FuNGI

B0CYH4

Protein Details

Accession

B0CYH4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1070-1089	NASPRKQTNQYSPKKDKASF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 13, cyto 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_311867 -
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MATKHGGRLPGSDGGEENDDERGAEDDSEVHREFGREDFGESEMSSQHTSYSRFGEEDISDLILAFPLATQPTTTEDNPPPSATPSAVSLGKRKADDSSAESIFPSSQASKFPRLNSAAEKTDPPGPVLPADEENPFLDTWRPAAPPPDNINSPIVLSPPSPLQTFFNAKKLPYGVQYETARLVSLGTMSYDDVSIGVVDEIAKLSTNAEAAPLAAKKFLTFDYDGGEGHTDWAAFFAKESACKNPWGELDKEEEALQRNPYGGLGFDEEGNHLSWHGGQVHFRGTLKDVSPKGSKQIAYKVVLERAELGSSDQFARRFGSKNFFRLKLSKAVSNRDGEELLHFLCRPLVLCSGVFRAFFAKENNVFFVKTNEHWNGRALTSETTPGVLCFIDFLDWHNSMEKNSSQTMAKWASRFALGLSNSVPGWKLQLSQIRFEDDISMPFNWSVDTCHLFYLPANLKTGSNMTDGAGSINRYCLRELRHRYDWEEKPTAIQVRLFGAKGLLVENTDTTESPSVILTPSQMKIQYPTHLDPDPAHLIIDLLRSSHSKAPCRLSVETIINLAENGVPKSAFLELLRQGLIELVEPLLDWESPMAMRKLWCNVRKLGGIMAARRAREDAGLARVKGYSEWEAEEVEADDEDGFKQLDSVKQGSSAWWNDEISGCPSSLEETVMYLIDAGFTPQTCPVLRSKLEKIVKSSVKNYIKAYRIDVPMSASAFLVPDILGVLKPGEIFYKSSRRNLRQTDGTETDIMLGDVLITRHPCKLPTDIQKVRASSQFMFVKHLYSPQWKAVDRPELHHLTDVIVLPTTGDRRAADLLSGGDYDGDKGLITNQPELVIPFINAPLHFSEPPSNMQKYFVRENEAVPAFLERTSVLSDDAKIHERQQYLLGAIRDTSVVGKYSNFHEAAIYTLGYTHPETIRLAYMFCMTLDGAKTGMTVLPQVLKDDTRKYQKRPPTWKETEEDRERHVMHGKNETNLKRPSSLGRFIMDDLHSQAEAEGNVWLARIEKKFEIKNRIKVDDDLTAPWLKFLQRSKRWISEENNTLLSGELEQIRKHVEAIYLEHRAELNASPRKQTNQYSPKKDKASFTDLPIEVRQDKFRALSRKFASFPRPDTFLALSEWDIAAARASYAYWYDHEQRKQSISNNWTRFPWDVAMRELCTIKARAGGRHKAVAGEFYDHFNMKHPRTHHT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.28
3	0.25
4	0.22
5	0.16
6	0.15
7	0.14
8	0.14
9	0.13
10	0.11
11	0.11
12	0.1
13	0.13
14	0.16
15	0.22
16	0.21
17	0.21
18	0.21
19	0.22
20	0.23
21	0.22
22	0.25
23	0.2
24	0.21
25	0.22
26	0.21
27	0.22
28	0.21
29	0.2
30	0.15
31	0.17
32	0.16
33	0.14
34	0.16
35	0.19
36	0.22
37	0.23
38	0.26
39	0.26
40	0.25
41	0.26
42	0.27
43	0.24
44	0.24
45	0.22
46	0.18
47	0.16
48	0.15
49	0.14
50	0.1
51	0.09
52	0.06
53	0.05
54	0.06
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.09
59	0.14
60	0.19
61	0.2
62	0.26
63	0.3
64	0.36
65	0.38
66	0.39
67	0.36
68	0.35
69	0.36
70	0.29
71	0.25
72	0.21
73	0.23
74	0.25
75	0.26
76	0.29
77	0.34
78	0.38
79	0.38
80	0.36
81	0.35
82	0.35
83	0.37
84	0.36
85	0.36
86	0.33
87	0.32
88	0.31
89	0.28
90	0.25
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.15
95	0.22
96	0.27
97	0.34
98	0.39
99	0.41
100	0.45
101	0.46
102	0.49
103	0.49
104	0.5
105	0.47
106	0.44
