Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DGA2

Protein Details
Accession B0DGA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-96QRSSSFYRDRDRGRRRSPSPPPSHRARERERERERGRRDSVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-93RDRGRRRSPSPPPSHRARERERERERGRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_300203  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSLHQKFRRCKYFKSDGTPIDIGCPRRASLCKFAHPSDPDWDRLKVPDSAGWKEEQRSSSFYRDRDRGRRRSPSPPPSHRARERERERERGRRDSVASTSHSDTRSLSHDRRGTTTTMNVDRHLFLESEQDIKPIISKSGSVMDSHSAIQRPVLRPIVTTAPANPEHPSSSSTTAVHSATYVPNTPSSSNIPTAMPPPDDAPVPPPPPLPVLPELTTMVESPEPLDAESQAKVDVWETRIKRLVDSALAQESVLQADENLSQALSITQSTYFPSLAPDVQLRAQAEITDLQSRRDDLQKAVDASIEKLVGSDCWPPLDRHDDKDKDKEERDKAGYDEVKKYVEELKSITAEMSRVLGDMSGLGLKPPPMTVLHDAERDQREFGFGFGGVPMDVDDAPPPPIRVGVPNHEELEYVLDRVVDLEETLSNIRNDLDARYDEFEERMEEFRGAVEEAVEGVGGGEEEEEKDEPAAQENPNAEDGEVDGNDTRTTTKRIRADLDKLIEDNDIAGKDIGELSGYITEQIQQESALTVQLAQAKVDGERSLERFEVFQRQFTTYTQAREKDTQTLRVLEAAMKAYTNSTTVPPSPPLSPTPTSLSLPSSSSSLFSTSSPSLTSEYLVQALQDPLTDVLRATVKPLIQEFRDSVEVLLKDQNAEMYGTIWERMKGALILLRTISDKLEVTGQQQGVAIVGQGLGQGLGQGQGQGMVGVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.77
3 0.7
4 0.72
5 0.66
6 0.56
7 0.53
8 0.49
9 0.43
10 0.39
11 0.38
12 0.31
13 0.35
14 0.4
15 0.4
16 0.45
17 0.49
18 0.53
19 0.57
20 0.59
21 0.62
22 0.6
23 0.57
24 0.56
25 0.52
26 0.49
27 0.47
28 0.46
29 0.4
30 0.39
31 0.39
32 0.33
33 0.32
34 0.31
35 0.32
36 0.34
37 0.34
38 0.34
39 0.35
40 0.36
41 0.4
42 0.38
43 0.36
44 0.37
45 0.4
46 0.47
47 0.49
48 0.5
49 0.52
50 0.57
51 0.63
52 0.69
53 0.74
54 0.75
55 0.79
56 0.84
57 0.81
58 0.84
59 0.85
60 0.85
61 0.86
62 0.85
63 0.82
64 0.81
65 0.85
66 0.84
67 0.82
68 0.81
69 0.81
70 0.81
71 0.86
72 0.84
73 0.84
74 0.84
75 0.85
76 0.83
77 0.82
78 0.77
79 0.73
80 0.68
81 0.63
82 0.58
83 0.53
84 0.49
85 0.43
86 0.42
87 0.4
88 0.37
89 0.33
90 0.29
91 0.27
92 0.29
93 0.33
94 0.33
95 0.37
96 0.4
97 0.42
98 0.45
99 0.45
100 0.42
101 0.38
102 0.39
103 0.38
104 0.41
105 0.4
106 0.38
107 0.37
108 0.35
109 0.32
110 0.28
111 0.21
112 0.14
113 0.19
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.17
120 0.2
121 0.15
122 0.15
123 0.12
124 0.13
125 0.14
126 0.2
127 0.21
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.19
132 0.2
133 0.22
134 0.17
135 0.16
136 0.2
137 0.25
138 0.25
139 0.29
140 0.32
141 0.29
142 0.29
143 0.32
144 0.33
145 0.28
146 0.27
147 0.23
148 0.24
149 0.26
150 0.26
151 0.24
152 0.21
153 0.21
154 0.21
155 0.22
156 0.2
157 0.22
158 0.23
159 0.22
160 0.22
161 0.22
162 0.21
163 0.19
164 0.16
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.16
169 0.15
170 0.17
171 0.19
172 0.19
173 0.19
174 0.22
175 0.23
176 0.22
177 0.23
178 0.21
179 0.2
180 0.23
181 0.23
182 0.19
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.15
188 0.17
189 0.2
190 0.21
191 0.22
192 0.21
193 0.21
194 0.23
195 0.24
196 0.24
197 0.2
198 0.22
199 0.22
200 0.24
201 0.23
202 0.21
203 0.21
204 0.16
205 0.15
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.18
224 0.19
225 0.23
226 0.29
227 0.29
228 0.28
229 0.28
230 0.27
231 0.22
232 0.23
233 0.21
234 0.17
235 0.16
236 0.16
237 0.14
238 0.12
239 0.1
240 0.08
241 0.06
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.16
276 0.15
277 0.16
278 0.17
279 0.18
280 0.19
281 0.22
282 0.22
283 0.18
284 0.22
285 0.24
286 0.24
287 0.23
288 0.22
289 0.18
290 0.17
