Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DPY1

Protein Details
Accession B0DPY1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-306GGEKKVTGAKRKKGKKWRGLDEDETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-299KKVTGAKRKKGKKWR
Subcellular Location(s) cyto 20, cyto_nucl 13.333, nucl 4.5, mito_nucl 4.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_307359  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
Amino Acid Sequences MTGDLVTKNFTSPYLVFGDELYPDLHSRRGRLVAKSQAARMSTKDIEGTEPADVFSLEKTFTTPAHISSLAFGHPGQLYAGSDDGSLRVYDLSTFKVLKAVRGLGNEVSSIICIKRPGSELRDAWVAHGKRISLFRLDSPKLIQSPEDALSTINIGNPEAASEIDTLNESHLAFSMDSGAVGVVNLATEEVVKMKTGHESVCGSVKCVPGRPQELVSGGYDRKLQHYDYTQGDVLSSCLMESYAQNAGSAALAPPFVMSLAVSLSGVLAAGTADGRLWLGFGGEKKVTGAKRKKGKKWRGLDEDETLLIKIAEGPIVAMAFSEGRALTISTLMGVLTHYYLEYDPTVGQVVLKQLWQKESEGIQKVNTLIADEKRFIVGGFTKKGQGIIEVWRKLSPPQLEEGTSKVVSKEVVEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.2
4 0.2
5 0.21
6 0.16
7 0.17
8 0.14
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.2
13 0.21
14 0.23
15 0.28
16 0.36
17 0.4
18 0.44
19 0.51
20 0.55
21 0.61
22 0.61
23 0.6
24 0.56
25 0.53
26 0.49
27 0.43
28 0.4
29 0.33
30 0.31
31 0.29
32 0.25
33 0.26
34 0.26
35 0.24
36 0.19
37 0.17
38 0.16
39 0.14
40 0.13
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.12
48 0.12
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.22
53 0.22
54 0.21
55 0.21
56 0.22
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.09
78 0.1
79 0.12
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.2
84 0.2
85 0.21
86 0.23
87 0.25
88 0.24
89 0.25
90 0.28
91 0.23
92 0.24
93 0.21
94 0.18
95 0.14
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.12
103 0.16
104 0.21
105 0.24
106 0.31
107 0.3
108 0.32
109 0.36
110 0.33
111 0.31
112 0.34
113 0.3
114 0.25
115 0.26
116 0.23
117 0.22
118 0.25
119 0.25
120 0.2
121 0.21
122 0.24
123 0.31
124 0.32
125 0.3
126 0.3
127 0.31
128 0.29
129 0.28
130 0.23
131 0.17
132 0.19
133 0.19
134 0.17
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.11
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.02
171 0.02
172 0.02
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.17
189 0.16
190 0.15
191 0.18
192 0.2
193 0.19
194 0.21
195 0.25
196 0.24
197 0.27
198 0.27
199 0.25
200 0.24
201 0.24
202 0.23
203 0.19
204 0.17
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.14
209 0.16
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.19
214 0.23
215 0.21
216 0.24
217 0.22
218 0.2
219 0.19
220 0.16
221 0.14
222 0.1
223 0.08
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.07
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.06
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.02
257 0.02
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.06
268 0.07
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.17
274 0.2
275 0.29
276 0.37
277 0.42
278 0.52
279 0.61
280 0.71
281 0.77
282 0.84
283 0.84
284 0.85
285 0.87
286 0.86
287 0.83
288 0.78
289 0.7
290 0.61
291 0.52
292 0.42
293 0.32
294 0.23
295 0.16
296 0.11
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.05
324 0.06
325 0.05
326 0.07
327 0.07
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.13
338 0.13
339 0.16
340 0.18
341 0.2
342 0.24
343 0.25
344 0.25
345 0.26
346 0.31
347 0.37
348 0.38
349 0.37
350 0.35
351 0.35
352 0.34
353 0.32
354 0.26
355 0.2
356 0.19
357 0.23
358 0.26
359 0.25
360 0.26
361 0.24
362 0.24
363 0.22
364 0.22
365 0.23
366 0.26
367 0.29
368 0.3
369 0.33
370 0.33
371 0.35
372 0.31
373 0.27
374 0.23
375 0.29
376 0.36
377 0.36
378 0.37
379 0.37
380 0.37
381 0.37
382 0.42
383 0.38
384 0.32
385 0.35
386 0.38
387 0.39
388 0.39
389 0.4
390 0.38
391 0.33
392 0.31
393 0.25
394 0.23
395 0.21