Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CXM6

Protein Details
Accession B0CXM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-47RAPVALKKTRIVRRRGRAKDAVESEHydrophilic
153-180TNFPNKQTTRSRKSSPRQRRSSSSPPTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-41KPRAPVALKKTRIVRRRGRAK
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 5.5, cyto_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
IPR044796  MLN51_plant  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_292769  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MPATVTSPTPARTVNKAALQKPRAPVALKKTRIVRRRGRAKDAVESEDEFQREVGTDSESDDGDLSSLDSETDDSDAELASENVLSNHHPHARALSLNEGARPVDEDKVGHLNGDVAPFFAPSGNWSEMVADENANGPADLPVIEFTEFNGETNFPNKQTTRSRKSSPRQRRSSSSPPTSAPAPTSNGAVAHEDEGDKEEESGDGEEAVSASTLPRRAPGQTARQAYQQRLETDPSYVPTVGGFWGHDDRLMDKDLRSLSGWWRGRWQGRGRGRGFPMRGGVRGGFHGRTAQENGDVSTEHDGDVPPVDRPWTHDGFEEMKQREEQRRLEQNSGHQENPSFRGGNRGGRGGFASVRGGRGGFGRGFAASPTRMRVASPLGRVWFTMKPELMWTKQHDGFLYFESALKPRTGQGPAYRIRLPGSQPSVIRSTQRTRPTTASTSTSDSISSNSSDFDLVVRLPTRAGKRKAAADAPKQKAETPIEEVFTVRLKPAVKPIPVPDSTSAPTDNVPLPIISQLSQESRPQAATDPLPQPSIPSQLEQLSVEPQAYDPERQALTEQAVLRKPSSDSPVEIHEPEPSHSDQRPVLAPLQTVFTPPPPPPPPATQPSPVYGSPYGYALPHGIAVNQHGMPYEVATGRPVYLQPPPPPPMYNPRPLMHSHMPPPGIPFVPGHLRHSSVVSPDLLSQPPSHTPPMSGFIDPSTGTPIFSFPRQTSRIEIRAPTDDAAKLPKPSTRGPSGLRTTAATFEPSRPSETTENGFYPSISSPSDGSSLPSYEITSGLADEASQQQPMMAYGHYHHQQPYYYPEQPQYGYPSYMEMPQYDMYNMDHQAPQGTIYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.46
3 0.52
4 0.56
5 0.61
6 0.63
7 0.63
8 0.62
9 0.61
10 0.58
11 0.54
12 0.56
13 0.56
14 0.6
15 0.58
16 0.6
17 0.64
18 0.69
19 0.73
20 0.75
21 0.75
22 0.76
23 0.82
24 0.85
25 0.84
26 0.83
27 0.8
28 0.8
29 0.75
30 0.69
31 0.61
32 0.55
33 0.48
34 0.45
35 0.4
36 0.3
37 0.25
38 0.21
39 0.18
40 0.17
41 0.15
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.13
49 0.12
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.1
73 0.12
74 0.18
75 0.23
76 0.24
77 0.24
78 0.27
79 0.29
80 0.3
81 0.3
82 0.29
83 0.29
84 0.29
85 0.29
86 0.27
87 0.24
88 0.21
89 0.22
90 0.18
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.18
95 0.24
96 0.23
97 0.2
98 0.18
99 0.17
100 0.18
101 0.2
102 0.16
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.08
109 0.08
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.18
117 0.17
118 0.11
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.15
138 0.14
139 0.15
140 0.18
141 0.2
142 0.16
143 0.21
144 0.22
145 0.28
146 0.38
147 0.48
148 0.53
149 0.58
150 0.65
151 0.7
152 0.8
153 0.84
154 0.84
155 0.85
156 0.86
157 0.86
158 0.85
159 0.83
160 0.83
161 0.82
162 0.78
163 0.71
164 0.63
165 0.59
166 0.53
167 0.46
168 0.38
169 0.31
170 0.27
171 0.24
172 0.23
173 0.21
174 0.19
175 0.19
176 0.17
177 0.15
178 0.12
179 0.13
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.07
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.13
