Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D4C7

Protein Details
Accession B0D4C7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
568-595QAQVRNRRPPPAPPKRRKPPAIPLGRGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
573-588NRRPPPAPPKRRKPPA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cyto 5.5, pero 3, mito 1, plas 1, E.R. 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_317076  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MPYQDSCHISAITMEDHLGIVYLIETAQQFWSELEDILKLPSDNAPTLSLLDSTLRRFISLCATYHEQYLQSPLQLEHACNLLIESELFQFHSERMCEIITEDARNTTDPHSLFLSYHVLYHHGHRRSEYFRLHKRWQPLIPLLMDHILVGIDPDIDDTYVGTAGVRDSMAVTVPVPIEAKLRSLGVKLLYEVSRVQKLSVQDLRIFDDSFLDYLFDLVEETRYMHDETFNYSVIKLIAALNEQFMVAILPTDGSQQPSPISGTSDEPKNRLIRVLMRRLGSSKTFGENMIFMLNRAKRTPEDLCMQLLLLKILYVLFTTKGTSEYFYTNDLCVLVDVFLRELVDLDEESDSLRHTYLRVLHPLLTKTQLRDIPYKRSQILVALESLIRNHCIRDVNPTTKRLVDRCLSGDWCVQLNAQRDKDSGSGSPTSEASTILSPPGQEPASMAAAQYEAGRLRSLKFSKSVENLGVRSEPARQPLRSPLDQARVPTNGSHTSLPGLPSPSSSKPAPNMSKRRTASTTYEDAPHTTRRASHDEDHHSHRHQQASSQPRATSSSTPLKSDEPTSQAQVRNRRPPPAPPKRRKPPAIPLGRGVTMQTIKSSEPSPLSKVFQPISG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.1
6 0.07
7 0.06
8 0.05
9 0.05
10 0.04
11 0.06
12 0.07
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.14
19 0.13
20 0.14
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.16
26 0.13
27 0.13
28 0.16
29 0.19
30 0.19
31 0.2
32 0.21
33 0.2
34 0.21
35 0.21
36 0.17
37 0.14
38 0.17
39 0.18
40 0.19
41 0.23
42 0.21
43 0.21
44 0.21
45 0.22
46 0.27
47 0.28
48 0.27
49 0.28
50 0.34
51 0.34
52 0.35
53 0.35
54 0.27
55 0.24
56 0.29
57 0.24
58 0.2
59 0.21
60 0.19
61 0.24
62 0.25
63 0.25
64 0.2
65 0.21
66 0.19
67 0.17
68 0.17
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.2
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.2
91 0.21
92 0.21
93 0.22
94 0.18
95 0.22
96 0.2
97 0.22
98 0.22
99 0.21
100 0.21
101 0.21
102 0.23
103 0.18
104 0.19
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.25
109 0.31
110 0.31
111 0.33
112 0.34
113 0.4
114 0.42
115 0.49
116 0.51
117 0.52
118 0.56
119 0.63
120 0.68
121 0.68
122 0.71
123 0.71
124 0.66
125 0.63
126 0.58
127 0.54
128 0.48
129 0.43
130 0.36
131 0.29
132 0.25
133 0.17
134 0.12
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.16
177 0.15
178 0.16
179 0.18
180 0.19
181 0.21
182 0.21
183 0.2
184 0.2
185 0.21
186 0.27
187 0.29
188 0.28
189 0.27
190 0.28
191 0.31
192 0.3
193 0.29
194 0.21
195 0.18
196 0.16
197 0.13
198 0.12
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.11
215 0.15
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.15
221 0.13
222 0.12
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.06
240 0.06
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.12
251 0.14
252 0.2
253 0.21
254 0.21
255 0.25
256 0.25
257 0.24
258 0.23
259 0.22
260 0.24
