Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PTA8

Protein Details
Accession A0A1D8PTA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-35IHETQPPQNKRDKKRTNIAGRLNKLEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0070822  C:Sin3-type complex  
GO:0042826  F:histone deacetylase binding  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cal:CAALFM_CR06780WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MEESRKNGTIHETQPPQNKRDKKRTNIAGRLNKLELTFKNDRDMFYRNSLHELQNKLATLQQGSNEEFLYKKMNLEEVRDYELTKLRLWEEYQVKRIESEYQEDLNRAKEQHDKMIKLIKEKLYDKLQQQIKHLKEDKFLVNLVNGKSWMNPEDPTNQAFNSVAIAELNANDRRSLRKRELAGRFSVGEAADLSDGGGGSGVGGGSADNFSSVYNNGGYSSAGKRRRIYATRYSSNDELSSGTTSGMPLNNHSSTRQNGNATSGYESNLSDKDYDTLNVLIMENEDGGASLNLTAKNGGVSQHKVQTRGSNKHFVGPQGLKPEELNEDLTLLRNAIVKKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.63
3 0.62
4 0.64
5 0.7
6 0.71
7 0.76
8 0.79
9 0.78
10 0.83
11 0.88
12 0.89
13 0.89
14 0.89
15 0.88
16 0.83
17 0.79
18 0.71
19 0.62
20 0.52
21 0.49
22 0.41
23 0.39
24 0.41
25 0.36
26 0.43
27 0.43
28 0.43
29 0.4
30 0.43
31 0.39
32 0.39
33 0.43
34 0.36
35 0.4
36 0.42
37 0.43
38 0.44
39 0.44
40 0.4
41 0.39
42 0.38
43 0.32
44 0.31
45 0.28
46 0.24
47 0.22
48 0.22
49 0.22
50 0.23
51 0.23
52 0.21
53 0.2
54 0.18
55 0.17
56 0.19
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.22
61 0.23
62 0.27
63 0.31
64 0.29
65 0.33
66 0.31
67 0.31
68 0.27
69 0.31
70 0.28
71 0.24
72 0.24
73 0.2
74 0.22
75 0.23
76 0.28
77 0.31
78 0.35
79 0.39
80 0.39
81 0.38
82 0.36
83 0.36
84 0.34
85 0.28
86 0.28
87 0.25
88 0.26
89 0.27
90 0.27
91 0.27
92 0.24
93 0.24
94 0.2
95 0.19
96 0.24
97 0.26
98 0.33
99 0.38
100 0.36
101 0.37
102 0.44
103 0.43
104 0.4
105 0.44
106 0.38
107 0.39
108 0.4
109 0.42
110 0.41
111 0.44
112 0.41
113 0.43
114 0.45
115 0.41
116 0.46
117 0.49
118 0.45
119 0.49
120 0.54
121 0.47
122 0.45
123 0.45
124 0.42
125 0.34
126 0.33
127 0.25
128 0.2
129 0.22
130 0.2
131 0.17
132 0.15
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.16
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.16
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.1
149 0.08
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.17
161 0.22
162 0.28
163 0.3
164 0.34
165 0.38
166 0.47
167 0.54
168 0.51
169 0.48
170 0.43
171 0.38
172 0.32
173 0.3
174 0.2
175 0.13
176 0.1
177 0.08
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.02
186 0.02
187 0.03
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.1
207 0.14
208 0.21
209 0.26
210 0.3
211 0.32
212 0.36
213 0.44
214 0.47
215 0.49
216 0.52
217 0.55
218 0.58
219 0.59
220 0.59
221 0.52
222 0.49
223 0.42
224 0.33
225 0.25
226 0.19
227 0.17
228 0.12
229 0.12
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.13
234 0.12
235 0.13
236 0.18
237 0.2
238 0.21
239 0.22
240 0.25
241 0.26
242 0.31
243 0.32
244 0.3
245 0.29
246 0.31
247 0.31
248 0.28
249 0.28
250 0.23
251 0.2
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.14
286 0.16
287 0.21
288 0.26
289 0.33
290 0.36
291 0.37
292 0.39
293 0.46
294 0.5
295 0.55
296 0.56
297 0.58
298 0.57
299 0.61
300 0.61
301 0.54
302 0.54
303 0.48
304 0.48
305 0.47
306 0.47
307 0.41
308 0.38
309 0.39
310 0.34
311 0.31
312 0.28
313 0.2
314 0.2
315 0.2
316 0.21
317 0.19
318 0.15
319 0.14
320 0.16