204 0.15
205 0.21
206 0.27
207 0.34
208 0.41
209 0.45
210 0.45
211 0.5
212 0.53
213 0.5
214 0.49
215 0.44
216 0.39
217 0.36
218 0.38
219 0.31
220 0.3
221 0.29
222 0.24
223 0.22
224 0.19
225 0.17
226 0.13
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.08
231 0.09
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.17
239 0.15
240 0.13
241 0.17
242 0.17
243 0.18
244 0.18
245 0.17
246 0.19
247 0.28
248 0.31
249 0.27
250 0.32
251 0.37
252 0.4
253 0.46
254 0.49
255 0.49
256 0.54
257 0.63
258 0.6
259 0.61
260 0.61
261 0.6
262 0.55
263 0.47
264 0.45
265 0.37
266 0.35
267 0.3
268 0.27
269 0.2
270 0.22
271 0.22
272 0.17
273 0.16
274 0.17
275 0.16
276 0.18
277 0.19
278 0.17
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.14
283 0.14
284 0.12
285 0.13
286 0.12
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.11
292 0.11
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.13
298 0.19
299 0.2
300 0.2
301 0.2
302 0.23
303 0.25
304 0.29
305 0.32
306 0.27
307 0.27
308 0.28
309 0.32
310 0.37
311 0.39
312 0.4
313 0.41
314 0.49
315 0.51
316 0.53
317 0.5
318 0.5
319 0.53
320 0.52
321 0.44
322 0.35
323 0.33
324 0.32
325 0.33
326 0.28
327 0.2
328 0.16
329 0.23
330 0.25
331 0.29
332 0.28
333 0.27
334 0.25
335 0.25
336 0.26
337 0.19
338 0.17
339 0.12
340 0.13
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.1
346 0.1
347 0.12
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.11
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.13
362 0.16
363 0.19
364 0.21
365 0.21
366 0.21
367 0.21
368 0.21
369 0.23
370 0.19
371 0.17
372 0.18
373 0.16
374 0.15
375 0.18
376 0.21
377 0.19
378 0.21
379 0.23
380 0.26
381 0.28
382 0.28
383 0.26
384 0.24
385 0.23
386 0.2
387 0.18
388 0.13
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.13
397 0.14
398 0.15
399 0.18
400 0.24
401 0.27
402 0.3
403 0.3
404 0.27
405 0.27
406 0.27
407 0.25
408 0.24
409 0.24
410 0.24
411 0.23
412 0.24
413 0.26
414 0.24
415 0.25
416 0.23
417 0.25
418 0.29
419 0.36
420 0.36
421 0.37
422 0.39
423 0.42
424 0.41
425 0.38
426 0.35
427 0.29
428 0.3
429 0.27
430 0.24
431 0.2
432 0.17
433 0.16
434 0.13
435 0.12
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.07
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.12
449 0.18
450 0.26
451 0.3
452 0.33
453 0.35
454 0.38
455 0.41
456 0.44
457 0.44
458 0.45
459 0.52
460 0.51
461 0.51
462 0.48
463 0.46
464 0.44
465 0.4
466 0.32
467 0.28
468 0.26
469 0.24
470 0.23
471 0.22
472 0.18
473 0.17
474 0.15
475 0.09
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.19
480 0.24
481 0.24
482 0.26
483 0.29
484 0.32
485 0.32
486 0.34
487 0.28
488 0.25
489 0.25
490 0.24
491 0.22
492 0.16
493 0.16
494 0.16
495 0.15
496 0.12
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.09
503 0.09
504 0.1
505 0.12
506 0.13
507 0.14
508 0.16
509 0.16
510 0.16
511 0.15
512 0.15
513 0.16
514 0.16
515 0.2
516 0.2
517 0.2
518 0.21
519 0.2
520 0.21
521 0.19
522 0.24
523 0.19
524 0.17
525 0.18
526 0.18
527 0.19
528 0.18
529 0.17
530 0.13
531 0.13
532 0.12
533 0.1
534 0.09
535 0.11
536 0.12
537 0.12
538 0.11
539 0.14
540 0.14
541 0.15
542 0.15
543 0.14
544 0.14
545 0.17
546 0.18
547 0.19
548 0.21
549 0.22
550 0.22
551 0.22
552 0.22
553 0.21
554 0.24
555 0.21
556 0.2
557 0.21
558 0.25
559 0.26
560 0.26
561 0.23
562 0.22
563 0.21
564 0.2
565 0.22
566 0.2
567 0.22
568 0.22
569 0.25
570 0.22
571 0.23
572 0.24
573 0.23
574 0.24
575 0.21
576 0.2
577 0.18
578 0.19
579 0.17
580 0.16
581 0.15
582 0.14
583 0.16
584 0.16
585 0.24
586 0.24
587 0.27
588 0.3
589 0.35
590 0.39
591 0.42
592 0.46
593 0.43
594 0.42
595 0.42
596 0.42
597 0.36
598 0.35
599 0.3
600 0.26
601 0.21
602 0.2
603 0.18
604 0.14
605 0.14
606 0.1
607 0.1
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.1
613 0.13
614 0.13
615 0.13
616 0.11
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.12
621 0.1
622 0.1
623 0.11
624 0.11
625 0.11
626 0.12
627 0.11
628 0.11
629 0.17
630 0.23
631 0.27
632 0.34
633 0.37
634 0.38
635 0.4
636 0.42
637 0.46
638 0.46
639 0.49
640 0.48
641 0.46
642 0.46
643 0.46
644 0.5
645 0.47
646 0.46
647 0.42
648 0.42
649 0.42
650 0.39
651 0.4
652 0.36
653 0.29
654 0.25
655 0.2
656 0.19
657 0.26
658 0.28
659 0.29
660 0.27
661 0.29
662 0.29
663 0.31
664 0.29
665 0.23
666 0.23
667 0.2
668 0.18
669 0.18
670 0.2
671 0.18
672 0.19
673 0.17
674 0.18
675 0.22
676 0.25
677 0.26
678 0.24
679 0.24
680 0.25
681 0.3
682 0.29
683 0.25
684 0.23
685 0.2
686 0.22
687 0.2
688 0.18
689 0.18
690 0.15
691 0.15
692 0.15
693 0.17
694 0.18
695 0.2
696 0.24
697 0.2
698 0.28
699 0.3
700 0.32
701 0.36
702 0.41
703 0.45
704 0.45
705 0.46
706 0.42
707 0.44
708 0.44
709 0.38
710 0.33
711 0.28
712 0.25
713 0.29
714 0.27
715 0.26
716 0.26
717 0.28
718 0.3
719 0.35
720 0.4
721 0.4
722 0.43
723 0.44
724 0.52
725 0.55
726 0.53
727 0.48
728 0.44
729 0.39
730 0.36
731 0.32
732 0.28
733 0.24
734 0.25
735 0.3
736 0.29
737 0.32
738 0.3
739 0.34
740 0.34
741 0.36
742 0.37
743 0.35
744 0.34
745 0.33
746 0.32
747 0.26
748 0.25
749 0.22
750 0.21
751 0.17
752 0.17
753 0.15
754 0.17
755 0.19
756 0.17
757 0.18
758 0.18
759 0.18
760 0.19
761 0.19
762 0.17
763 0.16
764 0.16
765 0.14
766 0.12
767 0.11
768 0.1
769 0.09
770 0.08
771 0.09
772 0.14
773 0.14
774 0.14
775 0.14
776 0.14
777 0.14
778 0.16
779 0.15
780 0.1
781 0.11
782 0.12
783 0.2
784 0.23
785 0.26
786 0.27
787 0.29
788 0.31
789 0.32
790 0.38
791 0.38
792 0.4
793 0.4
794 0.42
795 0.44
796 0.43
797 0.44
798 0.44
799 0.39
800 0.36
801 0.33
802 0.32
803 0.29
804 0.32
805 0.3
806 0.23
807 0.23
808 0.23
809 0.24
810 0.21
811 0.21
812 0.2
813 0.23
814 0.24
815 0.23
816 0.23
817 0.22
818 0.24
819 0.22