261 0.3
262 0.37
263 0.37
264 0.36
265 0.36
266 0.37
267 0.37
268 0.3
269 0.26
270 0.2
271 0.18
272 0.18
273 0.17
274 0.16
275 0.14
276 0.13
277 0.11
278 0.1
279 0.08
280 0.13
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.16
286 0.21
287 0.23
288 0.2
289 0.22
290 0.21
291 0.21
292 0.19
293 0.19
294 0.16
295 0.14
296 0.1
297 0.07
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.03
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.05
338 0.06
339 0.05
340 0.06
341 0.05
342 0.06
343 0.09
344 0.14
345 0.17
346 0.2
347 0.21
348 0.24
349 0.27
350 0.27
351 0.26
352 0.25
353 0.24
354 0.21
355 0.26
356 0.25
357 0.26
358 0.33
359 0.35
360 0.4
361 0.44
362 0.47
363 0.42
364 0.4
365 0.37
366 0.33
367 0.32
368 0.23
369 0.18
370 0.15
371 0.14
372 0.13
373 0.14
374 0.11
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.11
379 0.14
380 0.14
381 0.23
382 0.29
383 0.36
384 0.4
385 0.42
386 0.41
387 0.42
388 0.45
389 0.38
390 0.36
391 0.3
392 0.28
393 0.29
394 0.3
395 0.27
396 0.26
397 0.25
398 0.21
399 0.2
400 0.17
401 0.16
402 0.18
403 0.24
404 0.28
405 0.29
406 0.29
407 0.28
408 0.3
409 0.31
410 0.28
411 0.22
412 0.19
413 0.19
414 0.18
415 0.19
416 0.17
417 0.17
418 0.15
419 0.14
420 0.11
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.13
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.12
432 0.14
433 0.14
434 0.13
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.1
443 0.1
444 0.12
445 0.2
446 0.23
447 0.24
448 0.28
449 0.3
450 0.35
451 0.38
452 0.39
453 0.36
454 0.37
455 0.35
456 0.32
457 0.3
458 0.25
459 0.22
460 0.24
461 0.22
462 0.25
463 0.31
464 0.29
465 0.31
466 0.4
467 0.46
468 0.43
469 0.46
470 0.45
471 0.47
472 0.48
473 0.47
474 0.42
475 0.37
476 0.36
477 0.32
478 0.3
479 0.26
480 0.27
481 0.25
482 0.21
483 0.22
484 0.22
485 0.23
486 0.21
487 0.2
488 0.18
489 0.2
490 0.24
491 0.25
492 0.27
493 0.28
494 0.29
495 0.32
496 0.41
497 0.48
498 0.53
499 0.6
500 0.62
501 0.7
502 0.68
503 0.69
504 0.64
505 0.6
506 0.57
507 0.53
508 0.53
509 0.45
510 0.47
511 0.41
512 0.39
513 0.37
514 0.35
515 0.31
516 0.27
517 0.29
518 0.31
519 0.37
520 0.4
521 0.44
522 0.48
523 0.55
524 0.59
525 0.62
526 0.62
527 0.59
528 0.6
529 0.59
530 0.57
531 0.48
532 0.48
533 0.51
534 0.54
535 0.58
536 0.56
537 0.5
538 0.46
539 0.49
540 0.47
541 0.42
542 0.4
543 0.42
544 0.39
545 0.41
546 0.41
547 0.4
548 0.39
549 0.39
550 0.37
551 0.31
552 0.33
553 0.36
554 0.39
555 0.43
556 0.47
557 0.54
558 0.59
559 0.64
560 0.66
561 0.69
562 0.66
563 0.71
564 0.75
565 0.76
566 0.78
567 0.78
568 0.84
569 0.88
570 0.94
571 0.93
572 0.91
573 0.9
574 0.9
575 0.89
576 0.83
577 0.78
578 0.73
579 0.65
580 0.56
581 0.46
582 0.42
583 0.34
584 0.31
585 0.27
586 0.24
587 0.23
588 0.26
589 0.26
590 0.24
591 0.26
592 0.29
593 0.32
594 0.34
595 0.37
596 0.39
597 0.45