291 0.17
292 0.12
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.08
298 0.1
299 0.08
300 0.1
301 0.12
302 0.12
303 0.15
304 0.23
305 0.23
306 0.25
307 0.34
308 0.38
309 0.4
310 0.47
311 0.48
312 0.45
313 0.48
314 0.52
315 0.47
316 0.47
317 0.46
318 0.39
319 0.37
320 0.37
321 0.37
322 0.32
323 0.31
324 0.26
325 0.25
326 0.23
327 0.24
328 0.22
329 0.19
330 0.17
331 0.15
332 0.16
333 0.15
334 0.16
335 0.14
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.09
357 0.13
358 0.16
359 0.17
360 0.19
361 0.19
362 0.24
363 0.26
364 0.23
365 0.2
366 0.17
367 0.17
368 0.15
369 0.15
370 0.1
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.07
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.08
388 0.09
389 0.12
390 0.15
391 0.19
392 0.22
393 0.23
394 0.24
395 0.23
396 0.23
397 0.19
398 0.2
399 0.15
400 0.12
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.06
411 0.06
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.11
420 0.1
421 0.12
422 0.14
423 0.15
424 0.15
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.14
429 0.13
430 0.12
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.1
436 0.08
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.02
447 0.02
448 0.03
449 0.03
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.1
457 0.13
458 0.12
459 0.15
460 0.16
461 0.17
462 0.18
463 0.17
464 0.14
465 0.11
466 0.12
467 0.1
468 0.09
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.1
476 0.16
477 0.19
478 0.26
479 0.3
480 0.34
481 0.4
482 0.44
483 0.48
484 0.49
485 0.49
486 0.43
487 0.38
488 0.35
489 0.29
490 0.23
491 0.18
492 0.13
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.08
499 0.07
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.09
508 0.1
509 0.1
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.08
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.12
523 0.12
524 0.13
525 0.14
526 0.12
527 0.11
528 0.14
529 0.16
530 0.18
531 0.18
532 0.18
533 0.17
534 0.2
535 0.28
536 0.25
537 0.28
538 0.28
539 0.3
540 0.32
541 0.31
542 0.36
543 0.29
544 0.34
545 0.36
546 0.37
547 0.39
548 0.42
549 0.44
550 0.46
551 0.46
552 0.47
553 0.43
554 0.43
555 0.38
556 0.35
557 0.33
558 0.26
559 0.24
560 0.19
561 0.16
562 0.14
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.12
567 0.11
568 0.11
569 0.15
570 0.17
571 0.2
572 0.22
573 0.24
574 0.24
575 0.26
576 0.27
577 0.3
578 0.3
579 0.3
580 0.33
581 0.34
582 0.34
583 0.32
584 0.32
585 0.27
586 0.26
587 0.24
588 0.2
589 0.17
590 0.16
591 0.16
592 0.14
593 0.14
594 0.13
595 0.17
596 0.17
597 0.17
598 0.17
599 0.17
600 0.18
601 0.18
602 0.18
603 0.15
604 0.15
605 0.16
606 0.15
607 0.13
608 0.13
609 0.14
610 0.13
611 0.11
612 0.11
613 0.11
614 0.12
615 0.12
616 0.09
617 0.11
618 0.14
619 0.14
620 0.16
621 0.18
622 0.18
623 0.21
624 0.26
625 0.28
626 0.26
627 0.31
628 0.29
629 0.3
630 0.31
631 0.29
632 0.25
633 0.26
634 0.25
635 0.23
636 0.26
637 0.22
638 0.21
639 0.2
640 0.21
641 0.16
642 0.16
643 0.14
644 0.1
645 0.12
646 0.12
647 0.14
648 0.14
649 0.14
650 0.14
651 0.14
652 0.15
653 0.13
654 0.14
655 0.15
656 0.15
657 0.16
658 0.16
659 0.17
660 0.17
661 0.17
662 0.16
663 0.15
664 0.15
665 0.14
666 0.19
667 0.19
668 0.2
669 0.27
670 0.26
671 0.25
672 0.25
673 0.24
674 0.19
675 0.17
676 0.14
677 0.07
678 0.07
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.07
691 0.07