107	0.44
108	0.39
109	0.41
110	0.37
111	0.33
112	0.29
113	0.25
114	0.24
115	0.25
116	0.25
117	0.21
118	0.22
119	0.21
120	0.2
121	0.19
122	0.19
123	0.17
124	0.15
125	0.15
126	0.14
127	0.16
128	0.18
129	0.19
130	0.19
131	0.26
132	0.28
133	0.33
134	0.39
135	0.42
136	0.4
137	0.41
138	0.42
139	0.35
140	0.33
141	0.26
142	0.21
143	0.16
144	0.15
145	0.14
146	0.16
147	0.18
148	0.17
149	0.18
150	0.2
151	0.24
152	0.32
153	0.33
154	0.38
155	0.38
156	0.38
157	0.41
158	0.41
159	0.37
160	0.34
161	0.37
162	0.31
163	0.36
164	0.38
165	0.35
166	0.35
167	0.32
168	0.27
169	0.21
170	0.19
171	0.11
172	0.1
173	0.08
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.06
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.1
200	0.11
201	0.11
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.14
206	0.14
207	0.16
208	0.16
209	0.16
210	0.18
211	0.19
212	0.19
213	0.18
214	0.18
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.09
219	0.08
220	0.1
221	0.1
222	0.08
223	0.09
224	0.1
225	0.11
226	0.15
227	0.17
228	0.22
229	0.23
230	0.26
231	0.27
232	0.28
233	0.32
234	0.33
235	0.33
236	0.28
237	0.33
238	0.31
239	0.31
240	0.28
241	0.25
242	0.25
243	0.25
244	0.25
245	0.19
246	0.18
247	0.18
248	0.17
249	0.15
250	0.11
251	0.11
252	0.12
253	0.11
254	0.11
255	0.12
256	0.12
257	0.13
258	0.13
259	0.11
260	0.09
261	0.09
262	0.08
263	0.11
264	0.13
265	0.13
266	0.14
267	0.16
268	0.18
269	0.2
270	0.2
271	0.19
272	0.19
273	0.22
274	0.22
275	0.28
276	0.26
277	0.29
278	0.33
279	0.33
280	0.36
281	0.37
282	0.37
283	0.34
284	0.41
285	0.42
286	0.4
287	0.43
288	0.41
289	0.4
290	0.38
291	0.34
292	0.28
293	0.23
294	0.21
295	0.17
296	0.15
297	0.11
298	0.12
299	0.14
300	0.14
301	0.14
302	0.14
303	0.17
304	0.18
305	0.21
306	0.23
307	0.31
308	0.33
309	0.41
310	0.46
311	0.46
312	0.47
313	0.48
314	0.48
315	0.47
316	0.45
317	0.43
318	0.41
319	0.46
320	0.46
321	0.45
322	0.43
323	0.36
324	0.34
325	0.28
326	0.25
327	0.19
328	0.15
329	0.14
330	0.12
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.1
336	0.12
337	0.11
338	0.12
339	0.13
340	0.17
341	0.18
342	0.17
343	0.15
344	0.15
345	0.15
346	0.17
347	0.18
348	0.2
349	0.22
350	0.24
351	0.26
352	0.25
353	0.24
354	0.22
355	0.23
356	0.21
357	0.19
358	0.25
359	0.27
360	0.28
361	0.28
362	0.3
363	0.28
364	0.25
365	0.26
366	0.2
367	0.17
368	0.16
369	0.17
370	0.14
371	0.13
372	0.13
373	0.11
374	0.1
375	0.08
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.08
382	0.12
383	0.13
384	0.13
385	0.16
386	0.16
