FuNGI

Q5AJS6

Protein Details

Accession

Q5AJS6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
82-107	DPTVPLSFKEKRKREEQKLKDEQERL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
408-408	R
410-412	LKK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034482 Mrd1_RRM3 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0016607 C:nuclear speck GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0003723 F:RNA binding GO:0042134 F:rRNA primary transcript binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0034462 P:small-subunit processome assembly
KEGG	cal:CAALFM_C302020WA -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12565 RRM1_MRD1 cd12568 RRM3_MRD1

Amino Acid Sequences

MSRLIVKGLPKYYTEEKLREFFSKQGDVTDVKLMKKRNGESRKFAFIGYKSADAAERAVKYFNKSFIDTARIEVEFAKTFSDPTVPLSFKEKRKREEQKLKDEQERLLEQELRAQAKKQKTKSTSEIDDEIASNPKLREYMEVMKPSHQVKSWANDTIADGSGGPSVQDLENALNGNNESPVDKSNIEVVNTVEDASDDEYNDFKELSNKHGENEDEEEEEEMMSLGDLPTNEENKDKNESGENLAANENISDLEWLKSRSTRIKENGEVPEIVPEVKEVNEVTEATQQSDNEPEMTPEEQIAHKIEETGRLFIRNISYEASEEDFRSLFSQYGALEEVHIAIDTRTGKSKGFLYVQFLKKEDATRAYRSLDKQIFQGRLLHILPADKKKDHRLDEFDLKNLPLKKQRELKKKAQAAKTQFSWNSLYMNSDAVLESVASKLGVTKSQLIDPENSSSAVKQALAEAHVIGDVRKYFEDRGVDLTSFDKKERDDKIILVKNFPFGTTIDEIGELFSAYGQLKRMLMPPAGTIAIIEFRDAPSARAAFSKLAYKRFKSSILYLEKGPKDLFTREPTTNEVATIPEQQQNEHAVEAKISANEILGESKEDDEIESVQGPTVAVFVKNLNFATTVQALSDLFKPLPGFVVATVKTKPDPKNSGKTLSMGFGFVEFRTKEQANVAISTLDGHVLDGHKLQLKLSHKQGTGTSASSIKKSGKSSKIIIKNLPFEATRKDLLELFGAFGQLKSVRVPKKFDQSARGFAFVEFNLMKEAETAMSQLEGVHLLGRRLVMQYAEQDAENAEVEIERMTKKVKKQVATQNLAAARLAGKGKIELEEKDEEDFD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.49
3	0.5
4	0.52
5	0.55
6	0.52
7	0.49
8	0.45
9	0.45
10	0.45
11	0.4
12	0.38
13	0.37
14	0.34
15	0.34
16	0.38
17	0.34
18	0.33
19	0.38
20	0.4
21	0.43
22	0.5
23	0.54
24	0.57
25	0.64
26	0.67
27	0.72
28	0.73
29	0.75
30	0.67
31	0.61
32	0.57
33	0.48
34	0.48
35	0.42
36	0.37
37	0.3
38	0.3
39	0.3
40	0.24
41	0.24
42	0.23
43	0.21
44	0.21
45	0.25
46	0.26
47	0.31
48	0.35
49	0.38
50	0.37
51	0.37
52	0.39
53	0.38
54	0.42
55	0.37
56	0.35
57	0.32
58	0.28
59	0.26
60	0.25
61	0.25
62	0.21
63	0.2
64	0.2
65	0.16
66	0.17
67	0.17
68	0.19
69	0.15
70	0.18
71	0.25
72	0.23
73	0.25
74	0.32
75	0.39
76	0.45
77	0.56
78	0.59
79	0.58
80	0.68
81	0.78
82	0.81
83	0.85
84	0.85
85	0.86
86	0.88
87	0.89
88	0.87
89	0.79
90	0.71
91	0.67
92	0.59
93	0.51
94	0.46
95	0.42
96	0.33
97	0.36
98	0.38
99	0.36
100	0.35
101	0.37
102	0.39
103	0.46
104	0.55
105	0.56
106	0.61
107	0.62
108	0.68
109	0.72
110	0.73
111	0.68
112	0.64
113	0.59
114	0.5
115	0.46
116	0.39
117	0.32
118	0.28
119	0.22
120	0.21
121	0.19
122	0.18
123	0.18
124	0.18
125	0.2
126	0.22
127	0.3
128	0.34
129	0.4
130	0.4
131	0.42
132	0.46
133	0.44
134	0.42
135	0.35
136	0.34
137	0.33
138	0.38
139	0.39
140	0.38
141	0.37
142	0.34
143	0.34
144	0.3
145	0.26
146	0.19
147	0.16
148	0.12
149	0.12
150	0.11
151	0.09
152	0.06
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.08
157	0.08
158	0.1
159	0.11
160	0.11
161	0.1
162	0.11
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.09
167	0.1
168	0.11
169	0.13
170	0.13
171	0.14
172	0.19
173	0.21
174	0.21
175	0.2
176	0.19
177	0.18
178	0.19
179	0.18
180	0.11
181	0.09
182	0.09
183	0.11
184	0.11
185	0.09
186	0.09
187	0.1
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.09
192	0.14
193	0.15
194	0.19
195	0.27
196	0.27
197	0.28
198	0.32
199	0.32
200	0.29
201	0.33
202	0.29
203	0.21
204	0.21
205	0.21
206	0.17
207	0.16
208	0.12
209	0.08
210	0.06
211	0.05
212	0.05
213	0.04
214	0.05
215	0.05
216	0.08
217	0.11
218	0.13
219	0.14
220	0.16
221	0.18
222	0.2
223	0.26
224	0.24
225	0.22
226	0.25
227	0.26
228	0.28
229	0.3
230	0.27
231	0.22
232	0.22
233	0.2
234	0.16
235	0.14
236	0.1
237	0.07
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.09
243	0.11
244	0.12
245	0.15
246	0.19
247	0.26
248	0.29
249	0.36
250	0.41
251	0.47
252	0.49
253	0.54
254	0.54
255	0.48
256	0.44
257	0.36
258	0.32
259	0.25
260	0.21
261	0.14
262	0.11
263	0.09
264	0.08
265	0.1
266	0.07
267	0.08
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.15
272	0.15
273	0.16
274	0.18
275	0.17
276	0.16
277	0.18
278	0.17
279	0.13
280	0.13
281	0.12
282	0.13
283	0.13
284	0.12
285	0.1
286	0.12
287	0.1
288	0.12
289	0.13
290	0.11
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.18
295	0.19
296	0.2
297	0.19
298	0.19
299	0.2
300	0.2
301	0.21
302	0.16
303	0.15
304	0.14
305	0.14
306	0.13
307	0.14
308	0.15
309	0.13
310	0.12
311	0.12
312	0.11
313	0.1
314	0.11
315	0.1
316	0.08
317	0.08
318	0.09
319	0.07
320	0.09
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.07
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.04
330	0.07
331	0.08
332	0.09
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.15
337	0.17
338	0.18
339	0.2
340	0.2
341	0.23
342	0.3
343	0.34
344	0.35
345	0.34
346	0.31
347	0.29
348	0.3
349	0.27
350	0.25
351	0.25
352	0.26
353	0.27
354	0.28
355	0.31
356	0.3
357	0.36
358	0.33
359	0.29
360	0.3
361	0.33
362	0.33
363	0.3
364	0.32
365	0.24
366	0.25
367	0.24
368	0.21
369	0.15
370	0.17
371	0.2
372	0.22
373	0.24
374	0.23
375	0.25
376	0.33
377	0.4
378	0.41
379	0.43
380	0.43
381	0.46
382	0.52
383	0.51
384	0.44
385	0.37
386	0.33
387	0.33
388	0.28
389	0.26
390	0.25
391	0.27
392	0.32
393	0.39
394	0.48
395	0.55
396	0.61
397	0.67
398	0.68
399	0.73
400	0.74
401	0.73
402	0.71
403	0.67
404	0.64
405	0.57
406	0.53
407	0.46
408	0.4
409	0.35
410	0.28
411	0.23
412	0.19
413	0.18
414	0.13
415	0.13
416	0.1
417	0.08
418	0.08
419	0.06
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.03
427	0.05
428	0.05
429	0.07
430	0.08
431	0.11
432	0.12
433	0.14
434	0.16
435	0.16
436	0.17
437	0.17
438	0.18
439	0.15
440	0.15
441	0.14
442	0.12
443	0.12
444	0.1
445	0.09
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.06
453	0.07
454	0.07
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.09
462	0.12
463	0.14
464	0.13
465	0.17
466	0.18
467	0.17
468	0.17
469	0.18
470	0.18
471	0.18
472	0.18
473	0.15
474	0.15
475	0.22
476	0.24
477	0.28
478	0.25
479	0.27
480	0.35
481	0.4
482	0.4
483	0.37
484	0.34
485	0.32
486	0.3
487	0.28
488	0.2
489	0.13
490	0.17
491	0.15
492	0.15
493	0.12
494	0.12
495	0.12
