Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D0C4

Protein Details
Accession B0D0C4    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-44LYASSSKSSLKKRKSPDGAGPNISTKKRRKSDSTDDTDCHydrophilic
298-331ALREAKRKAKEDQEKPEKKKKRKDGESEMEFKKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-35KKRKSPDGAGPNISTKKRRK
301-337EAKRKAKEDQEKPEKKKKRKDGESEMEFKKSKKHKKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, mito_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_293037  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MDSTQLYASSSKSSLKKRKSPDGAGPNISTKKRRKSDSTDDTDCEFHVASASLILSIPPTFAANPRIGAEEMLDSMVMRYIPAFQGVVLAHSNLKFQDQNAIIKMDCPFLVCSVSFDATVWSPRVGMKLVGKVNLCSPDHISLLVHRTFNVSIPRHHIPADEWDFEYGPAENDPEYGQGAQENNDEMVADNMTKKQNNDGGGKWVRRITGHRIGNKDGFLEFTVVGLTVANEMLSLLGSIQPDPFSPEHTIRPQSKKEIHSEVEEDVVEEKSELDDGIDDDSDEDTFTMLGKQADQAALREAKRKAKEDQEKPEKKKKRKDGESEMEFKKSKKHKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.57
3 0.65
4 0.7
5 0.79
6 0.82
7 0.82
8 0.82
9 0.82
10 0.79
11 0.75
12 0.69
13 0.66
14 0.64
15 0.61
16 0.6
17 0.59
18 0.62
19 0.65
20 0.7
21 0.71
22 0.74
23 0.8
24 0.81
25 0.81
26 0.77
27 0.71
28 0.66
29 0.58
30 0.48
31 0.39
32 0.28
33 0.19
34 0.14
35 0.12
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.08
47 0.08
48 0.11
49 0.15
50 0.15
51 0.17
52 0.17
53 0.2
54 0.19
55 0.18
56 0.16
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.1
73 0.1
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.11
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.19
85 0.2
86 0.22
87 0.23
88 0.24
89 0.21
90 0.23
91 0.23
92 0.17
93 0.15
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.13
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.13
114 0.13
115 0.19
116 0.2
117 0.23
118 0.23
119 0.22
120 0.24
121 0.27
122 0.24
123 0.19
124 0.2
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.16
129 0.13
130 0.17
131 0.18
132 0.15
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.18
137 0.23
138 0.2
139 0.2
140 0.25
141 0.27
142 0.26
143 0.26
144 0.24
145 0.18
146 0.24
147 0.27
148 0.23
149 0.21
150 0.21
151 0.2
152 0.2
153 0.19
154 0.11
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.08
179 0.11
180 0.13
181 0.13
182 0.17
183 0.2
184 0.24
185 0.26
186 0.24
187 0.3
188 0.35
189 0.35
190 0.33
191 0.31
192 0.28
193 0.27
194 0.31
195 0.3
196 0.34
197 0.39
198 0.42
199 0.44
200 0.47
201 0.47
202 0.44
203 0.36
204 0.27
205 0.22
206 0.18
207 0.15
208 0.11
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.18
234 0.2
235 0.25
236 0.3
237 0.37
238 0.41
239 0.48
240 0.5
241 0.54
242 0.59
243 0.58
244 0.59
245 0.59
246 0.54
247 0.5
248 0.48
249 0.4
250 0.34
251 0.3
252 0.23
253 0.18
254 0.15
255 0.12
256 0.09
257 0.09
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.12
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.19
285 0.25
286 0.26
287 0.32
288 0.35
289 0.41
290 0.47
291 0.51
292 0.52
293 0.57
294 0.66
295 0.69
296 0.75
297 0.78
298 0.82
299 0.86
300 0.89
301 0.89
302 0.89
303 0.9
304 0.9
305 0.9
306 0.9
307 0.92
308 0.92
309 0.92
310 0.9
311 0.88
312 0.81
313 0.77
314 0.68
315 0.59
316 0.57
317 0.57