387	0.16
388	0.19
389	0.18
390	0.17
391	0.17
392	0.18
393	0.16
394	0.17
395	0.22
396	0.24
397	0.25
398	0.23
399	0.23
400	0.22
401	0.22
402	0.21
403	0.16
404	0.17
405	0.15
406	0.15
407	0.15
408	0.15
409	0.14
410	0.14
411	0.14
412	0.08
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.13
417	0.2
418	0.21
419	0.25
420	0.27
421	0.27
422	0.27
423	0.26
424	0.25
425	0.19
426	0.19
427	0.16
428	0.15
429	0.13
430	0.13
431	0.12
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.1
436	0.12
437	0.12
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.19
443	0.21
444	0.19
445	0.2
446	0.2
447	0.2
448	0.21
449	0.22
450	0.16
451	0.12
452	0.11
453	0.1
454	0.1
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.09
459	0.08
460	0.11
461	0.12
462	0.13
463	0.13
464	0.15
465	0.2
466	0.29
467	0.36
468	0.41
469	0.46
470	0.47
471	0.52
472	0.58
473	0.58
474	0.55
475	0.51
476	0.43
477	0.37
478	0.39
479	0.36
480	0.28
481	0.24
482	0.18
483	0.17
484	0.18
485	0.17
486	0.13
487	0.11
488	0.1
489	0.1
490	0.09
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.08
499	0.08
500	0.08
501	0.08
502	0.08
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.08
508	0.09
509	0.1
510	0.11
511	0.11
512	0.14
513	0.16
514	0.18
515	0.21
516	0.22
517	0.24
518	0.24
519	0.24
520	0.21
521	0.24
522	0.22
523	0.17
524	0.16
525	0.12
526	0.12
527	0.12
528	0.12
529	0.07
530	0.06
531	0.07
532	0.07
533	0.1
534	0.14
535	0.18
536	0.21
537	0.25
538	0.29
539	0.32
540	0.35
541	0.34
542	0.32
543	0.32
544	0.29
545	0.26
546	0.22
547	0.19
548	0.14
549	0.13
550	0.11
551	0.07
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.07
560	0.06
561	0.09
562	0.1
563	0.11
564	0.11
565	0.1
566	0.1
567	0.1
568	0.09
569	0.06
570	0.05
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.04
581	0.05
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.08
586	0.15
587	0.22
588	0.26
589	0.28
590	0.29
591	0.31
592	0.31
593	0.31
594	0.25
595	0.22
596	0.2
597	0.18
598	0.23
599	0.22
600	0.21
601	0.21
602	0.21
603	0.16
604	0.15
605	0.16
606	0.1
607	0.14
608	0.16
609	0.16
610	0.16
611	0.16
612	0.15
613	0.14
614	0.15
615	0.11
616	0.09
617	0.1
618	0.1
619	0.1
620	0.1
621	0.1
622	0.08
623	0.06
624	0.05
625	0.05
626	0.04
627	0.04
628	0.04
629	0.05
630	0.04
631	0.04
632	0.05
633	0.06
634	0.08
635	0.1
636	0.12
637	0.11
638	0.12
639	0.13
640	0.13
641	0.16
642	0.16
643	0.14
644	0.15
645	0.14
646	0.14
647	0.14
648	0.15
649	0.13
650	0.13
651	0.11
652	0.09
653	0.09
654	0.1
