FuNGI

B0D4A2

Protein Details

Accession

B0D4A2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-35	MSTSPSRPKGPPTKPKKERERERERERKEKALQQS	Basic
366-385	GGKSRREREREREREREKER	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-30	RPKGPPTKPKKERERERERERKEK
249-254	KKAAGK
290-305	AKPPPKPARAPRAPPP
367-383	GKSRREREREREREREK
413-438	PGKPAGPPTSPRRGRRGSHGGGGGGS

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 12, mito_nucl 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_293575 -
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSTSPSRPKGPPTKPKKERERERERERKEKALQQSIERLKTVVRRLPPNLPEDVFWQSVQPWVTEESVSWKVFYAGKSRKRLSKENIPSRAYIAFKSEEKLAQFSREYDGHLFRDKAGNESYAIVEFAPYQKVPTEKRKPDARNATIEKDEDYISFIDSLNASANAEPPTLEALIASTQQAPQPKTTPLLEALKAEKSANKDKEAILRNHAHYKDQLPGALLARKDDKKKVPPAVQAQKVAAEAAAGNKKAAGKKPQVAPSPAAALNQNQNKPGQVGLPKSVAGPSNLGAKPPPKPARAPRAPPPPSQPKPQNVPITAIQQQPGPSTPQQQPASSDGTTTPTPRRTRPVIGLGSRQFEAALSGVAGGKSRREREREREREREKEREEGAVTPTAAFVPAPGLALMASNIKEAPGKPAGPPTSPRRGRRGSHGGGGGGSGGGGIGRPPSAASDTKAPGIIQRADAPLIVQRDVPVVVGPPVVNPVQIPMGVGPGRGGGGSLKEGTVIGGITAVVGGYPPSI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.91
3	0.92
4	0.92
5	0.93
6	0.93
7	0.94
8	0.93
9	0.94
10	0.94
11	0.92
12	0.91
13	0.86
14	0.85
15	0.82
16	0.8
17	0.79
18	0.78
19	0.74
20	0.69
21	0.73
22	0.71
23	0.67
24	0.58
25	0.49
26	0.44
27	0.47
28	0.49
29	0.45
30	0.45
31	0.49
32	0.54
33	0.62
34	0.62
35	0.59
36	0.56
37	0.51
38	0.45
39	0.4
40	0.4
41	0.33
42	0.28
43	0.25
44	0.2
45	0.23
46	0.23
47	0.19
48	0.16
49	0.16
50	0.17
51	0.16
52	0.16
53	0.19
54	0.24
55	0.24
56	0.22
57	0.2
58	0.21
59	0.24
60	0.26
61	0.3
62	0.34
63	0.42
64	0.51
65	0.56
66	0.61
67	0.65
68	0.72
69	0.71
70	0.72
71	0.75
72	0.76
73	0.79
74	0.74
75	0.68
76	0.61
77	0.58
78	0.48
79	0.38
80	0.32
81	0.27
82	0.26
83	0.27
84	0.27
85	0.25
86	0.25
87	0.28
88	0.25
89	0.26
90	0.26
91	0.26
92	0.27
93	0.25
94	0.27
95	0.26
96	0.29
97	0.28
98	0.31
99	0.31
100	0.27
101	0.33
102	0.3
103	0.29
104	0.27
105	0.25
106	0.21
107	0.22
108	0.21
109	0.15
110	0.15
111	0.11
112	0.09
113	0.09
114	0.1
115	0.11
116	0.1
117	0.11
118	0.13
119	0.18
120	0.24
121	0.34
122	0.44
123	0.48
124	0.56
125	0.65
126	0.67
127	0.73
128	0.77
129	0.71
130	0.7
131	0.68
132	0.65
133	0.58
134	0.53
135	0.44
136	0.35
137	0.3
138	0.21
139	0.18
140	0.13
141	0.11
142	0.11
143	0.1
144	0.09
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.09
155	0.09
156	0.1
157	0.1
158	0.09
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.08
163	0.08
164	0.07
165	0.08
166	0.1
167	0.15
168	0.16
169	0.17
170	0.2
171	0.21
172	0.23
173	0.23
174	0.23
175	0.22
176	0.25
177	0.23
178	0.23
179	0.23
180	0.22
181	0.22
182	0.2
183	0.19
184	0.2
185	0.29
186	0.3
187	0.3
188	0.31
189	0.31
190	0.39
191	0.43
192	0.39
193	0.36
194	0.38
195	0.38
196	0.44
197	0.43
198	0.37
199	0.33
200	0.32
201	0.31
202	0.26
203	0.24
204	0.17
205	0.18
206	0.19
207	0.19
208	0.17
209	0.14
210	0.19
211	0.23
212	0.26
213	0.3
214	0.35
215	0.4
216	0.48
217	0.53
218	0.53
219	0.56
220	0.63
221	0.65
222	0.62
223	0.56
224	0.49
225	0.42
226	0.37
227	0.3
228	0.19
229	0.11
230	0.07
231	0.09
232	0.11
233	0.1
234	0.1
235	0.11
236	0.13
237	0.16
238	0.2
239	0.23
240	0.26
241	0.31
242	0.38
243	0.43
244	0.44
245	0.44
246	0.41
247	0.35
248	0.34
249	0.29
250	0.23
251	0.17
252	0.15
253	0.19
254	0.23
255	0.23
256	0.21
257	0.21
258	0.2
259	0.2
260	0.19
261	0.17
262	0.15
263	0.16
264	0.17
265	0.18
266	0.17
267	0.17
268	0.18
269	0.16
270	0.13
271	0.11
272	0.1
273	0.17
274	0.17
275	0.17
276	0.17
277	0.18
278	0.21
279	0.3
280	0.34
281	0.29
282	0.36
283	0.43
284	0.52
285	0.58
286	0.6
287	0.59
288	0.65
289	0.66
290	0.62
291	0.63
292	0.63
293	0.59
294	0.62
295	0.6
296	0.55
297	0.58
298	0.63
299	0.61
300	0.52
301	0.52
302	0.45
303	0.43
304	0.41
305	0.36
306	0.29
307	0.24
308	0.24
309	0.21
310	0.2
311	0.19
312	0.17
313	0.21
314	0.24
315	0.31
316	0.33
317	0.32
318	0.34
319	0.32
320	0.35
321	0.29
322	0.26
323	0.18
324	0.2
325	0.2
326	0.2
327	0.22
328	0.26
329	0.29
330	0.32
331	0.38
332	0.39
333	0.43
334	0.45
335	0.49
336	0.48
337	0.47
338	0.51
339	0.47
340	0.45
341	0.4
342	0.35
343	0.27
344	0.2
345	0.18
346	0.11
347	0.08
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.08
353	0.07
354	0.12
355	0.17
356	0.24
357	0.29
358	0.36
359	0.44
360	0.54
361	0.65
362	0.7
363	0.74
364	0.78
365	0.78
366	0.81
367	0.8
368	0.79
369	0.71
370	0.68
371	0.61
372	0.54
373	0.5
374	0.42
375	0.38
376	0.31
377	0.28
378	0.21
379	0.19
380	0.15
381	0.13
382	0.11
383	0.08
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.11
398	0.11
399	0.16
400	0.19
401	0.19
402	0.2
403	0.29
404	0.31
405	0.32
406	0.38
407	0.4
408	0.46
409	0.54
410	0.58
411	0.59
412	0.63
413	0.64
414	0.67
415	0.7
416	0.63
417	0.61
418	0.58
419	0.49
420	0.42
421	0.38
422	0.28
423	0.18
424	0.13
425	0.07
426	0.04
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.04
431	0.04
432	0.05
433	0.05
434	0.08
435	0.12
436	0.14
437	0.16
438	0.22
439	0.24
440	0.26
441	0.27
442	0.25
443	0.24
444	0.28
445	0.28
446	0.23
447	0.25
448	0.26
449	0.25
450	0.25
451	0.22
452	0.21
453	0.22
454	0.2
455	0.17
456	0.15
457	0.17
458	0.17
459	0.16
460	0.12
461	0.11
462	0.11
463	0.13
464	0.12
465	0.11
466	0.14
467	0.14
468	0.13
469	0.12
470	0.13
471	0.13
472	0.13
473	0.14
474	0.11
475	0.16
476	0.16
477	0.16
478	0.14
479	0.13
480	0.13
481	0.12
482	0.12
483	0.08
484	0.1
485	0.13
486	0.13
487	0.13
488	0.13
489	0.13
490	0.13
491	0.12
492	0.1
493	0.07
494	0.06
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.04
500	0.04

B0D4A2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer