Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CR49

Protein Details
Accession B0CR49    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-232VGSTAPKKKGRPTKRDKAKKARKTLNELEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
208-225PKKKGRPTKRDKAKKARK
Subcellular Location(s) nucl 7, cyto 7, cyto_nucl 7, plas 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_301017  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MSLAPAPTATRGEIVLQPNYFTSSIYVQALRDDINTLTHRYHEAYTNAQCAQPFQLFKSIWCSQGWHWLIFKVFDRRTRDRFLDTTLRLFLERMTTNESPFTQIVALFGLYTFFYSQPKGTSPPLYGVSNIPIPLDQYVSLRSFPETLTTPLLQPFQPSIVFILTKLLNDQVFFIVPRSDLGTLNPRDLPREIFVDESSVHAVGSTAPKKKGRPTKRDKAKKARKTLNELEEWLTQEPPTGSTTAMDEYQSFKQQLMANVDHSAIEKANGLVHERLKEARAVVTMGSGGDWGIERVERAISEMNTSTGSYGVLSLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.26
4 0.26
5 0.26
6 0.29
7 0.26
8 0.2
9 0.19
10 0.16
11 0.18
12 0.2
13 0.2
14 0.17
15 0.18
16 0.19
17 0.17
18 0.16
19 0.15
20 0.13
21 0.17
22 0.19
23 0.2
24 0.2
25 0.21
26 0.23
27 0.23
28 0.25
29 0.25
30 0.26
31 0.3
32 0.33
33 0.35
34 0.34
35 0.33
36 0.31
37 0.27
38 0.28
39 0.26
40 0.24
41 0.22
42 0.28
43 0.27
44 0.28
45 0.34
46 0.32
47 0.29
48 0.29
49 0.3
50 0.23
51 0.33
52 0.35
53 0.29
54 0.28
55 0.28
56 0.28
57 0.28
58 0.31
59 0.3
60 0.32
61 0.37
62 0.44
63 0.49
64 0.54
65 0.58
66 0.57
67 0.53
68 0.5
69 0.5
70 0.5
71 0.45
72 0.42
73 0.37
74 0.34
75 0.29
76 0.27
77 0.22
78 0.18
79 0.17
80 0.16
81 0.22
82 0.22
83 0.22
84 0.24
85 0.24
86 0.22
87 0.21
88 0.2
89 0.13
90 0.12
91 0.12
92 0.1
93 0.1
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.15
107 0.17
108 0.19
109 0.19
110 0.21
111 0.23
112 0.22
113 0.21
114 0.19
115 0.18
116 0.17
117 0.16
118 0.12
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.12
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.1
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.18
170 0.18
171 0.2
172 0.22
173 0.21
174 0.22
175 0.23
176 0.23
177 0.17
178 0.19
179 0.18
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.1
187 0.09
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.14
192 0.18
193 0.21
194 0.25
195 0.29
196 0.33
197 0.41
198 0.51
199 0.55
200 0.61
201 0.67
202 0.73
203 0.81
204 0.89
205 0.91
206 0.92
207 0.92
208 0.91
209 0.91
210 0.9
211 0.86
212 0.85
213 0.83
214 0.78
215 0.69
216 0.62
217 0.55
218 0.47
219 0.42
220 0.34
221 0.26
222 0.19
223 0.18
224 0.16
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.14
236 0.17
237 0.21
238 0.2
239 0.18
240 0.22
241 0.25
242 0.3
243 0.32
244 0.31
245 0.29
246 0.3
247 0.3
248 0.25
249 0.23
250 0.19
251 0.13
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.18
259 0.21
260 0.22
261 0.24
262 0.25
263 0.24
264 0.25
265 0.23
266 0.22
267 0.2
268 0.18
269 0.16
270 0.15
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.08
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.12
286 0.17
287 0.17
288 0.2
289 0.21
290 0.21
291 0.21
292 0.21
293 0.19
294 0.14
295 0.14
296 0.1