655	0.1
656	0.09
657	0.06
658	0.06
659	0.07
660	0.06
661	0.06
662	0.05
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.04
667	0.04
668	0.04
669	0.05
670	0.06
671	0.08
672	0.08
673	0.09
674	0.11
675	0.16
676	0.19
677	0.23
678	0.25
679	0.33
680	0.37
681	0.38
682	0.4
683	0.43
684	0.46
685	0.44
686	0.44
687	0.45
688	0.44
689	0.45
690	0.44
691	0.43
692	0.41
693	0.4
694	0.41
695	0.37
696	0.34
697	0.32
698	0.29
699	0.24
700	0.22
701	0.21
702	0.18
703	0.11
704	0.09
705	0.09
706	0.08
707	0.06
708	0.05
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.05
718	0.06
719	0.07
720	0.09
721	0.13
722	0.23
723	0.25
724	0.33
725	0.41
726	0.46
727	0.53
728	0.57
729	0.58
730	0.56
731	0.56
732	0.56
733	0.5
734	0.46
735	0.38
736	0.33
737	0.27
738	0.2
739	0.17
740	0.09
741	0.06
742	0.04
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.07
747	0.08
748	0.11
749	0.12
750	0.13
751	0.15
752	0.2
753	0.27
754	0.35
755	0.44
756	0.46
757	0.52
758	0.54
759	0.53
760	0.51
761	0.47
762	0.41
763	0.32
764	0.35
765	0.32
766	0.29
767	0.32
768	0.3
769	0.28
770	0.24
771	0.27
772	0.23
773	0.24
774	0.27
775	0.27
776	0.32
777	0.31
778	0.33
779	0.35
780	0.41
781	0.37
782	0.38
783	0.4
784	0.37
785	0.38
786	0.36
787	0.31
788	0.22
789	0.23
790	0.21
791	0.14
792	0.11
793	0.1
794	0.09
795	0.1
796	0.1
797	0.08
798	0.09
799	0.09
800	0.11
801	0.13
802	0.13
803	0.11
804	0.11
805	0.11
806	0.1
807	0.1
808	0.08
809	0.07
810	0.07
811	0.07
812	0.06
813	0.06
814	0.05
815	0.05
816	0.07
817	0.1
818	0.11
819	0.12
820	0.12
821	0.13
822	0.13
823	0.13
824	0.12
825	0.1
826	0.09
827	0.08
828	0.09
829	0.1
830	0.09
831	0.11
832	0.12
833	0.15
834	0.15
835	0.16
836	0.2
837	0.21
838	0.26
839	0.29
840	0.29
841	0.26
842	0.3
843	0.32
844	0.32
845	0.37
846	0.34
847	0.35
848	0.34
849	0.34
850	0.37
851	0.35
852	0.3
853	0.23
854	0.22
855	0.17
856	0.16
857	0.16
858	0.08
859	0.09
860	0.1
861	0.1
862	0.1
863	0.11
864	0.12
865	0.14
866	0.17
867	0.18
868	0.18
869	0.21
870	0.25
871	0.25
872	0.25
873	0.25
874	0.24
875	0.22
876	0.25
877	0.22
878	0.17
879	0.17
880	0.16
881	0.13
882	0.12
883	0.12
884	0.08
885	0.09
886	0.09
887	0.1
888	0.11
889	0.14
890	0.18
891	0.18
892	0.16
893	0.16
894	0.16
895	0.17
896	0.16
897	0.13
898	0.08
899	0.09
900	0.09
901	0.1
902	0.11
903	0.12
904	0.11
905	0.13
906	0.14
907	0.15
908	0.17
909	0.16
910	0.15
911	0.13
912	0.14
913	0.13
914	0.12
915	0.12
916	0.09
917	0.1
918	0.11
919	0.1
920	0.09
921	0.09
922	0.09
923	0.08
924	0.09
925	0.07
926	0.07
927	0.08
928	0.11
929	0.11
930	0.13
931	0.14
932	0.16
933	0.2
934	0.25
935	0.32
936	0.39
937	0.46
938	0.5
939	0.58
940	0.65
941	0.72
942	0.77
943	0.78
944	0.78
945	0.79
946	0.77
947	0.73
948	0.72
949	0.72
950	0.69
951	0.64
952	0.57
953	0.56
954	0.51
955	0.49
956	0.48
957	0.44
958	0.39
959	0.47
960	0.45
961	0.43
962	0.51
963	0.51
964	0.51
965	0.51
966	0.5
967	0.42
968	0.42
969	0.45
970	0.44
971	0.47
972	0.42
973	0.38
974	0.37
975	0.36
976	0.38
977	0.31
978	0.26
979	0.22
980	0.21
981	0.18
982	0.16
983	0.16
984	0.13
985	0.12
986	0.1
987	0.08
988	0.07
989	0.07
990	0.07
991	0.08
992	0.08
993	0.14
994	0.15
995	0.19
996	0.23
997	0.3
998	0.37
999	0.45
1000	0.54
1001	0.57
1002	0.64
1003	0.67
1004	0.68
1005	0.64
1006	0.59
1007	0.55
1008	0.5
1009	0.43
1010	0.36
1011	0.32
1012	0.3
1013	0.27
1014	0.25
1015	0.23
1016	0.19
1017	0.22
1018	0.3
1019	0.37
1020	0.42
1021	0.5
1022	0.57
1023	0.64
1024	0.68
1025	0.7
1026	0.67
1027	0.66
1028	0.65
1029	0.61
1030	0.55
1031	0.46
1032	0.41
1033	0.33
1034	0.27
1035	0.19
1036	0.15
1037	0.15
1038	0.16
1039	0.16
1040	0.17
1041	0.2
1042	0.19
1043	0.2
1044	0.19
1045	0.18
1046	0.19
1047	0.24
1048	0.29
1049	0.3
1050	0.3
1051	0.3
1052	0.28
1053	0.25
1054	0.24
1055	0.22
1056	0.25
1057	0.29
1058	0.31
1059	0.35
1060	0.39
1061	0.44
1062	0.49
1063	0.53
1064	0.55
1065	0.57
1066	0.66
1067	0.71
1068	0.77
1069	0.8
1070	0.81
1071	0.79
1072	0.75
1073	0.72
1074	0.71
1075	0.64
1076	0.6
1077	0.6
1078	0.53
1079	0.52
1080	0.46
1081	0.44
1082	0.39
1083	0.38
1084	0.38
1085	0.31
1086	0.33
1087	0.33
1088	0.39
1089	0.44
1090	0.43
1091	0.5
1092	0.49
1093	0.54
1094	0.55
1095	0.57
1096	0.59
1097	0.56
1098	0.59
1099	0.54
1100	0.54
1101	0.48
1102	0.5
1103	0.45
1104	0.37
1105	0.32
1106	0.28
1107	0.24
1108	0.21
1109	0.19
1110	0.15
1111	0.13
1112	0.12
1113	0.11
1114	0.09
1115	0.08
1116	0.07
1117	0.07
1118	0.08
1119	0.1
1120	0.12
1121	0.12
1122	0.18
1123	0.27
1124	0.35
1125	0.41
1126	0.45
1127	0.49
1128	0.53
1129	0.56
1130	0.57
1131	0.58
1132	0.59
1133	0.63
1134	0.64
1135	0.62
1136	0.58
1137	0.56
1138	0.52
1139	0.46
1140	0.43
1141	0.39
1142	0.35
1143	0.38
1144	0.41
1145	0.38
1146	0.4
1147	0.37
1148	0.32
1149	0.31
1150	0.29
1151	0.25
1152	0.27
1153	0.28
1154	0.34
1155	0.42
1156	0.5
1157	0.5
1158	0.54
1159	0.54
1160	0.51
1161	0.49
1162	0.45
1163	0.38
1164	0.33
1165	0.29
1166	0.28
1167	0.3
1168	0.28
1169	0.27
1170	0.31
1171	0.37
1172	0.36
1173	0.41

B0CYH4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer