSSKLDAAISSGLHVELSPTIPPKKRHAFKPKLSLPLLLSQADALAARFPPSDAGLRLSSIMGPQSVVYTFSVSPSALPSDDEAEAMVRNPGLVVYPQMPFGAKEEEESAESEGDWEKGGRKGEKGKSREKGRGRRQKMKERIGEKKRRPARRPQTSTVVAGAVVVLGVGMAVYGMRRGGGGGAVEEGWRGAAEWLVGRLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.21
4 0.24
5 0.23
6 0.25
7 0.26
8 0.33
9 0.31
10 0.33
11 0.31
12 0.31
13 0.33
14 0.33
15 0.32
16 0.33
17 0.35
18 0.3
19 0.31
20 0.3
21 0.33
22 0.3
23 0.29
24 0.25
25 0.25
26 0.25
27 0.27
28 0.27
29 0.22
30 0.23
31 0.24
32 0.25
33 0.29
34 0.3
35 0.31
36 0.31
37 0.34
38 0.35
39 0.39
40 0.44
41 0.37
42 0.38
43 0.37
44 0.41
45 0.45
46 0.49
47 0.48
48 0.45
49 0.47
50 0.49
51 0.48
52 0.43
53 0.38
54 0.32
55 0.27
56 0.24
57 0.24
58 0.23
59 0.22
60 0.23
61 0.23
62 0.26
63 0.25
64 0.24
65 0.21
66 0.18
67 0.17
68 0.14
69 0.15
70 0.11
71 0.11
72 0.13
73 0.18
74 0.19
75 0.2
76 0.23
77 0.24
78 0.23
79 0.23
80 0.23
81 0.19
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.15
86 0.15
87 0.14
88 0.11
89 0.13
90 0.16
91 0.18
92 0.18
93 0.19
94 0.23
95 0.3
96 0.32
97 0.35
98 0.37
99 0.42
100 0.47
101 0.54
102 0.55
103 0.53
104 0.59
105 0.55
106 0.5
107 0.42
108 0.35
109 0.24
110 0.2
111 0.15
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.15
123 0.18
124 0.19
125 0.21
126 0.2
127 0.17
128 0.22
129 0.31
130 0.35
131 0.33
132 0.34
133 0.33
134 0.35
135 0.37
136 0.33
137 0.25
138 0.18
139 0.16
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.08
144 0.07
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.12
154 0.14
155 0.15
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.14
175 0.14
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.09
201 0.1
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.16
207 0.17
208 0.17
209 0.16
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.1
215 0.09
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.12
232 0.1
233 0.07
234 0.07
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.11
263 0.12
264 0.15
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.19
269 0.22
270 0.25
271 0.32
272 0.29
273 0.32
274 0.37
275 0.38
276 0.38
277 0.39
278 0.38
279 0.39
280 0.43
281 0.42
282 0.43
283 0.43
284 0.42
285 0.4
286 0.36
287 0.28
288 0.26
289 0.24
290 0.2
291 0.21
292 0.22
293 0.24
294 0.28
295 0.3
296 0.32
297 0.31
298 0.28
299 0.27
300 0.25
301 0.24
302 0.25
303 0.23
304 0.23
305 0.3
306 0.33
307 0.37
308 0.39
309 0.42
310 0.45
311 0.51
312 0.52
313 0.48
314 0.46
315 0.42
316 0.44
317 0.37
318 0.3
319 0.23
320 0.2
321 0.14
322 0.13
323 0.12
324 0.08
325 0.08
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.14
360 0.17
361 0.2
362 0.18
363 0.17
364 0.18
365 0.19
366 0.19
367 0.19
368 0.16
369 0.14
370 0.16
371 0.15
372 0.14
373 0.12
374 0.14
375 0.15
376 0.15
377 0.13
378 0.14
379 0.16
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.17
384 0.18
385 0.18
386 0.17
387 0.18
388 0.18
389 0.18
390 0.17
391 0.15
392 0.13
393 0.14
394 0.16
395 0.16
396 0.17
397 0.17
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.17
402 0.16
403 0.15
404 0.14
405 0.14
406 0.12
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.08
411 0.05
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.05
417 0.04
418 0.06
419 0.08
420 0.08
421 0.1
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.14
426 0.13
427 0.11
428 0.11
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.11
441 0.12
442 0.13
443 0.13
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.15
448 0.12
449 0.19
450 0.18
451 0.17
452 0.16
453 0.15
454 0.15
455 0.13
456 0.13
457 0.1
458 0.15
459 0.16
460 0.17
461 0.17
462 0.19
463 0.2
464 0.19
465 0.15
466 0.14
467 0.14
468 0.14
469 0.14
470 0.13
471 0.12
472 0.11
473 0.09
474 0.07
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.04
480 0.04
481 0.05
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.1
492 0.16
493 0.16
494 0.16
495 0.18
496 0.18
497 0.2
498 0.2
499 0.2
500 0.14
501 0.16
502 0.16
503 0.15
504 0.14
505 0.14
506 0.13
507 0.12
508 0.11
509 0.08
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.05
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.04
522 0.04
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.04
533 0.05
534 0.04
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.04
541 0.05
542 0.05
543 0.04
544 0.05
545 0.05
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.06
550 0.06
551 0.08
552 0.1
553 0.1
554 0.09
555 0.13
556 0.16
557 0.16
558 0.17
559 0.16
560 0.15
561 0.15
562 0.18
563 0.14
564 0.11
565 0.13
566 0.16
567 0.19
568 0.19
569 0.24
570 0.25
571 0.28
572 0.29
573 0.35
574 0.41
575 0.44
576 0.49
577 0.48
578 0.47
579 0.46
580 0.47
581 0.41
582 0.37
583 0.34
584 0.31
585 0.28
586 0.3
587 0.34
588 0.34
589 0.34
590 0.29
591 0.26
592 0.25
593 0.23
594 0.19
595 0.17
596 0.16
597 0.19
598 0.23
599 0.24
600 0.24
601 0.25
602 0.26
603 0.25
604 0.33
605 0.31
606 0.27
607 0.27
608 0.29
609 0.3
610 0.29
611 0.26
612 0.19
613 0.18
614 0.16
615 0.14
616 0.1
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.07
621 0.06
622 0.08
623 0.09
624 0.13
625 0.2
626 0.26
627 0.3
628 0.38
629 0.48
630 0.54
631 0.63
632 0.7
633 0.74
634 0.77
635 0.84
636 0.82
637 0.79
638 0.74
639 0.66
640 0.58
641 0.53
642 0.47
643 0.37
644 0.3
645 0.21
646 0.2
647 0.17
648 0.14
649 0.08
650 0.07
651 0.07
652 0.09
653 0.09
654 0.09
655 0.1
656 0.12
657 0.15
658 0.14
659 0.17
660 0.17
661 0.17
662 0.18
663 0.17
664 0.15
665 0.13
666 0.13
667 0.1
668 0.09
669 0.09
670 0.1
671 0.1
672 0.11
673 0.1
674 0.12
675 0.12
676 0.13
677 0.14
678 0.12
679 0.13
680 0.13
681 0.14
682 0.12
683 0.12
684 0.13
685 0.15
686 0.15
687 0.14
688 0.13
689 0.11
690 0.11
691 0.11
692 0.11
693 0.07
694 0.07
695 0.07
696 0.07
697 0.07
698 0.08
699 0.1
700 0.12
701 0.13
702 0.14
703 0.14
704 0.15
705 0.14
706 0.16
707 0.19
708 0.16
709 0.17
710 0.19
711 0.2
712 0.21
713 0.21
714 0.2
715 0.15
716 0.14
717 0.14
718 0.13
719 0.12
720 0.11
721 0.11
722 0.13
723 0.17
724 0.23
725 0.25
726 0.3
727 0.4
728 0.48
729 0.57
730 0.61
731 0.67
732 0.71
733 0.76
734 0.8
735 0.81
736 0.82
737 0.84
738 0.88
739 0.88
740 0.89
741 0.9
742 0.91
743 0.92
744 0.91
745 0.89
746 0.87
747 0.88
748 0.89
749 0.9
750 0.88
751 0.88
752 0.87
753 0.89
754 0.86
755 0.87
756 0.87
757 0.87
758 0.86
759 0.83
760 0.83
761 0.76
762 0.72
763 0.63
764 0.52
765 0.4
766 0.31
767 0.24
768 0.14
769 0.09
770 0.06
771 0.03
772 0.02
773 0.02
774 0.02
775 0.02
776 0.02
777 0.02
778 0.03
779 0.04
780 0.04
781 0.05
782 0.05
783 0.06
784 0.06
785 0.08
786 0.09
787 0.09
788 0.1
789 0.11
790 0.11
791 0.1
792 0.1
793 0.08
794 0.07
795 0.07
796 0.06
797 0.07
798 0.08
799 0.1