496	0.11
497	0.1
498	0.06
499	0.04
500	0.04
501	0.05
502	0.05
503	0.06
504	0.07
505	0.08
506	0.09
507	0.1
508	0.13
509	0.14
510	0.15
511	0.15
512	0.14
513	0.15
514	0.14
515	0.13
516	0.1
517	0.08
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.07
522	0.07
523	0.11
524	0.11
525	0.11
526	0.12
527	0.13
528	0.13
529	0.14
530	0.15
531	0.13
532	0.14
533	0.21
534	0.21
535	0.29
536	0.34
537	0.35
538	0.38
539	0.4
540	0.42
541	0.38
542	0.38
543	0.38
544	0.39
545	0.39
546	0.37
547	0.42
548	0.39
549	0.38
550	0.34
551	0.27
552	0.24
553	0.26
554	0.28
555	0.26
556	0.3
557	0.3
558	0.32
559	0.33
560	0.34
561	0.31
562	0.27
563	0.21
564	0.18
565	0.18
566	0.19
567	0.18
568	0.19
569	0.19
570	0.18
571	0.21
572	0.22
573	0.21
574	0.18
575	0.18
576	0.14
577	0.14
578	0.15
579	0.13
580	0.11
581	0.1
582	0.1
583	0.07
584	0.08
585	0.08
586	0.07
587	0.07
588	0.08
589	0.08
590	0.09
591	0.09
592	0.09
593	0.09
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.09
598	0.09
599	0.08
600	0.09
601	0.08
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.06
606	0.07
607	0.09
608	0.1
609	0.12
610	0.12
611	0.12
612	0.12
613	0.13
614	0.16
615	0.15
616	0.14
617	0.12
618	0.13
619	0.12
620	0.13
621	0.14
622	0.13
623	0.11
624	0.12
625	0.13
626	0.12
627	0.13
628	0.12
629	0.11
630	0.1
631	0.16
632	0.15
633	0.18
634	0.19
635	0.19
636	0.21
637	0.29
638	0.33
639	0.36
640	0.44
641	0.49
642	0.58
643	0.61
644	0.64
645	0.57
646	0.55
647	0.47
648	0.41
649	0.34
650	0.24
651	0.2
652	0.15
653	0.15
654	0.12
655	0.16
656	0.14
657	0.15
658	0.2
659	0.2
660	0.2
661	0.21
662	0.26
663	0.23
664	0.23
665	0.23
666	0.17
667	0.17
668	0.17
669	0.14
670	0.1
671	0.08
672	0.07
673	0.08
674	0.09
675	0.1
676	0.1
677	0.13
678	0.17
679	0.17
680	0.17
681	0.22
682	0.27
683	0.32
684	0.4
685	0.45
686	0.41
687	0.43
688	0.44
689	0.43
690	0.4
691	0.35
692	0.29
693	0.27
694	0.28
695	0.26
696	0.28
697	0.28
698	0.3
699	0.35
700	0.42
701	0.44
702	0.48
703	0.54
704	0.6
705	0.65
706	0.66
707	0.66
708	0.64
709	0.62
710	0.58
711	0.54
712	0.46
713	0.39
714	0.39
715	0.36
716	0.32
717	0.28
718	0.27
719	0.26
720	0.26
721	0.27
722	0.21
723	0.18
724	0.16
725	0.16
726	0.14
727	0.13
728	0.14
729	0.12
730	0.13
731	0.15
732	0.23
733	0.29
734	0.34
735	0.41
736	0.45
737	0.55
738	0.62
739	0.64
740	0.65
741	0.64
742	0.69
743	0.64
744	0.6
745	0.5
746	0.42
747	0.41
748	0.31
749	0.31
750	0.21
751	0.19
752	0.18
753	0.18
754	0.17
755	0.14
756	0.15
757	0.1
758	0.1
759	0.1
760	0.08
761	0.08
762	0.08
763	0.08
764	0.07
765	0.07
766	0.07
767	0.1
768	0.11
769	0.12
770	0.13
771	0.14
772	0.14
773	0.15
774	0.16
775	0.14
776	0.15
777	0.18
778	0.21
779	0.22
780	0.2
781	0.19
782	0.18
783	0.18
784	0.16
785	0.13
786	0.09
787	0.08
788	0.08
789	0.09
790	0.11
791	0.1
792	0.11
793	0.17
794	0.23
795	0.31
796	0.4
797	0.47
798	0.51
799	0.6
800	0.69
801	0.74
802	0.75
803	0.69
804	0.67
805	0.61
806	0.56
807	0.46
808	0.36
809	0.26
810	0.24
811	0.23
812	0.17
813	0.16
814	0.18
815	0.2
816	0.23
817	0.26
818	0.23
819	0.27
820	0.31
821	0.31

Q5AJS6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer